RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10-216ENST00000489424 NHSQ6T4R5 1651 aa23.73■■□□□ 1.39
HDAC10-216ENST00000489424 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
HDAC10-216ENST00000489424 POLKQ9UBT6 870 aa23.72■■□□□ 1.39
HDAC10-216ENST00000489424 NCAPD2Q15021 1401 aa23.72■■□□□ 1.39
HDAC10-216ENST00000489424 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.71■■□□□ 1.39
HDAC10-216ENST00000489424 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.7■■□□□ 1.38
HDAC10-216ENST00000489424 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.7■■□□□ 1.38
HDAC10-216ENST00000489424 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.7■■□□□ 1.38
HDAC10-216ENST00000489424 MEGF6O75095 1541 aa23.69■■□□□ 1.38
HDAC10-216ENST00000489424 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.68■■□□□ 1.38
HDAC10-216ENST00000489424 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.68■■□□□ 1.38
HDAC10-216ENST00000489424 SLC15A2Q16348 729 aa23.68■■□□□ 1.38
HDAC10-216ENST00000489424 SPON1Q9HCB6 807 aa23.68■■□□□ 1.38
HDAC10-216ENST00000489424 STK32BQ9NY57 414 aa23.68■■□□□ 1.38
HDAC10-216ENST00000489424 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.67■■□□□ 1.38
HDAC10-216ENST00000489424 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
HDAC10-216ENST00000489424 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.66■■□□□ 1.38
HDAC10-216ENST00000489424 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
HDAC10-216ENST00000489424 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
HDAC10-216ENST00000489424 BTAF1O14981 1849 aa23.63■■□□□ 1.37
HDAC10-216ENST00000489424 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
HDAC10-216ENST00000489424 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.63■■□□□ 1.37
HDAC10-216ENST00000489424 EYA1Q99502 592 aa23.63■■□□□ 1.37
HDAC10-216ENST00000489424 SPG7Q9UQ90 795 aa23.63■■□□□ 1.37
HDAC10-216ENST00000489424 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.61■■□□□ 1.37
HDAC10-216ENST00000489424 MORC1Q86VD1 984 aa23.6■■□□□ 1.37
HDAC10-216ENST00000489424 CASZ1Q86V15 1759 aa23.6■■□□□ 1.37
HDAC10-216ENST00000489424 CYP27B1O15528 508 aa23.59■■□□□ 1.37
HDAC10-216ENST00000489424 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
HDAC10-216ENST00000489424 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
HDAC10-216ENST00000489424 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
HDAC10-216ENST00000489424 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.58■■□□□ 1.37
HDAC10-216ENST00000489424 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
HDAC10-216ENST00000489424 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.57■■□□□ 1.36
HDAC10-216ENST00000489424 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.57■■□□□ 1.36
HDAC10-216ENST00000489424 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
HDAC10-216ENST00000489424 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.56■■□□□ 1.36
HDAC10-216ENST00000489424 AKT1S1Q96B36 256 aa23.55■■□□□ 1.36
HDAC10-216ENST00000489424 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
HDAC10-216ENST00000489424 MTFR1LQ9H019 292 aa23.55■■□□□ 1.36
HDAC10-216ENST00000489424 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.54■■□□□ 1.36
HDAC10-216ENST00000489424 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
HDAC10-216ENST00000489424 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.54■■□□□ 1.36
HDAC10-216ENST00000489424 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
HDAC10-216ENST00000489424 PAPPAQ13219 1627 aa23.54■■□□□ 1.36
HDAC10-216ENST00000489424 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.53■■□□□ 1.36
HDAC10-216ENST00000489424 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
HDAC10-216ENST00000489424 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.51■■□□□ 1.35
HDAC10-216ENST00000489424 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.51■■□□□ 1.35
HDAC10-216ENST00000489424 PTGER2P43116 358 aa23.5■■□□□ 1.35
HDAC10-216ENST00000489424 ZBTB7AO95365 584 aa23.49■■□□□ 1.35
HDAC10-216ENST00000489424 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HDAC10-216ENST00000489424 ZNF827Q17R98 1081 aa23.49■■□□□ 1.35
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HDAC10-216ENST00000489424 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
HDAC10-216ENST00000489424 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.48■■□□□ 1.35
HDAC10-216ENST00000489424 KDRP35968 1356 aa23.46■■□□□ 1.35
HDAC10-216ENST00000489424 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.46■■□□□ 1.35
HDAC10-216ENST00000489424 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.46■■□□□ 1.35
HDAC10-216ENST00000489424 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HDAC10-216ENST00000489424 LY75O60449 1722 aa23.45■■□□□ 1.34
HDAC10-216ENST00000489424 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.45■■□□□ 1.34
HDAC10-216ENST00000489424 IL13P35225 146 aa23.45■■□□□ 1.34
HDAC10-216ENST00000489424 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.45■■□□□ 1.34
HDAC10-216ENST00000489424 PALLDQ8WX93 1383 aa23.44■■□□□ 1.34
HDAC10-216ENST00000489424 PIGBQ92521 554 aa23.44■■□□□ 1.34
HDAC10-216ENST00000489424 DCAF5Q96JK2 942 aa23.44■■□□□ 1.34
HDAC10-216ENST00000489424 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.43■■□□□ 1.34
HDAC10-216ENST00000489424 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.42■■□□□ 1.34
HDAC10-216ENST00000489424 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.42■■□□□ 1.34
HDAC10-216ENST00000489424 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.42■■□□□ 1.34
HDAC10-216ENST00000489424 MAP3K5Q99683 1374 aa23.41■■□□□ 1.34
HDAC10-216ENST00000489424 MTHFSP49914 203 aa23.41■■□□□ 1.34
HDAC10-216ENST00000489424 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.41■■□□□ 1.34
HDAC10-216ENST00000489424 KCNQ4P56696 695 aa23.4■■□□□ 1.34
HDAC10-216ENST00000489424 ITGB4P16144 1822 aa23.38■■□□□ 1.33
HDAC10-216ENST00000489424 ARXQ96QS3 562 aa23.38■■□□□ 1.33
HDAC10-216ENST00000489424 POLD1P28340 1107 aa23.37■■□□□ 1.33
HDAC10-216ENST00000489424 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.37■■□□□ 1.33
HDAC10-216ENST00000489424 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.36■■□□□ 1.33
HDAC10-216ENST00000489424 SIK1P57059 783 aa23.36■■□□□ 1.33
HDAC10-216ENST00000489424 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
HDAC10-216ENST00000489424 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.35■■□□□ 1.33
HDAC10-216ENST00000489424 SYT17Q9BSW7 474 aa23.35■■□□□ 1.33
HDAC10-216ENST00000489424 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
HDAC10-216ENST00000489424 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
HDAC10-216ENST00000489424 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.33■■□□□ 1.33
HDAC10-216ENST00000489424 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.33■■□□□ 1.33
HDAC10-216ENST00000489424 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
HDAC10-216ENST00000489424 ATG3Q9NT62 314 aa23.33■■□□□ 1.33
HDAC10-216ENST00000489424 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.32■■□□□ 1.32
HDAC10-216ENST00000489424 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
HDAC10-216ENST00000489424 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.32■■□□□ 1.32
HDAC10-216ENST00000489424 SSFA2P28290 1259 aa23.31■■□□□ 1.32
HDAC10-216ENST00000489424 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.31■■□□□ 1.32
HDAC10-216ENST00000489424 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.3■■□□□ 1.32
HDAC10-216ENST00000489424 CABP4P57796 275 aa23.3■■□□□ 1.32
HDAC10-216ENST00000489424 AK7Q96M32 723 aa23.3■■□□□ 1.32
HDAC10-216ENST00000489424 C5P01031 1676 aa23.28■■□□□ 1.32
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