RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545464.5

MACROD1-208, Transcript of MACRO domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MACROD1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MACROD1-208ENST00000545464 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa34.54■■■■□ 3.12
MACROD1-208ENST00000545464 MSH5O43196 834 aa34.53■■■■□ 3.12
MACROD1-208ENST00000545464 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
MACROD1-208ENST00000545464 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa34.52■■■■□ 3.12
MACROD1-208ENST00000545464 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa34.52■■■■□ 3.12
MACROD1-208ENST00000545464 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
MACROD1-208ENST00000545464 C1QTNF8P60827 252 aa34.49■■■■□ 3.11
MACROD1-208ENST00000545464 TESK2Q96S53 571 aa34.49■■■■□ 3.11
MACROD1-208ENST00000545464 DOT1LQ8TEK3 1739 aa34.47■■■■□ 3.11
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MACROD1-208ENST00000545464 NLGN2Q8NFZ4 835 aa34.47■■■■□ 3.11
MACROD1-208ENST00000545464 USHBP1Q8N6Y0 703 aa34.46■■■■□ 3.11
MACROD1-208ENST00000545464 NSD2O96028 1365 aa34.46■■■■□ 3.11
MACROD1-208ENST00000545464 MEGF6O75095 1541 aa34.45■■■■□ 3.11
MACROD1-208ENST00000545464 QSER1Q2KHR3 1735 aa34.44■■■■□ 3.1
MACROD1-208ENST00000545464 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
MACROD1-208ENST00000545464 NBPF6Q5VWK0 638 aa34.44■■■■□ 3.1
MACROD1-208ENST00000545464 NBPF4Q96M43 638 aa34.44■■■■□ 3.1
MACROD1-208ENST00000545464 USP47Q96K76 1375 aa34.43■■■■□ 3.1
MACROD1-208ENST00000545464 RGPD2P0DJD1 1756 aa34.43■■■■□ 3.1
MACROD1-208ENST00000545464 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa34.42■■■■□ 3.1
MACROD1-208ENST00000545464 GGNBP2Q9H3C7 697 aa34.42■■■■□ 3.1
MACROD1-208ENST00000545464 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa34.41■■■■□ 3.1
MACROD1-208ENST00000545464 SLC24A1O60721 1099 aa34.4■■■■□ 3.1
MACROD1-208ENST00000545464 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
MACROD1-208ENST00000545464 MSL1Q68DK7 614 aa34.38■■■■□ 3.09
MACROD1-208ENST00000545464 LY75O60449 1722 aa34.38■■■■□ 3.09
MACROD1-208ENST00000545464 RTL1A6NKG5 1358 aa34.37■■■■□ 3.09
MACROD1-208ENST00000545464 FYB1O15117 783 aa34.37■■■■□ 3.09
MACROD1-208ENST00000545464 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP34.37■■■■□ 3.09
MACROD1-208ENST00000545464 SHANK3Q9BYB0 1731 aa34.37■■■■□ 3.09
MACROD1-208ENST00000545464 TATP17735 454 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
MACROD1-208ENST00000545464 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
MACROD1-208ENST00000545464 CGNL1Q0VF96 1302 aa34.34■■■■□ 3.09
MACROD1-208ENST00000545464 COL24A1Q17RW2 1714 aa34.34■■■■□ 3.09
MACROD1-208ENST00000545464 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP34.32■■■■□ 3.084e-7■■■■■ 28.9
MACROD1-208ENST00000545464 TMF1P82094 1093 aa34.31■■■■□ 3.08
MACROD1-208ENST00000545464 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa34.31■■■■□ 3.08
MACROD1-208ENST00000545464 GRIN3BO60391 1043 aa34.3■■■■□ 3.08
MACROD1-208ENST00000545464 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa34.29■■■■□ 3.08
MACROD1-208ENST00000545464 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa34.28■■■■□ 3.08
MACROD1-208ENST00000545464 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa34.28■■■■□ 3.08
MACROD1-208ENST00000545464 PALLDQ8WX93 1383 aa34.24■■■■□ 3.07
MACROD1-208ENST00000545464 INSRP06213 1382 aa34.23■■■■□ 3.07
MACROD1-208ENST00000545464 FLAD1Q8NFF5 587 aa34.22■■■■□ 3.07
MACROD1-208ENST00000545464 FLT4P35916 1363 aa34.22■■■■□ 3.07
MACROD1-208ENST00000545464 CYP27B1O15528 508 aa34.2■■■■□ 3.07
MACROD1-208ENST00000545464 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
MACROD1-208ENST00000545464 C5P01031 1676 aa34.19■■■■□ 3.06
MACROD1-208ENST00000545464 AK7Q96M32 723 aa34.19■■■■□ 3.06
MACROD1-208ENST00000545464 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
MACROD1-208ENST00000545464 CD2APQ9Y5K6 639 aa34.18■■■■□ 3.06
MACROD1-208ENST00000545464 PHF14O94880 888 aa34.16■■■■□ 3.06
MACROD1-208ENST00000545464 CDCA8Q53HL2 280 aa34.16■■■■□ 3.06
MACROD1-208ENST00000545464 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
MACROD1-208ENST00000545464 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa34.16■■■■□ 3.06
MACROD1-208ENST00000545464 SMIM5Q71RC9 77 aa34.14■■■■□ 3.06
MACROD1-208ENST00000545464 KIF24Q5T7B8 1368 aa34.12■■■■□ 3.05
MACROD1-208ENST00000545464 KIF20BQ96Q89 1820 aa34.12■■■■□ 3.05
MACROD1-208ENST00000545464 PIGBQ92521 554 aa34.12■■■■□ 3.05
MACROD1-208ENST00000545464 WWC3Q9ULE0 1092 aa34.12■■■■□ 3.05
MACROD1-208ENST00000545464 AMIGO3Q86WK7 504 aa34.11■■■■□ 3.05
MACROD1-208ENST00000545464 CARD14Q9BXL6 1004 aa34.11■■■■□ 3.05
MACROD1-208ENST00000545464 ATP10DQ9P241 1426 aa34.11■■■■□ 3.05
MACROD1-208ENST00000545464 SPG7Q9UQ90 795 aa34.09■■■■□ 3.05
MACROD1-208ENST00000545464 TAF1LQ8IZX4 1826 aa34.09■■■■□ 3.05
MACROD1-208ENST00000545464 C4BP0C0L5 1744 aa34.08■■■■□ 3.05
MACROD1-208ENST00000545464 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
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MACROD1-208ENST00000545464 CEP350Q5VT06 3117 aa34.08■■■■□ 3.05
MACROD1-208ENST00000545464 NSD3Q9BZ95 1437 aa34.07■■■■□ 3.04
MACROD1-208ENST00000545464 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
MACROD1-208ENST00000545464 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa34.06■■■■□ 3.04
MACROD1-208ENST00000545464 ITGB4P16144 1822 aa34.04■■■■□ 3.04
MACROD1-208ENST00000545464 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa34.03■■■■□ 3.04
MACROD1-208ENST00000545464 SIK1P57059 783 aa34.03■■■■□ 3.04
MACROD1-208ENST00000545464 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
MACROD1-208ENST00000545464 LINC00116Q8NCU8 138 aa34.03■■■■□ 3.04
MACROD1-208ENST00000545464 TMOD3Q9NYL9 352 aa34.03■■■■□ 3.04
MACROD1-208ENST00000545464 IGSF1Q8N6C5 1336 aa34.03■■■■□ 3.04
MACROD1-208ENST00000545464 SSFA2P28290 1259 aa34■■■■□ 3.03
MACROD1-208ENST00000545464 EYA1Q99502 592 aa34■■■■□ 3.03
MACROD1-208ENST00000545464 ASAP1Q9ULH1 1129 aa34■■■■□ 3.03
MACROD1-208ENST00000545464 PKD1L3Q7Z443 1732 aa33.99■■■■□ 3.03
MACROD1-208ENST00000545464 GNPATO15228 680 aa33.98■■■■□ 3.03
MACROD1-208ENST00000545464 WASHC2AQ641Q2 1341 aa33.98■■■■□ 3.03
MACROD1-208ENST00000545464 ATP6V1AP38606 617 aa33.97■■■■□ 3.03
MACROD1-208ENST00000545464 UBR3Q6ZT12 1888 aa33.96■■■■□ 3.03
MACROD1-208ENST00000545464 ITPK1Q13572 414 aa33.95■■■■□ 3.03
MACROD1-208ENST00000545464 IFNL2Q8IZJ0 200 aa33.95■■■■□ 3.03
MACROD1-208ENST00000545464 POLR3GLQ9BT43 218 aa33.95■■■■□ 3.03
MACROD1-208ENST00000545464 NCAPD2Q15021 1401 aa33.94■■■■□ 3.02
MACROD1-208ENST00000545464 PHKG2P15735 406 aa33.93■■■■□ 3.02
MACROD1-208ENST00000545464 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
MACROD1-208ENST00000545464 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP33.93■■■■□ 3.02
MACROD1-208ENST00000545464 ADCY9O60503 1353 aa33.91■■■■□ 3.02
MACROD1-208ENST00000545464 POLKQ9UBT6 870 aa33.91■■■■□ 3.02
MACROD1-208ENST00000545464 ATG3Q9NT62 314 aa33.9■■■■□ 3.02
MACROD1-208ENST00000545464 MMP10P09238 476 aa33.89■■■■□ 3.02
MACROD1-208ENST00000545464 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
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