RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489581.1

TOP3B-217, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 789 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-217ENST00000489581 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.91■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.91■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.91■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 GPR162Q16538 588 aa23.9■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.9■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.9■■□□□ 1.42
TOP3B-217ENST00000489581 POLD1P28340 1107 aa23.89■■□□□ 1.41
TOP3B-217ENST00000489581 LY75O60449 1722 aa23.88■■□□□ 1.41
TOP3B-217ENST00000489581 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
TOP3B-217ENST00000489581 MEGF6O75095 1541 aa23.87■■□□□ 1.41
TOP3B-217ENST00000489581 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.86■■□□□ 1.41
TOP3B-217ENST00000489581 NSD2O96028 1365 aa23.86■■□□□ 1.41
TOP3B-217ENST00000489581 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
TOP3B-217ENST00000489581 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.84■■□□□ 1.41
TOP3B-217ENST00000489581 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.84■■□□□ 1.41
TOP3B-217ENST00000489581 NBPF4Q96M43 638 aa23.84■■□□□ 1.41
TOP3B-217ENST00000489581 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.84■■□□□ 1.41
TOP3B-217ENST00000489581 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
TOP3B-217ENST00000489581 SLC24A1O60721 1099 aa23.83■■□□□ 1.41
TOP3B-217ENST00000489581 FYB1O15117 783 aa23.82■■□□□ 1.4
TOP3B-217ENST00000489581 MSH5O43196 834 aa23.81■■□□□ 1.4
TOP3B-217ENST00000489581 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
TOP3B-217ENST00000489581 RTL1A6NKG5 1358 aa23.8■■□□□ 1.4
TOP3B-217ENST00000489581 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.8■■□□□ 1.4
TOP3B-217ENST00000489581 USP47Q96K76 1375 aa23.79■■□□□ 1.4
TOP3B-217ENST00000489581 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.79■■□□□ 1.4
TOP3B-217ENST00000489581 C1QTNF8P60827 252 aa23.78■■□□□ 1.4
TOP3B-217ENST00000489581 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
TOP3B-217ENST00000489581 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.77■■□□□ 1.4
TOP3B-217ENST00000489581 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
TOP3B-217ENST00000489581 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.77■■□□□ 1.4
TOP3B-217ENST00000489581 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
TOP3B-217ENST00000489581 TMF1P82094 1093 aa23.76■■□□□ 1.39
TOP3B-217ENST00000489581 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.76■■□□□ 1.39
TOP3B-217ENST00000489581 MSL1Q68DK7 614 aa23.74■■□□□ 1.39
TOP3B-217ENST00000489581 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.74■■□□□ 1.39
TOP3B-217ENST00000489581 C5P01031 1676 aa23.73■■□□□ 1.39
TOP3B-217ENST00000489581 INSRP06213 1382 aa23.72■■□□□ 1.39
TOP3B-217ENST00000489581 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.72■■□□□ 1.39
TOP3B-217ENST00000489581 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.71■■□□□ 1.39
TOP3B-217ENST00000489581 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.71■■□□□ 1.39
TOP3B-217ENST00000489581 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.71■■□□□ 1.39
TOP3B-217ENST00000489581 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.71■■□□□ 1.39
TOP3B-217ENST00000489581 ITGB4P16144 1822 aa23.7■■□□□ 1.38
TOP3B-217ENST00000489581 FLT4P35916 1363 aa23.69■■□□□ 1.38
TOP3B-217ENST00000489581 PALLDQ8WX93 1383 aa23.68■■□□□ 1.38
TOP3B-217ENST00000489581 CYP27B1O15528 508 aa23.68■■□□□ 1.38
TOP3B-217ENST00000489581 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
TOP3B-217ENST00000489581 GRIN3BO60391 1043 aa23.67■■□□□ 1.38
TOP3B-217ENST00000489581 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.66■■□□□ 1.38
TOP3B-217ENST00000489581 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.65■■□□□ 1.38
TOP3B-217ENST00000489581 CDCA8Q53HL2 280 aa23.65■■□□□ 1.38
TOP3B-217ENST00000489581 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.65■■□□□ 1.38
TOP3B-217ENST00000489581 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.65■■□□□ 1.38
TOP3B-217ENST00000489581 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.64■■□□□ 1.37
TOP3B-217ENST00000489581 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
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TOP3B-217ENST00000489581 C4BP0C0L5 1744 aa23.62■■□□□ 1.37
TOP3B-217ENST00000489581 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
TOP3B-217ENST00000489581 SMIM5Q71RC9 77 aa23.62■■□□□ 1.37
TOP3B-217ENST00000489581 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
TOP3B-217ENST00000489581 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.62■■□□□ 1.37
TOP3B-217ENST00000489581 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.61■■□□□ 1.37
TOP3B-217ENST00000489581 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.61■■□□□ 1.37
TOP3B-217ENST00000489581 PIGBQ92521 554 aa23.61■■□□□ 1.37
TOP3B-217ENST00000489581 AK7Q96M32 723 aa23.61■■□□□ 1.37
TOP3B-217ENST00000489581 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.61■■□□□ 1.37
TOP3B-217ENST00000489581 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.6■■□□□ 1.37
TOP3B-217ENST00000489581 PHF14O94880 888 aa23.59■■□□□ 1.37
TOP3B-217ENST00000489581 SPG7Q9UQ90 795 aa23.58■■□□□ 1.37
TOP3B-217ENST00000489581 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TOP3B-217ENST00000489581 EYA1Q99502 592 aa23.56■■□□□ 1.36
TOP3B-217ENST00000489581 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
TOP3B-217ENST00000489581 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.55■■□□□ 1.36
TOP3B-217ENST00000489581 NCAPD2Q15021 1401 aa23.55■■□□□ 1.36
TOP3B-217ENST00000489581 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.54■■□□□ 1.36
TOP3B-217ENST00000489581 ATP10DQ9P241 1426 aa23.54■■□□□ 1.36
TOP3B-217ENST00000489581 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.54■■□□□ 1.36
TOP3B-217ENST00000489581 SIK1P57059 783 aa23.54■■□□□ 1.36
TOP3B-217ENST00000489581 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.54■■□□□ 1.36
TOP3B-217ENST00000489581 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.54■■□□□ 1.36
TOP3B-217ENST00000489581 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.53■■□□□ 1.36
TOP3B-217ENST00000489581 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.52■■□□□ 1.36
TOP3B-217ENST00000489581 SSFA2P28290 1259 aa23.51■■□□□ 1.35
TOP3B-217ENST00000489581 POLKQ9UBT6 870 aa23.51■■□□□ 1.35
TOP3B-217ENST00000489581 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.51■■□□□ 1.35
TOP3B-217ENST00000489581 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.354e-7■■□□□ 12.3
TOP3B-217ENST00000489581 PHKG2P15735 406 aa23.49■■□□□ 1.35
TOP3B-217ENST00000489581 ATP6V1AP38606 617 aa23.49■■□□□ 1.35
TOP3B-217ENST00000489581 ITPK1Q13572 414 aa23.49■■□□□ 1.35
TOP3B-217ENST00000489581 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.49■■□□□ 1.35
TOP3B-217ENST00000489581 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TOP3B-217ENST00000489581 GNPATO15228 680 aa23.48■■□□□ 1.35
TOP3B-217ENST00000489581 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TOP3B-217ENST00000489581 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.48■■□□□ 1.35
TOP3B-217ENST00000489581 CEP350Q5VT06 3117 aa23.47■■□□□ 1.35
TOP3B-217ENST00000489581 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TOP3B-217ENST00000489581 ATG3Q9NT62 314 aa23.46■■□□□ 1.35
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