RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 TMF1P82094 1093 aa27.91■■■□□ 2.06
NELFE-212ENST00000492539 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.91■■■□□ 2.06
NELFE-212ENST00000492539 AKT1S1Q96B36 256 aa27.91■■■□□ 2.06
NELFE-212ENST00000492539 NSD2O96028 1365 aa27.9■■■□□ 2.06
NELFE-212ENST00000492539 FYB1O15117 783 aa27.9■■■□□ 2.06
NELFE-212ENST00000492539 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.89■■■□□ 2.06
NELFE-212ENST00000492539 MAP3K5Q99683 1374 aa27.88■■■□□ 2.05
NELFE-212ENST00000492539 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
NELFE-212ENST00000492539 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
NELFE-212ENST00000492539 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.88■■■□□ 2.05
NELFE-212ENST00000492539 ARXQ96QS3 562 aa27.87■■■□□ 2.05
NELFE-212ENST00000492539 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
NELFE-212ENST00000492539 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.86■■■□□ 2.05
NELFE-212ENST00000492539 NBPF4Q96M43 638 aa27.86■■■□□ 2.05
NELFE-212ENST00000492539 CHD4Q14839 1912 aa27.86■■■□□ 2.05
NELFE-212ENST00000492539 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
NELFE-212ENST00000492539 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.84■■■□□ 2.05
NELFE-212ENST00000492539 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
NELFE-212ENST00000492539 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.83■■■□□ 2.05
NELFE-212ENST00000492539 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.83■■■□□ 2.05
NELFE-212ENST00000492539 CDCA8Q53HL2 280 aa27.81■■■□□ 2.04
NELFE-212ENST00000492539 INSRP06213 1382 aa27.81■■■□□ 2.04
NELFE-212ENST00000492539 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.81■■■□□ 2.04
NELFE-212ENST00000492539 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.8■■■□□ 2.04
NELFE-212ENST00000492539 FLT4P35916 1363 aa27.79■■■□□ 2.04
NELFE-212ENST00000492539 KCNQ4P56696 695 aa27.79■■■□□ 2.04
NELFE-212ENST00000492539 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.78■■■□□ 2.04
NELFE-212ENST00000492539 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.77■■■□□ 2.04
NELFE-212ENST00000492539 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa27.77■■■□□ 2.04
NELFE-212ENST00000492539 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa27.75■■■□□ 2.03
NELFE-212ENST00000492539 TATP17735 454 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
NELFE-212ENST00000492539 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
NELFE-212ENST00000492539 PKD1L3Q7Z443 1732 aa27.75■■■□□ 2.03
NELFE-212ENST00000492539 CARD14Q9BXL6 1004 aa27.74■■■□□ 2.03
NELFE-212ENST00000492539 C5P01031 1676 aa27.74■■■□□ 2.03
NELFE-212ENST00000492539 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.73■■■□□ 2.03
NELFE-212ENST00000492539 POLD1P28340 1107 aa27.73■■■□□ 2.03
NELFE-212ENST00000492539 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.73■■■□□ 2.03
NELFE-212ENST00000492539 NSD3Q9BZ95 1437 aa27.73■■■□□ 2.03
NELFE-212ENST00000492539 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa27.72■■■□□ 2.03
NELFE-212ENST00000492539 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa27.72■■■□□ 2.03
NELFE-212ENST00000492539 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
NELFE-212ENST00000492539 ITGB4P16144 1822 aa27.71■■■□□ 2.03
NELFE-212ENST00000492539 NCAPD2Q15021 1401 aa27.71■■■□□ 2.03
NELFE-212ENST00000492539 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27.69■■■□□ 2.02
NELFE-212ENST00000492539 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
NELFE-212ENST00000492539 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
NELFE-212ENST00000492539 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.68■■■□□ 2.02
NELFE-212ENST00000492539 CYP27B1O15528 508 aa27.66■■■□□ 2.02
NELFE-212ENST00000492539 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
NELFE-212ENST00000492539 KLHL34Q8N239 644 aa27.65■■■□□ 2.02
NELFE-212ENST00000492539 PALLDQ8WX93 1383 aa27.64■■■□□ 2.02
NELFE-212ENST00000492539 GPR162Q16538 588 aa27.63■■■□□ 2.01
NELFE-212ENST00000492539 C4BP0C0L5 1744 aa27.61■■■□□ 2.01
NELFE-212ENST00000492539 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.61■■■□□ 2.01
NELFE-212ENST00000492539 NLGN2Q8NFZ4 835 aa27.61■■■□□ 2.01
NELFE-212ENST00000492539 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.61■■■□□ 2.01
NELFE-212ENST00000492539 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
NELFE-212ENST00000492539 MSH5O43196 834 aa27.59■■■□□ 2.01
NELFE-212ENST00000492539 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
NELFE-212ENST00000492539 UBR3Q6ZT12 1888 aa27.58■■■□□ 2.01
NELFE-212ENST00000492539 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.58■■■□□ 2.01
NELFE-212ENST00000492539 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
NELFE-212ENST00000492539 FLAD1Q8NFF5 587 aa27.56■■■□□ 2
NELFE-212ENST00000492539 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
NELFE-212ENST00000492539 EYA1Q99502 592 aa27.55■■■□□ 2
NELFE-212ENST00000492539 SPG7Q9UQ90 795 aa27.55■■■□□ 2
NELFE-212ENST00000492539 MSL1Q68DK7 614 aa27.54■■■□□ 2
NELFE-212ENST00000492539 PIGBQ92521 554 aa27.54■■■□□ 2
NELFE-212ENST00000492539 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 22e-7■■□□□ 13.7
NELFE-212ENST00000492539 POLKQ9UBT6 870 aa27.54■■■□□ 2
NELFE-212ENST00000492539 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
NELFE-212ENST00000492539 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.5■■□□□ 1.99
NELFE-212ENST00000492539 AMIGO3Q86WK7 504 aa27.5■■□□□ 1.99
NELFE-212ENST00000492539 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.49■■□□□ 1.997e-7■□□□□ 10.2
NELFE-212ENST00000492539 AK7Q96M32 723 aa27.49■■□□□ 1.99
NELFE-212ENST00000492539 GRIN3BO60391 1043 aa27.47■■□□□ 1.99
NELFE-212ENST00000492539 PHKG2P15735 406 aa27.47■■□□□ 1.99
NELFE-212ENST00000492539 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
NELFE-212ENST00000492539 CD2APQ9Y5K6 639 aa27.47■■□□□ 1.99
NELFE-212ENST00000492539 IFNL2Q8IZJ0 200 aa27.46■■□□□ 1.99
NELFE-212ENST00000492539 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.45■■□□□ 1.98
NELFE-212ENST00000492539 SIK1P57059 783 aa27.45■■□□□ 1.98
NELFE-212ENST00000492539 C1QTNF8P60827 252 aa27.45■■□□□ 1.98
NELFE-212ENST00000492539 TMOD3Q9NYL9 352 aa27.45■■□□□ 1.98
NELFE-212ENST00000492539 LINC00116Q8NCU8 138 aa27.44■■□□□ 1.98
NELFE-212ENST00000492539 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.44■■□□□ 1.98
NELFE-212ENST00000492539 SSFA2P28290 1259 aa27.43■■□□□ 1.98
NELFE-212ENST00000492539 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.42■■□□□ 1.98
NELFE-212ENST00000492539 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
NELFE-212ENST00000492539 ASAP1Q9ULH1 1129 aa27.42■■□□□ 1.98
NELFE-212ENST00000492539 ZNF831Q5JPB2 1677 aa27.41■■□□□ 1.98
NELFE-212ENST00000492539 PHF14O94880 888 aa27.41■■□□□ 1.98
NELFE-212ENST00000492539 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
NELFE-212ENST00000492539 SMIM5Q71RC9 77 aa27.41■■□□□ 1.98
NELFE-212ENST00000492539 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.4■■□□□ 1.98
NELFE-212ENST00000492539 ITPK1Q13572 414 aa27.4■■□□□ 1.98
NELFE-212ENST00000492539 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
NELFE-212ENST00000492539 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
NELFE-212ENST00000492539 ATG3Q9NT62 314 aa27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms