RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.66■■□□□ 1.86
PRDM4-205ENST00000550376 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.66■■□□□ 1.86
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF428Q96B54 188 aa26.66■■□□□ 1.86
PRDM4-205ENST00000550376 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.66■■□□□ 1.86
PRDM4-205ENST00000550376 NWD1Q149M9 1564 aa26.66■■□□□ 1.86
PRDM4-205ENST00000550376 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
PRDM4-205ENST00000550376 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.65■■□□□ 1.86
PRDM4-205ENST00000550376 IL17REQ8NFR9 667 aa26.64■■□□□ 1.86
PRDM4-205ENST00000550376 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.64■■□□□ 1.86
PRDM4-205ENST00000550376 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.63■■□□□ 1.85
PRDM4-205ENST00000550376 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.63■■□□□ 1.85
PRDM4-205ENST00000550376 NFAT5O94916 1531 aa26.63■■□□□ 1.85
PRDM4-205ENST00000550376 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
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PRDM4-205ENST00000550376 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.62■■□□□ 1.85
PRDM4-205ENST00000550376 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PRDM4-205ENST00000550376 AAMPQ13685 434 aa26.62■■□□□ 1.85
PRDM4-205ENST00000550376 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.62■■□□□ 1.85
PRDM4-205ENST00000550376 LTN1O94822 1766 aa26.62■■□□□ 1.85
PRDM4-205ENST00000550376 C8orf34Q49A92 452 aa26.61■■□□□ 1.85
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PRDM4-205ENST00000550376 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PRDM4-205ENST00000550376 RTL1A6NKG5 1358 aa26.57■■□□□ 1.84
PRDM4-205ENST00000550376 SLC4A2P04920 1241 aa26.57■■□□□ 1.84
PRDM4-205ENST00000550376 FAM161AQ3B820 660 aa26.57■■□□□ 1.84
PRDM4-205ENST00000550376 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.57■■□□□ 1.84
PRDM4-205ENST00000550376 LGR6Q9HBX8 967 aa26.57■■□□□ 1.84
PRDM4-205ENST00000550376 MSH6P52701 1360 aa26.57■■□□□ 1.84
PRDM4-205ENST00000550376 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.57■■□□□ 1.84
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PRDM4-205ENST00000550376 USP54Q70EL1 1684 aa26.55■■□□□ 1.84
PRDM4-205ENST00000550376 G2E3Q7L622 706 aa26.55■■□□□ 1.84
PRDM4-205ENST00000550376 ABCC4O15439 1325 aa26.54■■□□□ 1.84
PRDM4-205ENST00000550376 MAP3K5Q99683 1374 aa26.54■■□□□ 1.84
PRDM4-205ENST00000550376 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.53■■□□□ 1.84
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PRDM4-205ENST00000550376 BCL11AQ9H165 835 aa26.52■■□□□ 1.84
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PRDM4-205ENST00000550376 KIAA0232Q92628 1395 aa26.52■■□□□ 1.84
PRDM4-205ENST00000550376 USP19O94966 1318 aa26.52■■□□□ 1.84
PRDM4-205ENST00000550376 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.52■■□□□ 1.84
PRDM4-205ENST00000550376 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.52■■□□□ 1.84
PRDM4-205ENST00000550376 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PRDM4-205ENST00000550376 CHRNA2Q15822 529 aa26.51■■□□□ 1.83
PRDM4-205ENST00000550376 F6X3S4 739 aa26.5■■□□□ 1.83
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PRDM4-205ENST00000550376 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
PRDM4-205ENST00000550376 SEC24BO95487 1268 aa26.49■■□□□ 1.83
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PRDM4-205ENST00000550376 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM4-205ENST00000550376 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM4-205ENST00000550376 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PRDM4-205ENST00000550376 KCNQ3O43525 872 aa26.47■■□□□ 1.83
PRDM4-205ENST00000550376 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.47■■□□□ 1.83
PRDM4-205ENST00000550376 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.46■■□□□ 1.83
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PRDM4-205ENST00000550376 LNPKQ9C0E8 428 aa26.45■■□□□ 1.82
PRDM4-205ENST00000550376 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.45■■□□□ 1.82
PRDM4-205ENST00000550376 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
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PRDM4-205ENST00000550376 RGS12O14924 1447 aa26.44■■□□□ 1.82
PRDM4-205ENST00000550376 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.44■■□□□ 1.82
PRDM4-205ENST00000550376 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.43■■□□□ 1.82
PRDM4-205ENST00000550376 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PRDM4-205ENST00000550376 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PRDM4-205ENST00000550376 BRINP3Q76B58 766 aa26.43■■□□□ 1.82
PRDM4-205ENST00000550376 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PRDM4-205ENST00000550376 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
PRDM4-205ENST00000550376 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PRDM4-205ENST00000550376 ERBB3P21860 1342 aa26.41■■□□□ 1.82
PRDM4-205ENST00000550376 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
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PRDM4-205ENST00000550376 STK31Q9BXU1 1019 aa26.4■■□□□ 1.82
PRDM4-205ENST00000550376 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.39■■□□□ 1.82
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PRDM4-205ENST00000550376 SLC4A3P48751 1232 aa26.38■■□□□ 1.81
PRDM4-205ENST00000550376 TEFQ10587 303 aa26.38■■□□□ 1.81
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PRDM4-205ENST00000550376 STRCQ7RTU9 1775 aa26.37■■□□□ 1.81
PRDM4-205ENST00000550376 PTPRCP08575 1304 aa26.37■■□□□ 1.81
PRDM4-205ENST00000550376 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PRDM4-205ENST00000550376 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.36■■□□□ 1.81
PRDM4-205ENST00000550376 NUCB1Q02818 461 aa26.36■■□□□ 1.81
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.36■■□□□ 1.81
PRDM4-205ENST00000550376 BTBD11A6QL63 1104 aa26.36■■□□□ 1.81
PRDM4-205ENST00000550376 FLIIQ13045 1269 aa26.36■■□□□ 1.81
PRDM4-205ENST00000550376 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
PRDM4-205ENST00000550376 ALS2Q96Q42 1657 aa26.35■■□□□ 1.81
PRDM4-205ENST00000550376 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
PRDM4-205ENST00000550376 ANXA1P04083 346 aa26.35■■□□□ 1.81
PRDM4-205ENST00000550376 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.35■■□□□ 1.81
PRDM4-205ENST00000550376 CHD1LQ86WJ1 897 aa26.35■■□□□ 1.81
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