RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.02■■□□□ 1.12
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 EYA1Q99502 592 aa22.01■■□□□ 1.11
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22■■□□□ 1.11
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22■■□□□ 1.11
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22■■□□□ 1.11
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ITGB4P16144 1822 aa21.99■■□□□ 1.11
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LY75O60449 1722 aa21.99■■□□□ 1.11
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.97■■□□□ 1.11
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PAPPAQ13219 1627 aa21.95■■□□□ 1.1
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KCNQ2O43526 872 aa21.94■■□□□ 1.1
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.94■■□□□ 1.1
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KDRP35968 1356 aa21.94■■□□□ 1.1
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LRP5O75197 1615 aa21.93■■□□□ 1.1
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MTHFSP49914 203 aa21.93■■□□□ 1.1
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPG7Q9UQ90 795 aa21.93■■□□□ 1.1
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IL13P35225 146 aa21.92■■□□□ 1.1
TTC28-AS1-221ENST00000540665 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CYP27B1O15528 508 aa21.9■■□□□ 1.1
TTC28-AS1-221ENST00000540665 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.89■■□□□ 1.1
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 CASZ1Q86V15 1759 aa21.87■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NBPF14Q5TI25 921 aa21.87■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TXNRD1Q16881 649 aa21.86■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PROM2Q8N271 834 aa21.86■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.86■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.85■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PHKG2P15735 406 aa21.84■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.84■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.84■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.84■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.84■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C5P01031 1676 aa21.84■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-221ENST00000540665 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.82■■□□□ 1.08
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.82■■□□□ 1.08
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PPP2R1AP30153 589 aa21.81■■□□□ 1.08
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.8■■□□□ 1.08
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.8■■□□□ 1.08
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CFAP53Q96M91 514 aa21.8■■□□□ 1.08
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DCAF5Q96JK2 942 aa21.76■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HMOX1P09601 288 aa21.75■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.75■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.75■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STK32BQ9NY57 414 aa21.75■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.75■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PALLDQ8WX93 1383 aa21.74■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC15A2Q16348 729 aa21.74■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.74■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MRC1P22897 1456 aa21.74■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.73■■□□□ 1.07
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.73■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C4BP0C0L5 1744 aa21.72■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PIGBQ92521 554 aa21.72■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.72■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.71■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NUDCQ9Y266 331 aa21.71■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.69■■□□□ 1.06
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AKT1S1Q96B36 256 aa21.69■■□□□ 1.06
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF827Q17R98 1081 aa21.68■■□□□ 1.06
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.66■■□□□ 1.06
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.66■■□□□ 1.06
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.65■■□□□ 1.06
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TJP1Q07157 1748 aa21.64■■□□□ 1.06
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KCNQ4P56696 695 aa21.64■■□□□ 1.05
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CABP4P57796 275 aa21.64■■□□□ 1.05
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