RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566353.5

STX4-216, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 696 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-216ENST00000566353 SLC27A3Q5K4L6 730 aa29.46■■■□□ 2.31
STX4-216ENST00000566353 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
STX4-216ENST00000566353 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa29.45■■■□□ 2.31
STX4-216ENST00000566353 NSD2O96028 1365 aa29.45■■■□□ 2.31
STX4-216ENST00000566353 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
STX4-216ENST00000566353 AKT1S1Q96B36 256 aa29.44■■■□□ 2.3
STX4-216ENST00000566353 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
STX4-216ENST00000566353 SYT17Q9BSW7 474 aa29.44■■■□□ 2.3
STX4-216ENST00000566353 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
STX4-216ENST00000566353 CDCA8Q53HL2 280 aa29.42■■■□□ 2.3
STX4-216ENST00000566353 NBPF6Q5VWK0 638 aa29.42■■■□□ 2.3
STX4-216ENST00000566353 NBPF4Q96M43 638 aa29.42■■■□□ 2.3
STX4-216ENST00000566353 ARXQ96QS3 562 aa29.41■■■□□ 2.3
STX4-216ENST00000566353 COL24A1Q17RW2 1714 aa29.4■■■□□ 2.3
STX4-216ENST00000566353 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.4■■■□□ 2.3
STX4-216ENST00000566353 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.39■■■□□ 2.3
STX4-216ENST00000566353 INSRP06213 1382 aa29.39■■■□□ 2.29
STX4-216ENST00000566353 MAP3K5Q99683 1374 aa29.39■■■□□ 2.29
STX4-216ENST00000566353 FLT4P35916 1363 aa29.38■■■□□ 2.29
STX4-216ENST00000566353 KCNQ4P56696 695 aa29.37■■■□□ 2.29
STX4-216ENST00000566353 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa29.37■■■□□ 2.29
STX4-216ENST00000566353 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa29.37■■■□□ 2.29
STX4-216ENST00000566353 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.37■■■□□ 2.29
STX4-216ENST00000566353 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.35■■■□□ 2.29
STX4-216ENST00000566353 SLC16A10Q8TF71 515 aa29.35■■■□□ 2.29
STX4-216ENST00000566353 NSD3Q9BZ95 1437 aa29.34■■■□□ 2.29
STX4-216ENST00000566353 TATP17735 454 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
STX4-216ENST00000566353 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa29.33■■■□□ 2.29
STX4-216ENST00000566353 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa29.32■■■□□ 2.28
STX4-216ENST00000566353 CARD14Q9BXL6 1004 aa29.32■■■□□ 2.28
STX4-216ENST00000566353 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
STX4-216ENST00000566353 UTRNP46939 3433 aa29.31■■■□□ 2.28
STX4-216ENST00000566353 CHD4Q14839 1912 aa29.3■■■□□ 2.28
STX4-216ENST00000566353 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa29.3■■■□□ 2.28
STX4-216ENST00000566353 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.3■■■□□ 2.28
STX4-216ENST00000566353 PKD1L3Q7Z443 1732 aa29.3■■■□□ 2.28
STX4-216ENST00000566353 C5P01031 1676 aa29.29■■■□□ 2.28
STX4-216ENST00000566353 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa29.28■■■□□ 2.28
STX4-216ENST00000566353 POLD1P28340 1107 aa29.28■■■□□ 2.28
STX4-216ENST00000566353 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.27■■■□□ 2.28
STX4-216ENST00000566353 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.27■■■□□ 2.28
STX4-216ENST00000566353 NCAPD2Q15021 1401 aa29.25■■■□□ 2.27
STX4-216ENST00000566353 ITGB4P16144 1822 aa29.24■■■□□ 2.27
STX4-216ENST00000566353 KLHL34Q8N239 644 aa29.24■■■□□ 2.27
STX4-216ENST00000566353 TAF1LQ8IZX4 1826 aa29.24■■■□□ 2.27
STX4-216ENST00000566353 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
STX4-216ENST00000566353 CYP27B1O15528 508 aa29.21■■■□□ 2.27
STX4-216ENST00000566353 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
STX4-216ENST00000566353 PALLDQ8WX93 1383 aa29.21■■■□□ 2.27
STX4-216ENST00000566353 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
STX4-216ENST00000566353 MSH5O43196 834 aa29.18■■■□□ 2.26
STX4-216ENST00000566353 GPR162Q16538 588 aa29.18■■■□□ 2.26
STX4-216ENST00000566353 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa29.18■■■□□ 2.26
STX4-216ENST00000566353 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
STX4-216ENST00000566353 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.18■■■□□ 2.26
STX4-216ENST00000566353 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.16■■■□□ 2.26
STX4-216ENST00000566353 C4BP0C0L5 1744 aa29.15■■■□□ 2.26
STX4-216ENST00000566353 NLGN2Q8NFZ4 835 aa29.14■■■□□ 2.26
STX4-216ENST00000566353 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
STX4-216ENST00000566353 SPG7Q9UQ90 795 aa29.12■■■□□ 2.25
STX4-216ENST00000566353 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
STX4-216ENST00000566353 MSL1Q68DK7 614 aa29.11■■■□□ 2.25
STX4-216ENST00000566353 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
STX4-216ENST00000566353 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
STX4-216ENST00000566353 EYA1Q99502 592 aa29.11■■■□□ 2.25
STX4-216ENST00000566353 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.11■■■□□ 2.25
STX4-216ENST00000566353 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.1■■■□□ 2.25
STX4-216ENST00000566353 POLKQ9UBT6 870 aa29.1■■■□□ 2.25
STX4-216ENST00000566353 UBR3Q6ZT12 1888 aa29.09■■■□□ 2.25
STX4-216ENST00000566353 FLAD1Q8NFF5 587 aa29.09■■■□□ 2.25
STX4-216ENST00000566353 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
STX4-216ENST00000566353 PIGBQ92521 554 aa29.08■■■□□ 2.25
STX4-216ENST00000566353 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP29.07■■■□□ 2.24
STX4-216ENST00000566353 AK7Q96M32 723 aa29.05■■■□□ 2.24
STX4-216ENST00000566353 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
STX4-216ENST00000566353 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
STX4-216ENST00000566353 PHKG2P15735 406 aa29.02■■■□□ 2.24
STX4-216ENST00000566353 TMOD3Q9NYL9 352 aa29.02■■■□□ 2.24
STX4-216ENST00000566353 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.01■■■□□ 2.23
STX4-216ENST00000566353 AMIGO3Q86WK7 504 aa29.01■■■□□ 2.23
STX4-216ENST00000566353 IFNL2Q8IZJ0 200 aa29.01■■■□□ 2.23
STX4-216ENST00000566353 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa29.01■■■□□ 2.23
STX4-216ENST00000566353 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
STX4-216ENST00000566353 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.99■■■□□ 2.23
STX4-216ENST00000566353 PHF14O94880 888 aa28.99■■■□□ 2.23
STX4-216ENST00000566353 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
STX4-216ENST00000566353 SIK1P57059 783 aa28.99■■■□□ 2.23
STX4-216ENST00000566353 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.98■■■□□ 2.23
STX4-216ENST00000566353 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
STX4-216ENST00000566353 GRIN3BO60391 1043 aa28.97■■■□□ 2.23
STX4-216ENST00000566353 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.97■■■□□ 2.23
STX4-216ENST00000566353 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.97■■■□□ 2.23
STX4-216ENST00000566353 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.96■■■□□ 2.23
STX4-216ENST00000566353 SMIM5Q71RC9 77 aa28.96■■■□□ 2.23
STX4-216ENST00000566353 PANK3Q9H999 370 aa28.96■■■□□ 2.23
STX4-216ENST00000566353 SSFA2P28290 1259 aa28.95■■■□□ 2.22
STX4-216ENST00000566353 ITPK1Q13572 414 aa28.93■■■□□ 2.22
STX4-216ENST00000566353 C1QTNF8P60827 252 aa28.92■■■□□ 2.22
STX4-216ENST00000566353 ATG3Q9NT62 314 aa28.92■■■□□ 2.22
STX4-216ENST00000566353 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.2 ms