RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529170.5

MKNK1-222, Transcript of MAP kinase interacting serine/threonine kinase 1, human

TSL 4

Gene MKNK1, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKNK1-222	ENST00000529170	CEP350	Q5VT06	3117 aa		11.85	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	LTN1	O94822	1766 aa		11.85	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		11.85	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		11.84	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170		A0A1W2PP64	1363 aa		11.84	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	GRIN3B	O60391	1043 aa		11.84	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	HOXC9	P31274	260 aa		11.84	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		11.84	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	MSL1	Q68DK7	614 aa		11.83	□□□□□ -0.52
MKNK1-222	ENST00000529170	MSH5	O43196	834 aa		11.82	□□□□□ -0.52
MKNK1-222	ENST00000529170	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		11.82	□□□□□ -0.52
MKNK1-222	ENST00000529170	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		11.82	□□□□□ -0.52
MKNK1-222	ENST00000529170	MEGF6	O75095	1541 aa		11.81	□□□□□ -0.52
MKNK1-222	ENST00000529170	LY75	O60449	1722 aa		11.81	□□□□□ -0.52
MKNK1-222	ENST00000529170	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		11.81	□□□□□ -0.52
MKNK1-222	ENST00000529170	NBPF4	Q96M43	638 aa		11.81	□□□□□ -0.52
MKNK1-222	ENST00000529170	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
MKNK1-222	ENST00000529170	ATP10D	Q9P241	1426 aa		11.8	□□□□□ -0.52
MKNK1-222	ENST00000529170	AMPH	P49418	695 aa		11.8	□□□□□ -0.52
MKNK1-222	ENST00000529170	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
MKNK1-222	ENST00000529170	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		11.79	□□□□□ -0.52
MKNK1-222	ENST00000529170	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		11.79	□□□□□ -0.52
MKNK1-222	ENST00000529170	COG3	Q96JB2	828 aa		11.79	□□□□□ -0.52
MKNK1-222	ENST00000529170	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		11.79	□□□□□ -0.52
MKNK1-222	ENST00000529170	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		11.79	□□□□□ -0.52
MKNK1-222	ENST00000529170	USP47	Q96K76	1375 aa		11.79	□□□□□ -0.52
MKNK1-222	ENST00000529170	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MKNK1-222	ENST00000529170	SMIM5	Q71RC9	77 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MKNK1-222	ENST00000529170	TESK2	Q96S53	571 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MKNK1-222	ENST00000529170	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	ADCY9	O60503	1353 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	FYB1	O15117	783 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	CYP27B1	O15528	508 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	HSPA6	P17066	643 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	PALLD	Q8WX93	1383 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	RTL1	A6NKG5	1358 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	KIF3C	O14782	793 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	PIGB	Q92521	554 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	PHF14	O94880	888 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MKNK1-222	ENST00000529170	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	AK7	Q96M32	723 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	C5	P01031	1676 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	INSR	P06213	1382 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	C4B	P0C0L5	1744 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	SSFA2	P28290	1259 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	SIK1	P57059	783 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	ITPK1	Q13572	414 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	FLT4	P35916	1363 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	ADRA2B	P18089	450 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	TONSL	Q96HA7	1378 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	ITGB4	P16144	1822 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	SLC24A1	O60721	1099 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	MMP10	P09238	476 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MKNK1-222	ENST00000529170	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		11.65	□□□□□ -0.55
MKNK1-222	ENST00000529170	NCAPD2	Q15021	1401 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MKNK1-222	ENST00000529170	GNPAT	O15228	680 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MKNK1-222	ENST00000529170	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MKNK1-222	ENST00000529170	ATG3	Q9NT62	314 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MKNK1-222	ENST00000529170	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MKNK1-222	ENST00000529170		A0A0G2JLW4	131 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MKNK1-222	ENST00000529170	ATP6V1A	P38606	617 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MKNK1-222	ENST00000529170	APLP1	P51693	650 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MKNK1-222	ENST00000529170	TMF1	P82094	1093 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MKNK1-222	ENST00000529170	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MKNK1-222	ENST00000529170	EYA1	Q99502	592 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MKNK1-222	ENST00000529170	SPG7	Q9UQ90	795 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MKNK1-222	ENST00000529170	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MKNK1-222	ENST00000529170	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MKNK1-222	ENST00000529170	TOMM70	O94826	608 aa		11.62	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms