RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519070.5

FAM49B-211, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM49B, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM49B-211ENST00000519070 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM49B-211ENST00000519070 NHSQ6T4R5 1651 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM49B-211ENST00000519070 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
FAM49B-211ENST00000519070 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.86■■□□□ 1.09
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FAM49B-211ENST00000519070 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM49B-211ENST00000519070 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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FAM49B-211ENST00000519070 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.84■■□□□ 1.09
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FAM49B-211ENST00000519070 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.81■■□□□ 1.08
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FAM49B-211ENST00000519070 BAG6P46379 1132 aa21.81■■□□□ 1.08
FAM49B-211ENST00000519070 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
FAM49B-211ENST00000519070 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.81■■□□□ 1.08
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FAM49B-211ENST00000519070 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.8■■□□□ 1.08
FAM49B-211ENST00000519070 BTAF1O14981 1849 aa21.79■■□□□ 1.08
FAM49B-211ENST00000519070 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
FAM49B-211ENST00000519070 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
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FAM49B-211ENST00000519070 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.79■■□□□ 1.08
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FAM49B-211ENST00000519070 PROM2Q8N271 834 aa21.78■■□□□ 1.08
FAM49B-211ENST00000519070 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.76■■□□□ 1.07
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FAM49B-211ENST00000519070 SPG7Q9UQ90 795 aa21.75■■□□□ 1.07
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FAM49B-211ENST00000519070 ITGB4P16144 1822 aa21.73■■□□□ 1.07
FAM49B-211ENST00000519070 RALBP1Q15311 655 aa21.72■■□□□ 1.07
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FAM49B-211ENST00000519070 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.69■■□□□ 1.06
FAM49B-211ENST00000519070 LY75O60449 1722 aa21.69■■□□□ 1.06
FAM49B-211ENST00000519070 CFAP53Q96M91 514 aa21.68■■□□□ 1.06
FAM49B-211ENST00000519070 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.68■■□□□ 1.06
FAM49B-211ENST00000519070 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
FAM49B-211ENST00000519070 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.67■■□□□ 1.06
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FAM49B-211ENST00000519070 TXNRD1Q16881 649 aa21.67■■□□□ 1.06
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FAM49B-211ENST00000519070 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
FAM49B-211ENST00000519070 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
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FAM49B-211ENST00000519070 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.63■■□□□ 1.05
FAM49B-211ENST00000519070 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.63■■□□□ 1.05
FAM49B-211ENST00000519070 DCAF5Q96JK2 942 aa21.62■■□□□ 1.05
FAM49B-211ENST00000519070 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.61■■□□□ 1.05
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FAM49B-211ENST00000519070 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
FAM49B-211ENST00000519070 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
FAM49B-211ENST00000519070 PRKAR2BP31323 418 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM49B-211ENST00000519070 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
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FAM49B-211ENST00000519070 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM49B-211ENST00000519070 FCHSD2O94868 740 aa21.59■■□□□ 1.05
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FAM49B-211ENST00000519070 MRC1P22897 1456 aa21.58■■□□□ 1.05
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FAM49B-211ENST00000519070 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.53■■□□□ 1.04
FAM49B-211ENST00000519070 CASZ1Q86V15 1759 aa21.53■■□□□ 1.04
FAM49B-211ENST00000519070 MAP3K5Q99683 1374 aa21.52■■□□□ 1.04
FAM49B-211ENST00000519070 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
FAM49B-211ENST00000519070 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.52■■□□□ 1.04
FAM49B-211ENST00000519070 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.51■■□□□ 1.03
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