RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF853P0CG23 659 aa34.72■■■■□ 3.15
HOXB3-210ENST00000489475 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
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HOXB3-210ENST00000489475 MAP3K5Q99683 1374 aa34.71■■■■□ 3.15
HOXB3-210ENST00000489475 AMOTQ4VCS5 1084 aa34.71■■■■□ 3.15
HOXB3-210ENST00000489475 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
HOXB3-210ENST00000489475 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
HOXB3-210ENST00000489475 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
HOXB3-210ENST00000489475 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa34.67■■■■□ 3.14
HOXB3-210ENST00000489475 MBIPQ9NS73 344 aa34.67■■■■□ 3.14
HOXB3-210ENST00000489475 PLIN1O60240 522 aa34.66■■■■□ 3.14
HOXB3-210ENST00000489475 WDR17Q8IZU2 1322 aa34.66■■■■□ 3.14
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HOXB3-210ENST00000489475 CERKQ8TCT0 537 aa34.65■■■■□ 3.14
HOXB3-210ENST00000489475 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP34.65■■■■□ 3.14
HOXB3-210ENST00000489475 BCAR3O75815 825 aa34.65■■■■□ 3.14
HOXB3-210ENST00000489475 CRB1P82279 1406 aa34.64■■■■□ 3.14
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
HOXB3-210ENST00000489475 CHL1O00533 1208 aa34.62■■■■□ 3.13
HOXB3-210ENST00000489475 TATP17735 454 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
HOXB3-210ENST00000489475 EVA1CP58658 441 aa34.6■■■■□ 3.13
HOXB3-210ENST00000489475 AKAP4Q5JQC9 854 aa34.6■■■■□ 3.13
HOXB3-210ENST00000489475 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa34.6■■■■□ 3.13
HOXB3-210ENST00000489475 C1orf141Q5JVX7 400 aa34.6■■■■□ 3.13
HOXB3-210ENST00000489475 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa34.59■■■■□ 3.13
HOXB3-210ENST00000489475 IL17REQ8NFR9 667 aa34.58■■■■□ 3.13
HOXB3-210ENST00000489475 STRN4Q9NRL3 753 aa34.58■■■■□ 3.13
HOXB3-210ENST00000489475 LRRC37A3O60309 1634 aa34.57■■■■□ 3.12
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF428Q96B54 188 aa34.55■■■■□ 3.12
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HOXB3-210ENST00000489475 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP34.55■■■■□ 3.12
HOXB3-210ENST00000489475 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
HOXB3-210ENST00000489475 MEGF6O75095 1541 aa34.55■■■■□ 3.12
HOXB3-210ENST00000489475 SPG7Q9UQ90 795 aa34.55■■■■□ 3.12
HOXB3-210ENST00000489475 CARD10Q9BWT7 1032 aa34.54■■■■□ 3.12
HOXB3-210ENST00000489475 BTG4Q9NY30 223 aa34.54■■■■□ 3.12
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HOXB3-210ENST00000489475 BCL2L13Q9BXK5 485 aa34.53■■■■□ 3.12
HOXB3-210ENST00000489475 TSPYL4Q9UJ04 414 aa34.53■■■■□ 3.12
HOXB3-210ENST00000489475 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa34.52■■■■□ 3.12
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HOXB3-210ENST00000489475 SMC4Q9NTJ3 1288 aa34.51■■■■□ 3.12
HOXB3-210ENST00000489475 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
HOXB3-210ENST00000489475 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
HOXB3-210ENST00000489475 VAMP4O75379 141 aa34.49■■■■□ 3.11
HOXB3-210ENST00000489475 C20orf194Q5TEA3 1177 aa34.49■■■■□ 3.11
HOXB3-210ENST00000489475 TSPYL6Q8N831 410 aa34.49■■■■□ 3.11
HOXB3-210ENST00000489475 C8orf58Q8NAV2 365 aa34.49■■■■□ 3.11
HOXB3-210ENST00000489475 SSH1Q8WYL5 1049 aa34.49■■■■□ 3.11
HOXB3-210ENST00000489475 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
HOXB3-210ENST00000489475 BABAM1Q9NWV8 329 aa34.49■■■■□ 3.11
HOXB3-210ENST00000489475 MIS18AQ9NYP9 233 aa34.49■■■■□ 3.11
HOXB3-210ENST00000489475 ALDH1L2Q3SY69 923 aa34.48■■■■□ 3.11
HOXB3-210ENST00000489475 LGR6Q9HBX8 967 aa34.48■■■■□ 3.11
HOXB3-210ENST00000489475 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa34.48■■■■□ 3.11
HOXB3-210ENST00000489475 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
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HOXB3-210ENST00000489475 EXOC6Q8TAG9 804 aa34.47■■■■□ 3.11
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HOXB3-210ENST00000489475 TEFQ10587 303 aa34.45■■■■□ 3.11
HOXB3-210ENST00000489475 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
HOXB3-210ENST00000489475 PDE3AQ14432 1141 aa34.44■■■■□ 3.1
HOXB3-210ENST00000489475 CRBNQ96SW2 442 aa34.44■■■■□ 3.1
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HOXB3-210ENST00000489475 PKD1L3Q7Z443 1732 aa34.43■■■■□ 3.1
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HOXB3-210ENST00000489475 PHKG2P15735 406 aa34.42■■■■□ 3.1
HOXB3-210ENST00000489475 JCADQ9P266 1359 aa34.42■■■■□ 3.1
HOXB3-210ENST00000489475 KRT24Q2M2I5 525 aa34.39■■■■□ 3.1
HOXB3-210ENST00000489475 KIF16BQ96L93 1317 aa34.39■■■■□ 3.1
HOXB3-210ENST00000489475 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa34.39■■■■□ 3.1
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HOXB3-210ENST00000489475 CYP27B1O15528 508 aa34.37■■■■□ 3.09
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HOXB3-210ENST00000489475 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa34.36■■■■□ 3.09
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HOXB3-210ENST00000489475 MS4A1P11836 297 aa34.34■■■■□ 3.09
HOXB3-210ENST00000489475 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa34.34■■■■□ 3.09
HOXB3-210ENST00000489475 DCAF5Q96JK2 942 aa34.34■■■■□ 3.09
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HOXB3-210ENST00000489475 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.09
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HOXB3-210ENST00000489475 CCDC136Q96JN2 1154 aa34.32■■■■□ 3.09
HOXB3-210ENST00000489475 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
HOXB3-210ENST00000489475 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa34.31■■■■□ 3.08
HOXB3-210ENST00000489475 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
HOXB3-210ENST00000489475 SCN11AQ9UI33 1791 aa34.3■■■■□ 3.08
HOXB3-210ENST00000489475 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
HOXB3-210ENST00000489475 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
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