RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545825.1

CCDC189-211, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC189, Length 1,046 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-211ENST00000545825 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
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CCDC189-211ENST00000545825 NHSQ6T4R5 1651 aa30.58■■■□□ 2.49
CCDC189-211ENST00000545825 KCNQ2O43526 872 aa30.58■■■□□ 2.49
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CCDC189-211ENST00000545825 ACSBG1Q96GR2 724 aa30.57■■■□□ 2.48
CCDC189-211ENST00000545825 IGSF1Q8N6C5 1336 aa30.56■■■□□ 2.48
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CCDC189-211ENST00000545825 RREB1Q92766 1687 aa30.55■■■□□ 2.48
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CCDC189-211ENST00000545825 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa30.54■■■□□ 2.48
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CCDC189-211ENST00000545825 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
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CCDC189-211ENST00000545825 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa30.52■■■□□ 2.48
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CCDC189-211ENST00000545825 NUP188Q5SRE5 1749 aa30.49■■■□□ 2.47
CCDC189-211ENST00000545825 DOT1LQ8TEK3 1739 aa30.48■■■□□ 2.47
CCDC189-211ENST00000545825 CYP27B1O15528 508 aa30.48■■■□□ 2.47
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CCDC189-211ENST00000545825 BTAF1O14981 1849 aa30.46■■■□□ 2.47
CCDC189-211ENST00000545825 SPG7Q9UQ90 795 aa30.46■■■□□ 2.47
CCDC189-211ENST00000545825 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa30.45■■■□□ 2.47
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CCDC189-211ENST00000545825 PROM2Q8N271 834 aa30.45■■■□□ 2.47
CCDC189-211ENST00000545825 KDRP35968 1356 aa30.42■■■□□ 2.46
CCDC189-211ENST00000545825 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
CCDC189-211ENST00000545825 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
CCDC189-211ENST00000545825 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
CCDC189-211ENST00000545825 SULT6B1Q6IMI4 303 aa30.41■■■□□ 2.46
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CCDC189-211ENST00000545825 TXNRD1Q16881 649 aa30.4■■■□□ 2.46
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CCDC189-211ENST00000545825 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
CCDC189-211ENST00000545825 KAT6BQ8WYB5 2073 aa30.38■■■□□ 2.45
CCDC189-211ENST00000545825 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa30.37■■■□□ 2.45
CCDC189-211ENST00000545825 PPP2R1AP30153 589 aa30.37■■■□□ 2.45
CCDC189-211ENST00000545825 PHKG2P15735 406 aa30.36■■■□□ 2.45
CCDC189-211ENST00000545825 NBPF14Q5TI25 921 aa30.36■■■□□ 2.45
CCDC189-211ENST00000545825 IFNL2Q8IZJ0 200 aa30.36■■■□□ 2.45
CCDC189-211ENST00000545825 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
CCDC189-211ENST00000545825 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
CCDC189-211ENST00000545825 AMOTQ4VCS5 1084 aa30.33■■■□□ 2.45
CCDC189-211ENST00000545825 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
CCDC189-211ENST00000545825 HMOX1P09601 288 aa30.31■■■□□ 2.44
CCDC189-211ENST00000545825 CFAP53Q96M91 514 aa30.3■■■□□ 2.44
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
CCDC189-211ENST00000545825 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa30.29■■■□□ 2.44
CCDC189-211ENST00000545825 LRRC4BQ9NT99 713 aa30.28■■■□□ 2.44
CCDC189-211ENST00000545825 ITGB4P16144 1822 aa30.28■■■□□ 2.44
CCDC189-211ENST00000545825 PAPPAQ13219 1627 aa30.27■■■□□ 2.44
CCDC189-211ENST00000545825 LY75O60449 1722 aa30.27■■■□□ 2.44
CCDC189-211ENST00000545825 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
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CCDC189-211ENST00000545825 SLC27A3Q5K4L6 730 aa30.25■■■□□ 2.43
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CCDC189-211ENST00000545825 C1orf141Q5JVX7 400 aa30.22■■■□□ 2.43
CCDC189-211ENST00000545825 STK32BQ9NY57 414 aa30.22■■■□□ 2.43
CCDC189-211ENST00000545825 KCNQ4P56696 695 aa30.21■■■□□ 2.43
CCDC189-211ENST00000545825 SLC15A2Q16348 729 aa30.21■■■□□ 2.43
CCDC189-211ENST00000545825 TMOD3Q9NYL9 352 aa30.21■■■□□ 2.43
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CCDC189-211ENST00000545825 ERVV-2B6SEH9 535 aa30.19■■■□□ 2.42
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CCDC189-211ENST00000545825 NUDCQ9Y266 331 aa30.18■■■□□ 2.42
CCDC189-211ENST00000545825 LRP5O75197 1615 aa30.18■■■□□ 2.42
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF827Q17R98 1081 aa30.17■■■□□ 2.42
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CCDC189-211ENST00000545825 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
CCDC189-211ENST00000545825 RSPH6AQ9H0K4 717 aa30.14■■■□□ 2.42
CCDC189-211ENST00000545825 ASAP1Q9ULH1 1129 aa30.14■■■□□ 2.42
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CCDC189-211ENST00000545825 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP30.12■■■□□ 2.41
CCDC189-211ENST00000545825 CABP4P57796 275 aa30.11■■■□□ 2.41
CCDC189-211ENST00000545825 ATG3Q9NT62 314 aa30.11■■■□□ 2.41
CCDC189-211ENST00000545825 SCN11AQ9UI33 1791 aa30.1■■■□□ 2.41
CCDC189-211ENST00000545825 PRKAR2BP31323 418 aa30.1■■■□□ 2.41
CCDC189-211ENST00000545825 C5P01031 1676 aa30.08■■■□□ 2.41
CCDC189-211ENST00000545825 PHACTR3Q96KR7 559 aa30.08■■■□□ 2.41
CCDC189-211ENST00000545825 LGR6Q9HBX8 967 aa30.08■■■□□ 2.41
CCDC189-211ENST00000545825 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa30.07■■■□□ 2.4
CCDC189-211ENST00000545825 FCHSD2O94868 740 aa30.07■■■□□ 2.4
CCDC189-211ENST00000545825 SIK1P57059 783 aa30.07■■■□□ 2.4
CCDC189-211ENST00000545825 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa30.07■■■□□ 2.4
CCDC189-211ENST00000545825 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa30.07■■■□□ 2.4
CCDC189-211ENST00000545825 GAS2L2Q8NHY3 880 aa30.06■■■□□ 2.4
CCDC189-211ENST00000545825 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
CCDC189-211ENST00000545825 RNMTO43148 476 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
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