RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556247.1

LRP1-210, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene LRP1, Length 611 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-210ENST00000556247 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP1-210ENST00000556247 DCTN1Q14203 1278 aa22.29■■□□□ 1.16
LRP1-210ENST00000556247 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
LRP1-210ENST00000556247 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.29■■□□□ 1.16
LRP1-210ENST00000556247 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.29■■□□□ 1.16
LRP1-210ENST00000556247 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
LRP1-210ENST00000556247 GNAI1P63096 354 aa22.28■■□□□ 1.16
LRP1-210ENST00000556247 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
LRP1-210ENST00000556247 MAP3K5Q99683 1374 aa22.27■■□□□ 1.16
LRP1-210ENST00000556247 HSPA1LP34931 641 aa22.27■■□□□ 1.16
LRP1-210ENST00000556247 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
LRP1-210ENST00000556247 MCM10Q7L590 875 aa22.27■■□□□ 1.16
LRP1-210ENST00000556247 NEFLP07196 543 aa22.26■■□□□ 1.15
LRP1-210ENST00000556247 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.26■■□□□ 1.15
LRP1-210ENST00000556247 IFT57Q9NWB7 429 aa22.26■■□□□ 1.15
LRP1-210ENST00000556247 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.25■■□□□ 1.15
LRP1-210ENST00000556247 SPG7Q9UQ90 795 aa22.25■■□□□ 1.15
LRP1-210ENST00000556247 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.25■■□□□ 1.15
LRP1-210ENST00000556247 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.25■■□□□ 1.15
LRP1-210ENST00000556247 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
LRP1-210ENST00000556247 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
LRP1-210ENST00000556247 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.24■■□□□ 1.15
LRP1-210ENST00000556247 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.24■■□□□ 1.15
LRP1-210ENST00000556247 CRB1P82279 1406 aa22.23■■□□□ 1.15
LRP1-210ENST00000556247 CFAP44Q96MT7 982 aa22.23■■□□□ 1.15
LRP1-210ENST00000556247 ZNF853P0CG23 659 aa22.22■■□□□ 1.15
LRP1-210ENST00000556247 MEGF6O75095 1541 aa22.21■■□□□ 1.15
LRP1-210ENST00000556247 IL2RBP14784 551 aa22.2■■□□□ 1.14
LRP1-210ENST00000556247 IL17REQ8NFR9 667 aa22.2■■□□□ 1.14
LRP1-210ENST00000556247 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
LRP1-210ENST00000556247 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.19■■□□□ 1.14
LRP1-210ENST00000556247 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
LRP1-210ENST00000556247 NGLY1Q96IV0 654 aa22.18■■□□□ 1.14
LRP1-210ENST00000556247 MBIPQ9NS73 344 aa22.18■■□□□ 1.14
LRP1-210ENST00000556247 USP35Q9P2H5 1018 aa22.18■■□□□ 1.14
LRP1-210ENST00000556247 CHL1O00533 1208 aa22.17■■□□□ 1.14
LRP1-210ENST00000556247 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.17■■□□□ 1.14
LRP1-210ENST00000556247 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
LRP1-210ENST00000556247 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.16■■□□□ 1.14
LRP1-210ENST00000556247 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.16■■□□□ 1.14
LRP1-210ENST00000556247 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.16■■□□□ 1.14
LRP1-210ENST00000556247 C8orf37Q96NL8 207 aa22.16■■□□□ 1.14
LRP1-210ENST00000556247 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
LRP1-210ENST00000556247 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
LRP1-210ENST00000556247 PHKG2P15735 406 aa22.15■■□□□ 1.14
LRP1-210ENST00000556247 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
LRP1-210ENST00000556247 LGR6Q9HBX8 967 aa22.15■■□□□ 1.14
LRP1-210ENST00000556247 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 TEFQ10587 303 aa22.14■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 FKBP8Q14318 412 aa22.14■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.14■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.14■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 SLIT2O94813 1529 aa22.14■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.14■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.13■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 NRAPQ86VF7 1730 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.12■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 LRRC37A3O60309 1634 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 CYP27B1O15528 508 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.11■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 LRP6O75581 1613 aa22.1■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 DCAF5Q96JK2 942 aa22.09■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.08■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.08■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 BCAR3O75815 825 aa22.08■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 ZNF428Q96B54 188 aa22.08■■□□□ 1.13
LRP1-210ENST00000556247 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
LRP1-210ENST00000556247 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.07■■□□□ 1.12
LRP1-210ENST00000556247 DISP2A7MBM2 1401 aa22.06■■□□□ 1.12
LRP1-210ENST00000556247 EXOC5O00471 708 aa22.06■■□□□ 1.12
LRP1-210ENST00000556247 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LRP1-210ENST00000556247 VAMP4O75379 141 aa22.06■■□□□ 1.12
LRP1-210ENST00000556247 VPS72Q15906 364 aa22.06■■□□□ 1.12
LRP1-210ENST00000556247 USP21Q9UK80 565 aa22.06■■□□□ 1.12
LRP1-210ENST00000556247 BTBD11A6QL63 1104 aa22.05■■□□□ 1.12
LRP1-210ENST00000556247 PLIN1O60240 522 aa22.05■■□□□ 1.12
LRP1-210ENST00000556247 TSPYL6Q8N831 410 aa22.05■■□□□ 1.12
LRP1-210ENST00000556247 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.04■■□□□ 1.12
LRP1-210ENST00000556247 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.04■■□□□ 1.12
LRP1-210ENST00000556247 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.04■■□□□ 1.12
LRP1-210ENST00000556247 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
LRP1-210ENST00000556247 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.04■■□□□ 1.12
LRP1-210ENST00000556247 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
LRP1-210ENST00000556247 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
LRP1-210ENST00000556247 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
LRP1-210ENST00000556247 BARGINQ6ZT62 677 aa22.03■■□□□ 1.12
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