RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 GAS2L2Q8NHY3 880 aa16.63■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 SOX12O15370 315 aa16.62■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP16.62■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.61■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 MON2Q7Z3U7 1717 aa16.6■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 KRT24Q2M2I5 525 aa16.6■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD45Q5TZF3 282 aa16.6■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 ZNF853P0CG23 659 aa16.6■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 TERF1P54274 439 aa16.6■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
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NISCH-212ENST00000488380 TNRQ92752 1358 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-212ENST00000488380 KIF13AQ9H1H9 1805 aa16.59■□□□□ 0.25
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NISCH-212ENST00000488380 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
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NISCH-212ENST00000488380 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa16.59■□□□□ 0.25
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NISCH-212ENST00000488380 AKAP12Q02952 1782 aa16.57■□□□□ 0.24
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NISCH-212ENST00000488380 SULT6B1Q6IMI4 303 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 SIRT2Q8IXJ6 389 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 KIF2CQ99661 725 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 TECPR2O15040 1411 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 ACEP12821 1306 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 CFAP44Q96MT7 982 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 KNDC1Q76NI1 1749 aa16.56■□□□□ 0.24
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NISCH-212ENST00000488380 RNF214Q8ND24 703 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 UBR1Q8IWV7 1749 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
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NISCH-212ENST00000488380 MCM10Q7L590 875 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
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NISCH-212ENST00000488380 HS1BP3Q53T59 392 aa16.54■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa16.54■□□□□ 0.24
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NISCH-212ENST00000488380 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 ZNF445P59923 1031 aa16.54■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 MPNDQ8N594 471 aa16.53■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 ABCC4O15439 1325 aa16.53■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 BMP2KLQ5H9B9 411 aa16.53■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 ZNF428Q96B54 188 aa16.52■□□□□ 0.24
NISCH-212ENST00000488380 PIK3R4Q99570 1358 aa16.52■□□□□ 0.23
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NISCH-212ENST00000488380 PKP1Q13835 747 aa16.52■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 SIRT1Q96EB6 747 aa16.52■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 PTPRUQ92729 1446 aa16.51■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 NUCB2P80303 420 aa16.51■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 SASS6Q6UVJ0 657 aa16.51■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 ARHGAP45Q92619 1136 aa16.51■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 MIS18AQ9NYP9 233 aa16.51■□□□□ 0.23
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NISCH-212ENST00000488380 SYCE3A1L190 88 aa16.51■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 LMBRD1Q9NUN5 540 aa16.51■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 FOXO3O43524 673 aa16.5■□□□□ 0.23
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NISCH-212ENST00000488380 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.5■□□□□ 0.23
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NISCH-212ENST00000488380 CCDC39Q9UFE4 941 aa16.5■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 TSC1Q92574 1164 aa16.49■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 PDLIM2Q96JY6 352 aa16.49■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa16.49■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 OVOS2Q6IE36 1432 aa16.49■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 USP6P35125 1406 aa16.48■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 CBX1P83916 185 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 PLEKHG3A1L390 1219 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 CLEC17AQ6ZS10 378 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 GPT2Q8TD30 523 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 GCC1Q96CN9 775 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
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