RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 MORC1Q86VD1 984 aa25.73■■□□□ 1.71
TSTA3-211ENST00000529899 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
TSTA3-211ENST00000529899 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
TSTA3-211ENST00000529899 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.73■■□□□ 1.71
TSTA3-211ENST00000529899 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
TSTA3-211ENST00000529899 NCAPD2Q15021 1401 aa25.71■■□□□ 1.71
TSTA3-211ENST00000529899 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
TSTA3-211ENST00000529899 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
TSTA3-211ENST00000529899 EYA1Q99502 592 aa25.69■■□□□ 1.7
TSTA3-211ENST00000529899 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.68■■□□□ 1.7
TSTA3-211ENST00000529899 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
TSTA3-211ENST00000529899 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
TSTA3-211ENST00000529899 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
TSTA3-211ENST00000529899 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.68■■□□□ 1.7
TSTA3-211ENST00000529899 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.66■■□□□ 1.7
TSTA3-211ENST00000529899 PROM2Q8N271 834 aa25.65■■□□□ 1.7
TSTA3-211ENST00000529899 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.65■■□□□ 1.7
TSTA3-211ENST00000529899 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
TSTA3-211ENST00000529899 PLSCR1O15162 318 aa25.62■■□□□ 1.69
TSTA3-211ENST00000529899 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
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TSTA3-211ENST00000529899 TXNRD1Q16881 649 aa25.58■■□□□ 1.69
TSTA3-211ENST00000529899 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
TSTA3-211ENST00000529899 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.58■■□□□ 1.69
TSTA3-211ENST00000529899 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.58■■□□□ 1.68
TSTA3-211ENST00000529899 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.57■■□□□ 1.68
TSTA3-211ENST00000529899 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.57■■□□□ 1.68
TSTA3-211ENST00000529899 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.57■■□□□ 1.68
TSTA3-211ENST00000529899 ITGB4P16144 1822 aa25.56■■□□□ 1.68
TSTA3-211ENST00000529899 MTHFSP49914 203 aa25.55■■□□□ 1.68
TSTA3-211ENST00000529899 PAPPAQ13219 1627 aa25.55■■□□□ 1.68
TSTA3-211ENST00000529899 LRP5O75197 1615 aa25.54■■□□□ 1.68
TSTA3-211ENST00000529899 KCNQ4P56696 695 aa25.53■■□□□ 1.68
TSTA3-211ENST00000529899 LY75O60449 1722 aa25.53■■□□□ 1.68
TSTA3-211ENST00000529899 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.53■■□□□ 1.68
TSTA3-211ENST00000529899 IL13P35225 146 aa25.52■■□□□ 1.68
TSTA3-211ENST00000529899 NBPF14Q5TI25 921 aa25.51■■□□□ 1.67
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TSTA3-211ENST00000529899 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.51■■□□□ 1.67
TSTA3-211ENST00000529899 CASZ1Q86V15 1759 aa25.51■■□□□ 1.67
TSTA3-211ENST00000529899 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
TSTA3-211ENST00000529899 SPG7Q9UQ90 795 aa25.48■■□□□ 1.67
TSTA3-211ENST00000529899 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.47■■□□□ 1.67
TSTA3-211ENST00000529899 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.47■■□□□ 1.67
TSTA3-211ENST00000529899 PHKG2P15735 406 aa25.46■■□□□ 1.67
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF827Q17R98 1081 aa25.45■■□□□ 1.66
TSTA3-211ENST00000529899 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-211ENST00000529899 HMOX1P09601 288 aa25.43■■□□□ 1.66
TSTA3-211ENST00000529899 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
TSTA3-211ENST00000529899 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.66
TSTA3-211ENST00000529899 KDRP35968 1356 aa25.43■■□□□ 1.66
TSTA3-211ENST00000529899 SLC15A2Q16348 729 aa25.41■■□□□ 1.66
TSTA3-211ENST00000529899 STK32BQ9NY57 414 aa25.41■■□□□ 1.66
TSTA3-211ENST00000529899 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
TSTA3-211ENST00000529899 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.4■■□□□ 1.66
TSTA3-211ENST00000529899 PIGBQ92521 554 aa25.4■■□□□ 1.66
TSTA3-211ENST00000529899 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
TSTA3-211ENST00000529899 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.39■■□□□ 1.65
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TSTA3-211ENST00000529899 PALLDQ8WX93 1383 aa25.38■■□□□ 1.65
TSTA3-211ENST00000529899 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TSTA3-211ENST00000529899 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
TSTA3-211ENST00000529899 PPP2R1AP30153 589 aa25.36■■□□□ 1.65
TSTA3-211ENST00000529899 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
TSTA3-211ENST00000529899 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-211ENST00000529899 ZBTB7AO95365 584 aa25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-211ENST00000529899 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-211ENST00000529899 AKT1S1Q96B36 256 aa25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-211ENST00000529899 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.34■■□□□ 1.65
TSTA3-211ENST00000529899 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.34■■□□□ 1.65
TSTA3-211ENST00000529899 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TSTA3-211ENST00000529899 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.33■■□□□ 1.65
TSTA3-211ENST00000529899 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.32■■□□□ 1.64
TSTA3-211ENST00000529899 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.32■■□□□ 1.64
TSTA3-211ENST00000529899 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
TSTA3-211ENST00000529899 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
TSTA3-211ENST00000529899 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.29■■□□□ 1.64
TSTA3-211ENST00000529899 C4BP0C0L5 1744 aa25.29■■□□□ 1.64
TSTA3-211ENST00000529899 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TSTA3-211ENST00000529899 DCAF5Q96JK2 942 aa25.28■■□□□ 1.64
TSTA3-211ENST00000529899 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-211ENST00000529899 SMIM5Q71RC9 77 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-211ENST00000529899 SPON1Q9HCB6 807 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-211ENST00000529899 ATG3Q9NT62 314 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-211ENST00000529899 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.25■■□□□ 1.63
TSTA3-211ENST00000529899 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-211ENST00000529899 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-211ENST00000529899 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-211ENST00000529899 PTGER2P43116 358 aa25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-211ENST00000529899 ITPK1Q13572 414 aa25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-211ENST00000529899 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-211ENST00000529899 LGR6Q9HBX8 967 aa25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-211ENST00000529899 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-211ENST00000529899 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.23■■□□□ 1.63
TSTA3-211ENST00000529899 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.23■■□□□ 1.63
TSTA3-211ENST00000529899 SIK1P57059 783 aa25.23■■□□□ 1.63
TSTA3-211ENST00000529899 CABP4P57796 275 aa25.23■■□□□ 1.63
TSTA3-211ENST00000529899 CFAP53Q96M91 514 aa25.23■■□□□ 1.63
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