RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.26■■□□□ 1.63
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TSPAN4-216ENST00000526055 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
TSPAN4-216ENST00000526055 NCAPD2Q15021 1401 aa25.25■■□□□ 1.63
TSPAN4-216ENST00000526055 KCNQ2O43526 872 aa25.24■■□□□ 1.63
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TSPAN4-216ENST00000526055 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.23■■□□□ 1.63
TSPAN4-216ENST00000526055 MORC1Q86VD1 984 aa25.22■■□□□ 1.63
TSPAN4-216ENST00000526055 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
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TSPAN4-216ENST00000526055 PROM2Q8N271 834 aa25.2■■□□□ 1.62
TSPAN4-216ENST00000526055 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.19■■□□□ 1.62
TSPAN4-216ENST00000526055 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.19■■□□□ 1.62
TSPAN4-216ENST00000526055 TXNRD1Q16881 649 aa25.19■■□□□ 1.62
TSPAN4-216ENST00000526055 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPAN4-216ENST00000526055 EYA1Q99502 592 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPAN4-216ENST00000526055 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPAN4-216ENST00000526055 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
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TSPAN4-216ENST00000526055 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-216ENST00000526055 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPAN4-216ENST00000526055 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.11■■□□□ 1.61
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TSPAN4-216ENST00000526055 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.11■■□□□ 1.61
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TSPAN4-216ENST00000526055 STK32BQ9NY57 414 aa25.1■■□□□ 1.61
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TSPAN4-216ENST00000526055 SPON1Q9HCB6 807 aa25.03■■□□□ 1.6
TSPAN4-216ENST00000526055 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.03■■□□□ 1.6
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TSPAN4-216ENST00000526055 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
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TSPAN4-216ENST00000526055 MTHFSP49914 203 aa25.01■■□□□ 1.59
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TSPAN4-216ENST00000526055 AMOTQ4VCS5 1084 aa25■■□□□ 1.59
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TSPAN4-216ENST00000526055 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TSPAN4-216ENST00000526055 CASZ1Q86V15 1759 aa24.99■■□□□ 1.59
TSPAN4-216ENST00000526055 LY75O60449 1722 aa24.98■■□□□ 1.59
TSPAN4-216ENST00000526055 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
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TSPAN4-216ENST00000526055 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.95■■□□□ 1.58
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF827Q17R98 1081 aa24.94■■□□□ 1.58
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TSPAN4-216ENST00000526055 ITGB4P16144 1822 aa24.92■■□□□ 1.58
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TSPAN4-216ENST00000526055 MTFR1LQ9H019 292 aa24.92■■□□□ 1.58
TSPAN4-216ENST00000526055 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.91■■□□□ 1.58
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
TSPAN4-216ENST00000526055 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.9■■□□□ 1.58
TSPAN4-216ENST00000526055 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
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TSPAN4-216ENST00000526055 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.89■■□□□ 1.58
TSPAN4-216ENST00000526055 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.89■■□□□ 1.58
TSPAN4-216ENST00000526055 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.89■■□□□ 1.57
TSPAN4-216ENST00000526055 KCNQ4P56696 695 aa24.88■■□□□ 1.57
TSPAN4-216ENST00000526055 PTGER2P43116 358 aa24.86■■□□□ 1.57
TSPAN4-216ENST00000526055 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.86■■□□□ 1.57
TSPAN4-216ENST00000526055 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
TSPAN4-216ENST00000526055 CFAP53Q96M91 514 aa24.84■■□□□ 1.57
TSPAN4-216ENST00000526055 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
TSPAN4-216ENST00000526055 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.83■■□□□ 1.57
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TSPAN4-216ENST00000526055 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.83■■□□□ 1.57
TSPAN4-216ENST00000526055 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.83■■□□□ 1.57
TSPAN4-216ENST00000526055 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
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TSPAN4-216ENST00000526055 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.82■■□□□ 1.56
TSPAN4-216ENST00000526055 C5P01031 1676 aa24.81■■□□□ 1.56
TSPAN4-216ENST00000526055 HMOX1P09601 288 aa24.81■■□□□ 1.56
TSPAN4-216ENST00000526055 CABP4P57796 275 aa24.81■■□□□ 1.56
TSPAN4-216ENST00000526055 ATG3Q9NT62 314 aa24.81■■□□□ 1.56
TSPAN4-216ENST00000526055 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.79■■□□□ 1.56
TSPAN4-216ENST00000526055 PPP2R1AP30153 589 aa24.78■■□□□ 1.56
TSPAN4-216ENST00000526055 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.77■■□□□ 1.56
TSPAN4-216ENST00000526055 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TSPAN4-216ENST00000526055 AK7Q96M32 723 aa24.77■■□□□ 1.56
TSPAN4-216ENST00000526055 NUDCQ9Y266 331 aa24.77■■□□□ 1.56
TSPAN4-216ENST00000526055 C4BP0C0L5 1744 aa24.75■■□□□ 1.55
TSPAN4-216ENST00000526055 POLD1P28340 1107 aa24.75■■□□□ 1.55
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