RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529893.5

GMDS-AS1-205, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 900 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-205ENST00000529893 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.36■■□□□ 1.33
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-205ENST00000529893 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.34■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.33■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-205ENST00000529893 NSD2O96028 1365 aa23.33■■□□□ 1.33
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 ITGB4P16144 1822 aa23.31■■□□□ 1.32
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.3■■□□□ 1.32
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.29■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-205ENST00000529893 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.28■■□□□ 1.32
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.28■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-205ENST00000529893 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.27■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CHD4Q14839 1912 aa23.26■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-205ENST00000529893 KCNQ4P56696 695 aa23.25■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-205ENST00000529893 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.25■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-205ENST00000529893 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.24■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-205ENST00000529893 C5P01031 1676 aa23.24■■□□□ 1.31
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 SYT17Q9BSW7 474 aa23.23■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-205ENST00000529893 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-205ENST00000529893 NCAPD2Q15021 1401 aa23.23■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-205ENST00000529893 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.22■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-205ENST00000529893 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.22■■□□□ 1.31
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.18■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CYP27B1O15528 508 aa23.18■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-205ENST00000529893 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.18■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-205ENST00000529893 MAP3K5Q99683 1374 aa23.17■■□□□ 1.3
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.96■■□□□ 1.27
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
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GMDS-AS1-205ENST00000529893 SMIM5Q71RC9 77 aa22.94■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-205ENST00000529893 AK7Q96M32 723 aa22.94■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-205ENST00000529893 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ITPK1Q13572 414 aa22.93■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-205ENST00000529893 MORC1Q86VD1 984 aa22.93■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-205ENST00000529893 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.93■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ATG3Q9NT62 314 aa22.92■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-205ENST00000529893 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-205ENST00000529893 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.267e-7■■■■□ 21.7
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