RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527137.2

GNPTG-204, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, human

TSL 2 BASIC

Gene GNPTG, Length 386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTG-204	ENST00000527137	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		33.21	■■■□□ 2.91
GNPTG-204	ENST00000527137	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
GNPTG-204	ENST00000527137	RGS12	O14924	1447 aa		33.19	■■■□□ 2.9
GNPTG-204	ENST00000527137	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
GNPTG-204	ENST00000527137	TNS2	Q63HR2	1409 aa		33.19	■■■□□ 2.9
GNPTG-204	ENST00000527137	PRKAR2B	P31323	418 aa		33.18	■■■□□ 2.9
GNPTG-204	ENST00000527137	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
GNPTG-204	ENST00000527137	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		33.17	■■■□□ 2.9
GNPTG-204	ENST00000527137	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
GNPTG-204	ENST00000527137	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		33.15	■■■□□ 2.9
GNPTG-204	ENST00000527137	FCHSD2	O94868	740 aa		33.14	■■■□□ 2.9
GNPTG-204	ENST00000527137	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		33.14	■■■□□ 2.9
GNPTG-204	ENST00000527137	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
GNPTG-204	ENST00000527137	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		33.13	■■■□□ 2.89
GNPTG-204	ENST00000527137	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		33.11	■■■□□ 2.89
GNPTG-204	ENST00000527137	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		33.1	■■■□□ 2.89
GNPTG-204	ENST00000527137	DDB1	Q16531	1140 aa		33.1	■■■□□ 2.89
GNPTG-204	ENST00000527137	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
GNPTG-204	ENST00000527137	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		33.07	■■■□□ 2.88
GNPTG-204	ENST00000527137	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		33.07	■■■□□ 2.88
GNPTG-204	ENST00000527137	EXOC5	O00471	708 aa		33.06	■■■□□ 2.88
GNPTG-204	ENST00000527137	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
GNPTG-204	ENST00000527137	SPG7	Q9UQ90	795 aa		33.06	■■■□□ 2.88
GNPTG-204	ENST00000527137	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		33.05	■■■□□ 2.88
GNPTG-204	ENST00000527137	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
GNPTG-204	ENST00000527137	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		33.03	■■■□□ 2.88
GNPTG-204	ENST00000527137	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		33.03	■■■□□ 2.88
GNPTG-204	ENST00000527137	NEFM	P07197	916 aa		33.03	■■■□□ 2.88
GNPTG-204	ENST00000527137	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		33.03	■■■□□ 2.88
GNPTG-204	ENST00000527137	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
GNPTG-204	ENST00000527137	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	33.03	■■■□□ 2.88
GNPTG-204	ENST00000527137	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		33.03	■■■□□ 2.88
GNPTG-204	ENST00000527137	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		33.02	■■■□□ 2.88
GNPTG-204	ENST00000527137	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
GNPTG-204	ENST00000527137	RUNDC1	Q96C34	613 aa		33.02	■■■□□ 2.88
GNPTG-204	ENST00000527137	PDE3B	Q13370	1112 aa		33.01	■■■□□ 2.87
GNPTG-204	ENST00000527137	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
GNPTG-204	ENST00000527137	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		33.01	■■■□□ 2.87
GNPTG-204	ENST00000527137	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		33.01	■■■□□ 2.87
GNPTG-204	ENST00000527137	CYP27B1	O15528	508 aa		32.99	■■■□□ 2.87
GNPTG-204	ENST00000527137	SBF2	Q86WG5	1849 aa		32.99	■■■□□ 2.87
GNPTG-204	ENST00000527137	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		32.98	■■■□□ 2.87
GNPTG-204	ENST00000527137	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
GNPTG-204	ENST00000527137	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		32.98	■■■□□ 2.87
GNPTG-204	ENST00000527137	FAM182B	Q5T319	152 aa		32.96	■■■□□ 2.87
GNPTG-204	ENST00000527137	ITGB4	P16144	1822 aa		32.95	■■■□□ 2.87
GNPTG-204	ENST00000527137	PHKG2	P15735	406 aa		32.95	■■■□□ 2.87
GNPTG-204	ENST00000527137	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		32.95	■■■□□ 2.87
GNPTG-204	ENST00000527137	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		32.94	■■■□□ 2.86
GNPTG-204	ENST00000527137	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.94	■■■□□ 2.86
GNPTG-204	ENST00000527137	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.93	■■■□□ 2.86
GNPTG-204	ENST00000527137	MAP3K5	Q99683	1374 aa		32.93	■■■□□ 2.86
GNPTG-204	ENST00000527137	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		32.92	■■■□□ 2.86
GNPTG-204	ENST00000527137	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
GNPTG-204	ENST00000527137	APAF1	O14727	1248 aa		32.91	■■■□□ 2.86
GNPTG-204	ENST00000527137	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
GNPTG-204	ENST00000527137	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
GNPTG-204	ENST00000527137	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		32.9	■■■□□ 2.86
GNPTG-204	ENST00000527137	NHS	Q6T4R5	1651 aa		32.9	■■■□□ 2.86
GNPTG-204	ENST00000527137	NEUROD2	Q15784	382 aa		32.87	■■■□□ 2.85
GNPTG-204	ENST00000527137	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		32.86	■■■□□ 2.85
GNPTG-204	ENST00000527137	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
GNPTG-204	ENST00000527137	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.85	■■■□□ 2.85
GNPTG-204	ENST00000527137	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
GNPTG-204	ENST00000527137	RIPK4	P57078	832 aa		32.84	■■■□□ 2.85
GNPTG-204	ENST00000527137	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
GNPTG-204	ENST00000527137	BCL9	O00512	1426 aa		32.83	■■■□□ 2.85
GNPTG-204	ENST00000527137	BTAF1	O14981	1849 aa		32.82	■■■□□ 2.84
GNPTG-204	ENST00000527137	DCAF5	Q96JK2	942 aa		32.81	■■■□□ 2.84
GNPTG-204	ENST00000527137	MRC1	P22897	1456 aa		32.8	■■■□□ 2.84
GNPTG-204	ENST00000527137	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		32.8	■■■□□ 2.84
GNPTG-204	ENST00000527137	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		32.8	■■■□□ 2.84
GNPTG-204	ENST00000527137	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
GNPTG-204	ENST00000527137	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
GNPTG-204	ENST00000527137	DCTN1	Q14203	1278 aa		32.79	■■■□□ 2.84
GNPTG-204	ENST00000527137	MCM10	Q7L590	875 aa		32.79	■■■□□ 2.84
GNPTG-204	ENST00000527137	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
GNPTG-204	ENST00000527137	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.79	■■■□□ 2.84
GNPTG-204	ENST00000527137	ILDR2	Q71H61	639 aa		32.77	■■■□□ 2.84
GNPTG-204	ENST00000527137	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
GNPTG-204	ENST00000527137	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.76	■■■□□ 2.83
GNPTG-204	ENST00000527137	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		32.76	■■■□□ 2.83
GNPTG-204	ENST00000527137	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
GNPTG-204	ENST00000527137	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		32.76	■■■□□ 2.83
GNPTG-204	ENST00000527137	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		32.75	■■■□□ 2.83
GNPTG-204	ENST00000527137	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
GNPTG-204	ENST00000527137	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
GNPTG-204	ENST00000527137	PAPPA	Q13219	1627 aa		32.73	■■■□□ 2.83
GNPTG-204	ENST00000527137	KCNQ2	O43526	872 aa		32.72	■■■□□ 2.83
GNPTG-204	ENST00000527137	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
GNPTG-204	ENST00000527137	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.7	■■■□□ 2.83
GNPTG-204	ENST00000527137	CABP4	P57796	275 aa		32.7	■■■□□ 2.83
GNPTG-204	ENST00000527137	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		32.7	■■■□□ 2.83
GNPTG-204	ENST00000527137	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.69	■■■□□ 2.82
GNPTG-204	ENST00000527137	TRIM37	O94972	964 aa		32.69	■■■□□ 2.82
GNPTG-204	ENST00000527137	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.69	■■■□□ 2.82
GNPTG-204	ENST00000527137	TEF	Q10587	303 aa		32.68	■■■□□ 2.82
GNPTG-204	ENST00000527137	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		32.68	■■■□□ 2.82
GNPTG-204	ENST00000527137	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	32.67	■■■□□ 2.82
GNPTG-204	ENST00000527137	CCDC27	Q2M243	656 aa		32.66	■■■□□ 2.82

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