RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 RTL1A6NKG5 1358 aa17.63■□□□□ 0.41
PRAME-212ENST00000485532 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
PRAME-212ENST00000485532 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
PRAME-212ENST00000485532 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa17.61■□□□□ 0.41
PRAME-212ENST00000485532 NSD2O96028 1365 aa17.61■□□□□ 0.41
PRAME-212ENST00000485532 SGIP1Q9BQI5 828 aa17.6■□□□□ 0.41
PRAME-212ENST00000485532 NSD3Q9BZ95 1437 aa17.6■□□□□ 0.41
PRAME-212ENST00000485532 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa17.6■□□□□ 0.41
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PRAME-212ENST00000485532 CDCA8Q53HL2 280 aa17.59■□□□□ 0.41
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PRAME-212ENST00000485532 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa17.49■□□□□ 0.39
PRAME-212ENST00000485532 COL24A1Q17RW2 1714 aa17.49■□□□□ 0.39
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PRAME-212ENST00000485532 TAF1LQ8IZX4 1826 aa17.47■□□□□ 0.39
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PRAME-212ENST00000485532 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
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PRAME-212ENST00000485532 MAP3K5Q99683 1374 aa17.44■□□□□ 0.38
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PRAME-212ENST00000485532 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
PRAME-212ENST00000485532 SMIM5Q71RC9 77 aa17.42■□□□□ 0.38
PRAME-212ENST00000485532 NLGN2Q8NFZ4 835 aa17.42■□□□□ 0.38
PRAME-212ENST00000485532 PIGBQ92521 554 aa17.42■□□□□ 0.38
PRAME-212ENST00000485532 PANK3Q9H999 370 aa17.42■□□□□ 0.38
PRAME-212ENST00000485532 CHD4Q14839 1912 aa17.42■□□□□ 0.38
PRAME-212ENST00000485532 AMIGO3Q86WK7 504 aa17.41■□□□□ 0.38
PRAME-212ENST00000485532 SPG7Q9UQ90 795 aa17.41■□□□□ 0.38
PRAME-212ENST00000485532 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
PRAME-212ENST00000485532 C4BP0C0L5 1744 aa17.4■□□□□ 0.38
PRAME-212ENST00000485532 GPR162Q16538 588 aa17.39■□□□□ 0.37
PRAME-212ENST00000485532 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
PRAME-212ENST00000485532 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
PRAME-212ENST00000485532 UBR3Q6ZT12 1888 aa17.37■□□□□ 0.37
PRAME-212ENST00000485532 PHKG2P15735 406 aa17.37■□□□□ 0.37
PRAME-212ENST00000485532 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
PRAME-212ENST00000485532 ASAP1Q9ULH1 1129 aa17.37■□□□□ 0.37
PRAME-212ENST00000485532 PHF14O94880 888 aa17.36■□□□□ 0.37
PRAME-212ENST00000485532 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
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PRAME-212ENST00000485532 LINC00116Q8NCU8 138 aa17.35■□□□□ 0.37
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PRAME-212ENST00000485532 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP17.35■□□□□ 0.37
PRAME-212ENST00000485532 TMOD3Q9NYL9 352 aa17.35■□□□□ 0.37
PRAME-212ENST00000485532 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa17.34■□□□□ 0.37
PRAME-212ENST00000485532 SIK1P57059 783 aa17.34■□□□□ 0.37
PRAME-212ENST00000485532 IGSF1Q8N6C5 1336 aa17.34■□□□□ 0.37
PRAME-212ENST00000485532 ITPK1Q13572 414 aa17.33■□□□□ 0.36
PRAME-212ENST00000485532 ATG3Q9NT62 314 aa17.33■□□□□ 0.36
PRAME-212ENST00000485532 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
PRAME-212ENST00000485532 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP17.32■□□□□ 0.36
PRAME-212ENST00000485532 MORC1Q86VD1 984 aa17.32■□□□□ 0.36
PRAME-212ENST00000485532 AEBP1Q8IUX7 1158 aa17.32■□□□□ 0.36
PRAME-212ENST00000485532 FLAD1Q8NFF5 587 aa17.31■□□□□ 0.36
PRAME-212ENST00000485532 ATP6V1AP38606 617 aa17.29■□□□□ 0.36
PRAME-212ENST00000485532 SLC4A9Q96Q91 983 aa17.29■□□□□ 0.36
PRAME-212ENST00000485532 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
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