RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518564.1

PPP2CB-204, Transcript of protein phosphatase 2 catalytic subunit beta, human

TSL 3 BASIC

Gene PPP2CB, Length 691 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP2CB-204	ENST00000518564	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		43.23	■■■■■ 4.51
PPP2CB-204	ENST00000518564	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		43.23	■■■■■ 4.51
PPP2CB-204	ENST00000518564	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		43.22	■■■■■ 4.51
PPP2CB-204	ENST00000518564	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	43.21	■■■■■ 4.51
PPP2CB-204	ENST00000518564	POLK	Q9UBT6	870 aa		43.21	■■■■■ 4.51
PPP2CB-204	ENST00000518564	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		43.2	■■■■■ 4.51
PPP2CB-204	ENST00000518564	KCNQ2	O43526	872 aa		43.2	■■■■■ 4.51
PPP2CB-204	ENST00000518564	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	43.18	■■■■■ 4.5
PPP2CB-204	ENST00000518564	LRP5	O75197	1615 aa		43.18	■■■■■ 4.5
PPP2CB-204	ENST00000518564	BTAF1	O14981	1849 aa		43.17	■■■■■ 4.5
PPP2CB-204	ENST00000518564	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		43.15	■■■■■ 4.5
PPP2CB-204	ENST00000518564	MORC1	Q86VD1	984 aa		43.14	■■■■■ 4.5
PPP2CB-204	ENST00000518564	NCAPD2	Q15021	1401 aa		43.1	■■■■■ 4.49
PPP2CB-204	ENST00000518564	TXNRD1	Q16881	649 aa		43.08	■■■■■ 4.49
PPP2CB-204	ENST00000518564	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		43.07	■■■■■ 4.49
PPP2CB-204	ENST00000518564	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		43.07	■■■■■ 4.49
PPP2CB-204	ENST00000518564	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		43.05	■■■■■ 4.48
PPP2CB-204	ENST00000518564	PROM2	Q8N271	834 aa		43.04	■■■■■ 4.48
PPP2CB-204	ENST00000518564	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	43.04	■■■■■ 4.48
PPP2CB-204	ENST00000518564	EYA1	Q99502	592 aa		43.03	■■■■■ 4.48
PPP2CB-204	ENST00000518564	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	43.02	■■■■■ 4.48
PPP2CB-204	ENST00000518564	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	43.02	■■■■■ 4.48
PPP2CB-204	ENST00000518564	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	42.99	■■■■■ 4.47
PPP2CB-204	ENST00000518564	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	42.98	■■■■■ 4.47
PPP2CB-204	ENST00000518564	SPG7	Q9UQ90	795 aa		42.94	■■■■■ 4.46
PPP2CB-204	ENST00000518564	STK32B	Q9NY57	414 aa		42.93	■■■■■ 4.46
PPP2CB-204	ENST00000518564	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	42.91	■■■■■ 4.46
PPP2CB-204	ENST00000518564	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		42.9	■■■■■ 4.46
PPP2CB-204	ENST00000518564	PAPPA	Q13219	1627 aa		42.89	■■■■■ 4.46
PPP2CB-204	ENST00000518564	CYP27B1	O15528	508 aa		42.89	■■■■■ 4.46
PPP2CB-204	ENST00000518564	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	42.88	■■■■■ 4.45
PPP2CB-204	ENST00000518564	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		42.87	■■■■■ 4.45
PPP2CB-204	ENST00000518564	CASZ1	Q86V15	1759 aa		42.86	■■■■■ 4.45
PPP2CB-204	ENST00000518564	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	42.86	■■■■■ 4.45	9e-6	■□□□□ 9.4
PPP2CB-204	ENST00000518564	LY75	O60449	1722 aa		42.85	■■■■■ 4.45
PPP2CB-204	ENST00000518564	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		42.85	■■■■■ 4.45
PPP2CB-204	ENST00000518564	SLC15A2	Q16348	729 aa		42.84	■■■■■ 4.45
PPP2CB-204	ENST00000518564	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		42.84	■■■■■ 4.45
PPP2CB-204	ENST00000518564	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		42.82	■■■■■ 4.45
PPP2CB-204	ENST00000518564	ITGB4	P16144	1822 aa		42.79	■■■■■ 4.44
PPP2CB-204	ENST00000518564	SPON1	Q9HCB6	807 aa		42.78	■■■■■ 4.44
PPP2CB-204	ENST00000518564	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		42.78	■■■■■ 4.44
PPP2CB-204	ENST00000518564	MTHFS	P49914	203 aa		42.76	■■■■■ 4.44
PPP2CB-204	ENST00000518564	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		42.76	■■■■■ 4.44
PPP2CB-204	ENST00000518564	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		42.76	■■■■■ 4.44
PPP2CB-204	ENST00000518564	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	42.75	■■■■■ 4.43
PPP2CB-204	ENST00000518564	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	42.75	■■■■■ 4.43
PPP2CB-204	ENST00000518564	PHKG2	P15735	406 aa		42.73	■■■■■ 4.43
PPP2CB-204	ENST00000518564	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	42.72	■■■■■ 4.43
PPP2CB-204	ENST00000518564	IL13	P35225	146 aa		42.71	■■■■■ 4.43
PPP2CB-204	ENST00000518564	ZNF827	Q17R98	1081 aa		42.7	■■■■■ 4.43
PPP2CB-204	ENST00000518564	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	42.7	■■■■■ 4.43
PPP2CB-204	ENST00000518564	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	42.69	■■■■■ 4.42
PPP2CB-204	ENST00000518564	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		42.69	■■■■■ 4.42
PPP2CB-204	ENST00000518564	PALLD	Q8WX93	1383 aa		42.68	■■■■■ 4.42
PPP2CB-204	ENST00000518564	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		42.68	■■■■■ 4.42
PPP2CB-204	ENST00000518564	KCNQ4	P56696	695 aa		42.67	■■■■■ 4.42
PPP2CB-204	ENST00000518564	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		42.67	■■■■■ 4.42
PPP2CB-204	ENST00000518564	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	42.67	■■■■■ 4.42
PPP2CB-204	ENST00000518564	KDR	P35968	1356 aa		42.66	■■■■■ 4.42
PPP2CB-204	ENST00000518564	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		42.66	■■■■■ 4.42
PPP2CB-204	ENST00000518564	ZBTB7A	O95365	584 aa		42.65	■■■■■ 4.42
PPP2CB-204	ENST00000518564	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	42.64	■■■■■ 4.42
PPP2CB-204	ENST00000518564	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		42.64	■■■■■ 4.42
PPP2CB-204	ENST00000518564	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	42.63	■■■■■ 4.41
PPP2CB-204	ENST00000518564	AKT1S1	Q96B36	256 aa		42.63	■■■■■ 4.41
PPP2CB-204	ENST00000518564	C5	P01031	1676 aa		42.63	■■■■■ 4.41
PPP2CB-204	ENST00000518564	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	42.62	■■■■■ 4.41
PPP2CB-204	ENST00000518564	PIGB	Q92521	554 aa		42.61	■■■■■ 4.41
PPP2CB-204	ENST00000518564	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		42.61	■■■■■ 4.41
PPP2CB-204	ENST00000518564	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	42.6	■■■■■ 4.41
PPP2CB-204	ENST00000518564	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	42.59	■■■■■ 4.41
PPP2CB-204	ENST00000518564	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		42.59	■■■■■ 4.41
PPP2CB-204	ENST00000518564	MTFR1L	Q9H019	292 aa		42.58	■■■■■ 4.41
PPP2CB-204	ENST00000518564	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		42.57	■■■■■ 4.41
PPP2CB-204	ENST00000518564	DCAF5	Q96JK2	942 aa		42.56	■■■■■ 4.4
PPP2CB-204	ENST00000518564	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	42.56	■■■■■ 4.4
PPP2CB-204	ENST00000518564	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		42.55	■■■■■ 4.4
PPP2CB-204	ENST00000518564	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	42.54	■■■■■ 4.4
PPP2CB-204	ENST00000518564	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		42.51	■■■■■ 4.4
PPP2CB-204	ENST00000518564	HMOX1	P09601	288 aa		42.51	■■■■■ 4.4
PPP2CB-204	ENST00000518564	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		42.5	■■■■■ 4.39
PPP2CB-204	ENST00000518564	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	42.5	■■■■■ 4.39
PPP2CB-204	ENST00000518564	PTGER2	P43116	358 aa		42.47	■■■■■ 4.39
PPP2CB-204	ENST00000518564	C4B	P0C0L5	1744 aa		42.46	■■■■■ 4.39
PPP2CB-204	ENST00000518564	CFAP53	Q96M91	514 aa		42.46	■■■■■ 4.39
PPP2CB-204	ENST00000518564	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		42.46	■■■■■ 4.39
PPP2CB-204	ENST00000518564	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		42.45	■■■■■ 4.39
PPP2CB-204	ENST00000518564	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	42.44	■■■■■ 4.38
PPP2CB-204	ENST00000518564	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		42.43	■■■■■ 4.38
PPP2CB-204	ENST00000518564	SIK1	P57059	783 aa		42.43	■■■■■ 4.38
PPP2CB-204	ENST00000518564	CABP4	P57796	275 aa		42.43	■■■■■ 4.38
PPP2CB-204	ENST00000518564	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		42.42	■■■■■ 4.38
PPP2CB-204	ENST00000518564	ATG3	Q9NT62	314 aa		42.41	■■■■■ 4.38
PPP2CB-204	ENST00000518564	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		42.4	■■■■■ 4.38
PPP2CB-204	ENST00000518564	MSH5	O43196	834 aa		42.39	■■■■■ 4.38
PPP2CB-204	ENST00000518564	AK7	Q96M32	723 aa		42.39	■■■■■ 4.38
PPP2CB-204	ENST00000518564	PPP2R1A	P30153	589 aa		42.37	■■■■■ 4.37
PPP2CB-204	ENST00000518564	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		42.37	■■■■■ 4.37
PPP2CB-204	ENST00000518564	ATP6V1A	P38606	617 aa		42.35	■■■■■ 4.37

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