RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560650.1

CPEB1-AS1-201, CPEB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1-AS1, Length 2,138 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.8■■□□□ 1.88
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 BACH2Q9BYV9 841 aa26.79■■□□□ 1.88
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SLIT3O75094 1523 aa26.78■■□□□ 1.88
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 USP19O94966 1318 aa26.77■■□□□ 1.88
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.77■■□□□ 1.88
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.77■■□□□ 1.88
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 KIAA0232Q92628 1395 aa26.77■■□□□ 1.88
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.77■■□□□ 1.88
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PLEKHG5O94827 1062 aa26.77■■□□□ 1.88
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.77■■□□□ 1.88
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 RGS3P49796 1198 aa26.75■■□□□ 1.87
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.75■■□□□ 1.87
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NBPF4Q96M43 638 aa26.75■■□□□ 1.87
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 KRT24Q2M2I5 525 aa26.74■■□□□ 1.87
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.73■■□□□ 1.87
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.73■■□□□ 1.87
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.72■■□□□ 1.87
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.72■■□□□ 1.87
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 MSH6P52701 1360 aa26.72■■□□□ 1.87
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 MAP3K5Q99683 1374 aa26.71■■□□□ 1.87
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ALS2Q96Q42 1657 aa26.69■■□□□ 1.86
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ABCC4O15439 1325 aa26.68■■□□□ 1.86
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.67■■□□□ 1.86
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 IL17REQ8NFR9 667 aa26.67■■□□□ 1.86
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 STRCQ7RTU9 1775 aa26.67■■□□□ 1.86
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 LRRC37A3O60309 1634 aa26.66■■□□□ 1.86
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.66■■□□□ 1.86
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.65■■□□□ 1.86
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 MSH5O43196 834 aa26.65■■□□□ 1.86
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 FAM161AQ3B820 660 aa26.65■■□□□ 1.86
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.64■■□□□ 1.86
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.63■■□□□ 1.85
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.62■■□□□ 1.85
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 C8orf34Q49A92 452 aa26.6■■□□□ 1.85
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NCAPD2Q15021 1401 aa26.6■■□□□ 1.85
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PTPRCP08575 1304 aa26.59■■□□□ 1.85
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SLC4A2P04920 1241 aa26.59■■□□□ 1.85
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.59■■□□□ 1.85
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.58■■□□□ 1.85
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.58■■□□□ 1.85
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PXDNQ92626 1479 aa26.56■■□□□ 1.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.56■■□□□ 1.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ERBB3P21860 1342 aa26.56■■□□□ 1.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.56■■□□□ 1.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 BRINP3Q76B58 766 aa26.55■■□□□ 1.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SMC5Q8IY18 1101 aa26.55■■□□□ 1.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 RGS12O14924 1447 aa26.55■■□□□ 1.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 LGR6Q9HBX8 967 aa26.54■■□□□ 1.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 RGPD5Q99666 1765 aa26.54■■□□□ 1.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.54■■□□□ 1.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.54■■□□□ 1.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 STK31Q9BXU1 1019 aa26.52■■□□□ 1.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.52■■□□□ 1.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.51■■□□□ 1.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.51■■□□□ 1.84
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SLAIN2Q9P270 581 aa26.51■■□□□ 1.83
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.51■■□□□ 1.83
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.49■■□□□ 1.83
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 G2E3Q7L622 706 aa26.49■■□□□ 1.83
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TEFQ10587 303 aa26.48■■□□□ 1.83
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.47■■□□□ 1.83
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 COL18A1P39060 1754 aa26.46■■□□□ 1.83
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.45■■□□□ 1.82
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NECTIN2Q92692 538 aa26.45■■□□□ 1.82
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 GCC1Q96CN9 775 aa26.45■■□□□ 1.82
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NUCB1Q02818 461 aa26.44■■□□□ 1.82
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CHRNA2Q15822 529 aa26.44■■□□□ 1.82
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.44■■□□□ 1.82
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.44■■□□□ 1.82
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CPDO75976 1380 aa26.43■■□□□ 1.82
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.43■■□□□ 1.82
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 BTBD11A6QL63 1104 aa26.43■■□□□ 1.82
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.43■■□□□ 1.82
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 FLIIQ13045 1269 aa26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62 ms