RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555690.5

PPP4R4-204, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, human

TSL 3

Gene PPP4R4, Length 680 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R4-204	ENST00000555690	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		34.03	■■■■□ 3.04
PPP4R4-204	ENST00000555690	MYOM1	P52179	1685 aa		34.03	■■■■□ 3.04
PPP4R4-204	ENST00000555690	YY1	P25490	414 aa		34.02	■■■■□ 3.04
PPP4R4-204	ENST00000555690	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		34.02	■■■■□ 3.04
PPP4R4-204	ENST00000555690	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		34.01	■■■■□ 3.03
PPP4R4-204	ENST00000555690	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		34.01	■■■■□ 3.03
PPP4R4-204	ENST00000555690	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	34.01	■■■■□ 3.03
PPP4R4-204	ENST00000555690	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		33.99	■■■■□ 3.03
PPP4R4-204	ENST00000555690	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		33.98	■■■■□ 3.03
PPP4R4-204	ENST00000555690	KCNQ4	P56696	695 aa		33.98	■■■■□ 3.03
PPP4R4-204	ENST00000555690	AKT1S1	Q96B36	256 aa		33.98	■■■■□ 3.03
PPP4R4-204	ENST00000555690	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	33.98	■■■■□ 3.03
PPP4R4-204	ENST00000555690	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		33.98	■■■■□ 3.03
PPP4R4-204	ENST00000555690	INSR	P06213	1382 aa		33.98	■■■■□ 3.03
PPP4R4-204	ENST00000555690	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		33.97	■■■■□ 3.03
PPP4R4-204	ENST00000555690	FLT4	P35916	1363 aa		33.97	■■■■□ 3.03
PPP4R4-204	ENST00000555690	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		33.96	■■■■□ 3.03
PPP4R4-204	ENST00000555690	SYT17	Q9BSW7	474 aa		33.96	■■■■□ 3.03
PPP4R4-204	ENST00000555690	NSD2	O96028	1365 aa		33.96	■■■■□ 3.03
PPP4R4-204	ENST00000555690	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		33.96	■■■■□ 3.03
PPP4R4-204	ENST00000555690	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	33.95	■■■■□ 3.03
PPP4R4-204	ENST00000555690	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		33.94	■■■■□ 3.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		33.94	■■■■□ 3.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		33.93	■■■■□ 3.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	ARX	Q96QS3	562 aa		33.92	■■■■□ 3.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	UTRN	P46939	3433 aa		33.89	■■■■□ 3.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		33.88	■■■■□ 3.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	33.88	■■■■□ 3.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		33.87	■■■■□ 3.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	33.87	■■■■□ 3.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		33.86	■■■■□ 3.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		33.86	■■■■□ 3.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		33.86	■■■■□ 3.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	LY75	O60449	1722 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	CYP27B1	O15528	508 aa		33.82	■■■■□ 3
PPP4R4-204	ENST00000555690	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		33.8	■■■■□ 3
PPP4R4-204	ENST00000555690	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		33.79	■■■■□ 3
PPP4R4-204	ENST00000555690	POLD1	P28340	1107 aa		33.78	■■■■□ 3
PPP4R4-204	ENST00000555690	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		33.78	■■■■□ 3
PPP4R4-204	ENST00000555690	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		33.77	■■■■□ 3
PPP4R4-204	ENST00000555690	MAP3K5	Q99683	1374 aa		33.77	■■■■□ 3
PPP4R4-204	ENST00000555690	POLK	Q9UBT6	870 aa		33.76	■■■□□ 2.99
PPP4R4-204	ENST00000555690	KLHL34	Q8N239	644 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PPP4R4-204	ENST00000555690	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	33.74	■■■□□ 2.99
PPP4R4-204	ENST00000555690	EYA1	Q99502	592 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PPP4R4-204	ENST00000555690	NCAPD2	Q15021	1401 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PPP4R4-204	ENST00000555690	MSH5	O43196	834 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PPP4R4-204	ENST00000555690	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	33.73	■■■□□ 2.99
PPP4R4-204	ENST00000555690	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	33.73	■■■□□ 2.99
PPP4R4-204	ENST00000555690	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	33.73	■■■□□ 2.99
PPP4R4-204	ENST00000555690	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	33.72	■■■□□ 2.99
PPP4R4-204	ENST00000555690	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PPP4R4-204	ENST00000555690	PALLD	Q8WX93	1383 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PPP4R4-204	ENST00000555690	SPG7	Q9UQ90	795 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PPP4R4-204	ENST00000555690	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PPP4R4-204	ENST00000555690	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PPP4R4-204	ENST00000555690	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	33.68	■■■□□ 2.98
PPP4R4-204	ENST00000555690	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	33.67	■■■□□ 2.98
PPP4R4-204	ENST00000555690	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		33.67	■■■□□ 2.98
PPP4R4-204	ENST00000555690	PIGB	Q92521	554 aa		33.66	■■■□□ 2.98
PPP4R4-204	ENST00000555690	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	33.66	■■■□□ 2.98
PPP4R4-204	ENST00000555690	PANK3	Q9H999	370 aa		33.66	■■■□□ 2.98
PPP4R4-204	ENST00000555690	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	33.65	■■■□□ 2.98
PPP4R4-204	ENST00000555690	GPR162	Q16538	588 aa		33.65	■■■□□ 2.98
PPP4R4-204	ENST00000555690	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	33.64	■■■□□ 2.98
PPP4R4-204	ENST00000555690	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	33.64	■■■□□ 2.98	4e-7	■■□□□ 13.5
PPP4R4-204	ENST00000555690	ITGB4	P16144	1822 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PPP4R4-204	ENST00000555690	C5	P01031	1676 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PPP4R4-204	ENST00000555690	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	33.63	■■■□□ 2.97
PPP4R4-204	ENST00000555690	MSL1	Q68DK7	614 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	33.61	■■■□□ 2.97
PPP4R4-204	ENST00000555690	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PPP4R4-204	ENST00000555690	PHKG2	P15735	406 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PPP4R4-204	ENST00000555690	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PPP4R4-204	ENST00000555690	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	33.59	■■■□□ 2.97
PPP4R4-204	ENST00000555690	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PPP4R4-204	ENST00000555690	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PPP4R4-204	ENST00000555690	AK7	Q96M32	723 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PPP4R4-204	ENST00000555690	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PPP4R4-204	ENST00000555690	CHD4	Q14839	1912 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PPP4R4-204	ENST00000555690	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PPP4R4-204	ENST00000555690	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PPP4R4-204	ENST00000555690	C4B	P0C0L5	1744 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PPP4R4-204	ENST00000555690	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PPP4R4-204	ENST00000555690	SIK1	P57059	783 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PPP4R4-204	ENST00000555690	SMIM5	Q71RC9	77 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PPP4R4-204	ENST00000555690	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PPP4R4-204	ENST00000555690	PHF14	O94880	888 aa		33.51	■■■□□ 2.95
PPP4R4-204	ENST00000555690	MORC1	Q86VD1	984 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PPP4R4-204	ENST00000555690	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PPP4R4-204	ENST00000555690	ATG3	Q9NT62	314 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PPP4R4-204	ENST00000555690	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95
PPP4R4-204	ENST00000555690	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PPP4R4-204	ENST00000555690	ATP6V1A	P38606	617 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PPP4R4-204	ENST00000555690	ITPK1	Q13572	414 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PPP4R4-204	ENST00000555690	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	33.45	■■■□□ 2.95
PPP4R4-204	ENST00000555690	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PPP4R4-204	ENST00000555690	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
PPP4R4-204	ENST00000555690	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		33.44	■■■□□ 2.94

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