RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-211	ENST00000567642	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		29	■■■□□ 2.23
PPP4C-211	ENST00000567642	FLT4	P35916	1363 aa		29	■■■□□ 2.23
PPP4C-211	ENST00000567642	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
PPP4C-211	ENST00000567642	INSR	P06213	1382 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PPP4C-211	ENST00000567642	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PPP4C-211	ENST00000567642	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
PPP4C-211	ENST00000567642	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PPP4C-211	ENST00000567642	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
PPP4C-211	ENST00000567642	SLC15A2	Q16348	729 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PPP4C-211	ENST00000567642	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PPP4C-211	ENST00000567642	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PPP4C-211	ENST00000567642	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
PPP4C-211	ENST00000567642	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-211	ENST00000567642	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP4C-211	ENST00000567642	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
PPP4C-211	ENST00000567642	ZBTB7A	O95365	584 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PPP4C-211	ENST00000567642	PAPPA	Q13219	1627 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PPP4C-211	ENST00000567642	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
PPP4C-211	ENST00000567642	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
PPP4C-211	ENST00000567642	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP4C-211	ENST00000567642	PANK3	Q9H999	370 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP4C-211	ENST00000567642	LY75	O60449	1722 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP4C-211	ENST00000567642	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-211	ENST00000567642	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-211	ENST00000567642	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-211	ENST00000567642	ZNF827	Q17R98	1081 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-211	ENST00000567642	POLK	Q9UBT6	870 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-211	ENST00000567642	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-211	ENST00000567642	NSD2	O96028	1365 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-211	ENST00000567642	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP4C-211	ENST00000567642	KCNQ4	P56696	695 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP4C-211	ENST00000567642	MTFR1L	Q9H019	292 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PPP4C-211	ENST00000567642	ITGB4	P16144	1822 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PPP4C-211	ENST00000567642	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PPP4C-211	ENST00000567642	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PPP4C-211	ENST00000567642	PTGER2	P43116	358 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PPP4C-211	ENST00000567642	EYA1	Q99502	592 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PPP4C-211	ENST00000567642	AKT1S1	Q96B36	256 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PPP4C-211	ENST00000567642	CYP27B1	O15528	508 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PPP4C-211	ENST00000567642	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
PPP4C-211	ENST00000567642	NCAPD2	Q15021	1401 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PPP4C-211	ENST00000567642	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-211	ENST00000567642	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-211	ENST00000567642	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-211	ENST00000567642	SPG7	Q9UQ90	795 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-211	ENST00000567642	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-211	ENST00000567642	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-211	ENST00000567642	MORC1	Q86VD1	984 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-211	ENST00000567642	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PPP4C-211	ENST00000567642	C5	P01031	1676 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PPP4C-211	ENST00000567642	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PPP4C-211	ENST00000567642	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-211	ENST00000567642	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-211	ENST00000567642	ARX	Q96QS3	562 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4C-211	ENST00000567642	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PPP4C-211	ENST00000567642	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-211	ENST00000567642	PALLD	Q8WX93	1383 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-211	ENST00000567642	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-211	ENST00000567642	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-211	ENST00000567642	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-211	ENST00000567642	MSH5	O43196	834 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP4C-211	ENST00000567642	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-211	ENST00000567642	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-211	ENST00000567642	SYT17	Q9BSW7	474 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-211	ENST00000567642	PIGB	Q92521	554 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4C-211	ENST00000567642	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4C-211	ENST00000567642	PHKG2	P15735	406 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-211	ENST00000567642	POLD1	P28340	1107 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4C-211	ENST00000567642	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4C-211	ENST00000567642	YY1	P25490	414 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-211	ENST00000567642	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-211	ENST00000567642	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4C-211	ENST00000567642	KLHL34	Q8N239	644 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP4C-211	ENST00000567642	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PPP4C-211	ENST00000567642	C4B	P0C0L5	1744 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PPP4C-211	ENST00000567642	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
PPP4C-211	ENST00000567642	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
PPP4C-211	ENST00000567642	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		28.53	■■■□□ 2.16
PPP4C-211	ENST00000567642	AK7	Q96M32	723 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PPP4C-211	ENST00000567642	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PPP4C-211	ENST00000567642	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
PPP4C-211	ENST00000567642	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		28.51	■■■□□ 2.15
PPP4C-211	ENST00000567642	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		28.51	■■■□□ 2.15
PPP4C-211	ENST00000567642	MAP3K5	Q99683	1374 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PPP4C-211	ENST00000567642	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PPP4C-211	ENST00000567642	SIK1	P57059	783 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PPP4C-211	ENST00000567642	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PPP4C-211	ENST00000567642	MSL1	Q68DK7	614 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PPP4C-211	ENST00000567642	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PPP4C-211	ENST00000567642	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PPP4C-211	ENST00000567642	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
PPP4C-211	ENST00000567642	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
PPP4C-211	ENST00000567642	CHD4	Q14839	1912 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PPP4C-211	ENST00000567642	IL13	P35225	146 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PPP4C-211	ENST00000567642	DCAF5	Q96JK2	942 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PPP4C-211	ENST00000567642	ATG3	Q9NT62	314 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PPP4C-211	ENST00000567642	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	28.46	■■■□□ 2.15
PPP4C-211	ENST00000567642	PHF14	O94880	888 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PPP4C-211	ENST00000567642	ATP6V1A	P38606	617 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PPP4C-211	ENST00000567642	MTHFS	P49914	203 aa		28.46	■■■□□ 2.15

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