RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 NHSQ6T4R5 1651 aa21.31■■□□□ 1
RABGGTA-205ENST00000558534 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.31■■□□□ 1
RABGGTA-205ENST00000558534 CFAP53Q96M91 514 aa21.31■■□□□ 1
RABGGTA-205ENST00000558534 EYA1Q99502 592 aa21.31■■□□□ 1
RABGGTA-205ENST00000558534 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
RABGGTA-205ENST00000558534 SPG7Q9UQ90 795 aa21.31■■□□□ 1
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RABGGTA-205ENST00000558534 APBA3O96018 575 aa21.3■■□□□ 1
RABGGTA-205ENST00000558534 MTHFSP49914 203 aa21.3■■□□□ 1
RABGGTA-205ENST00000558534 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 12e-8■□□□□ 10.7
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RABGGTA-205ENST00000558534 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.25■□□□□ 0.99
RABGGTA-205ENST00000558534 PLSCR1O15162 318 aa21.24■□□□□ 0.99
RABGGTA-205ENST00000558534 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.24■□□□□ 0.99
RABGGTA-205ENST00000558534 DOT1LQ8TEK3 1739 aa21.24■□□□□ 0.99
RABGGTA-205ENST00000558534 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
RABGGTA-205ENST00000558534 IL13P35225 146 aa21.23■□□□□ 0.99
RABGGTA-205ENST00000558534 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
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RABGGTA-205ENST00000558534 RALBP1Q15311 655 aa21.22■□□□□ 0.99
RABGGTA-205ENST00000558534 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
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RABGGTA-205ENST00000558534 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.2■□□□□ 0.98
RABGGTA-205ENST00000558534 PPP2R1AP30153 589 aa21.19■□□□□ 0.98
RABGGTA-205ENST00000558534 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.19■□□□□ 0.98
RABGGTA-205ENST00000558534 NBPF14Q5TI25 921 aa21.18■□□□□ 0.98
RABGGTA-205ENST00000558534 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.18■□□□□ 0.98
RABGGTA-205ENST00000558534 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
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RABGGTA-205ENST00000558534 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
RABGGTA-205ENST00000558534 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
RABGGTA-205ENST00000558534 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.16■□□□□ 0.98
RABGGTA-205ENST00000558534 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.15■□□□□ 0.98
RABGGTA-205ENST00000558534 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
RABGGTA-205ENST00000558534 CYP27B1O15528 508 aa21.14■□□□□ 0.97
RABGGTA-205ENST00000558534 ITGB4P16144 1822 aa21.13■□□□□ 0.97
RABGGTA-205ENST00000558534 KCNQ2O43526 872 aa21.13■□□□□ 0.97
RABGGTA-205ENST00000558534 PHKG2P15735 406 aa21.13■□□□□ 0.97
RABGGTA-205ENST00000558534 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.11■□□□□ 0.97
RABGGTA-205ENST00000558534 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.11■□□□□ 0.97
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RABGGTA-205ENST00000558534 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
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RABGGTA-205ENST00000558534 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.08■□□□□ 0.97
RABGGTA-205ENST00000558534 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.07■□□□□ 0.96
RABGGTA-205ENST00000558534 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.06■□□□□ 0.96
RABGGTA-205ENST00000558534 FCHSD2O94868 740 aa21.06■□□□□ 0.96
RABGGTA-205ENST00000558534 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
RABGGTA-205ENST00000558534 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.96
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RABGGTA-205ENST00000558534 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.06■□□□□ 0.96
RABGGTA-205ENST00000558534 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
RABGGTA-205ENST00000558534 STK32BQ9NY57 414 aa21.04■□□□□ 0.96
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RABGGTA-205ENST00000558534 PALLDQ8WX93 1383 aa21.01■□□□□ 0.95
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RABGGTA-205ENST00000558534 PIGBQ92521 554 aa20.99■□□□□ 0.95
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RABGGTA-205ENST00000558534 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.98■□□□□ 0.95
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RABGGTA-205ENST00000558534 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.97■□□□□ 0.95
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC15A2Q16348 729 aa20.97■□□□□ 0.95
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RABGGTA-205ENST00000558534 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.96■□□□□ 0.95
RABGGTA-205ENST00000558534 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.96■□□□□ 0.95
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RABGGTA-205ENST00000558534 ANP32CO43423 234 aa20.95■□□□□ 0.94
RABGGTA-205ENST00000558534 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.95■□□□□ 0.94
RABGGTA-205ENST00000558534 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
RABGGTA-205ENST00000558534 LRP5O75197 1615 aa20.94■□□□□ 0.94
RABGGTA-205ENST00000558534 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
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