RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.72■■□□□ 1.87
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SH3BP2-220ENST00000511663 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.71■■□□□ 1.87
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SH3BP2-220ENST00000511663 FLT4P35916 1363 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.69■■□□□ 1.86
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SH3BP2-220ENST00000511663 SYT17Q9BSW7 474 aa26.68■■□□□ 1.86
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SH3BP2-220ENST00000511663 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
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SH3BP2-220ENST00000511663 SLC16A10Q8TF71 515 aa26.67■■□□□ 1.86
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SH3BP2-220ENST00000511663 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP2-220ENST00000511663 MEGF6O75095 1541 aa26.66■■□□□ 1.86
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SH3BP2-220ENST00000511663 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
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SH3BP2-220ENST00000511663 KCNQ4P56696 695 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP2-220ENST00000511663 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP2-220ENST00000511663 MYOM1P52179 1685 aa26.63■■□□□ 1.85
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SH3BP2-220ENST00000511663 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.63■■□□□ 1.85
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SH3BP2-220ENST00000511663 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.61■■□□□ 1.85
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SH3BP2-220ENST00000511663 MSH5O43196 834 aa26.58■■□□□ 1.85
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SH3BP2-220ENST00000511663 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.84
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SH3BP2-220ENST00000511663 KLHL34Q8N239 644 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-220ENST00000511663 SPG7Q9UQ90 795 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-220ENST00000511663 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP2-220ENST00000511663 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2-220ENST00000511663 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
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SH3BP2-220ENST00000511663 CYP27B1O15528 508 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP3K5Q99683 1374 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-220ENST00000511663 GPR162Q16538 588 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-220ENST00000511663 LY75O60449 1722 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-220ENST00000511663 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-220ENST00000511663 POLKQ9UBT6 870 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-220ENST00000511663 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.49■■□□□ 1.83
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SH3BP2-220ENST00000511663 EYA1Q99502 592 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-220ENST00000511663 PALLDQ8WX93 1383 aa26.48■■□□□ 1.83
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SH3BP2-220ENST00000511663 AK7Q96M32 723 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-220ENST00000511663 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.43■■□□□ 1.82
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SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
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SH3BP2-220ENST00000511663 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-220ENST00000511663 C5P01031 1676 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-220ENST00000511663 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.36■■□□□ 1.81
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SH3BP2-220ENST00000511663 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-220ENST00000511663 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-220ENST00000511663 ITGB4P16144 1822 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-220ENST00000511663 PHF14O94880 888 aa26.34■■□□□ 1.81
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SH3BP2-220ENST00000511663 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.34■■□□□ 1.81
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SH3BP2-220ENST00000511663 CHD4Q14839 1912 aa26.33■■□□□ 1.81
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SH3BP2-220ENST00000511663 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2-220ENST00000511663 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2-220ENST00000511663 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2-220ENST00000511663 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2-220ENST00000511663 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2-220ENST00000511663 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-220ENST00000511663 SSFA2P28290 1259 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-220ENST00000511663 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-220ENST00000511663 DCAF5Q96JK2 942 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-220ENST00000511663 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-220ENST00000511663 C4BP0C0L5 1744 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-220ENST00000511663 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-220ENST00000511663 ATG3Q9NT62 314 aa26.28■■□□□ 1.8
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