RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484847.5

IKZF1-214, Transcript of IKAROS family zinc finger 1, humanhuman

TSL 2

Gene IKZF1, Length 638 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1-214ENST00000484847 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa30.59■■■□□ 2.49
IKZF1-214ENST00000484847 POLKQ9UBT6 870 aa30.59■■■□□ 2.49
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IKZF1-214ENST00000484847 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
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IKZF1-214ENST00000484847 SHANK3Q9BYB0 1731 aa30.55■■■□□ 2.48
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IKZF1-214ENST00000484847 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa30.47■■■□□ 2.47
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IKZF1-214ENST00000484847 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa30.04■■■□□ 2.4
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IKZF1-214ENST00000484847 AK7Q96M32 723 aa29.99■■■□□ 2.39
IKZF1-214ENST00000484847 MSH5O43196 834 aa29.98■■■□□ 2.39
IKZF1-214ENST00000484847 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
IKZF1-214ENST00000484847 ATP6V1AP38606 617 aa29.96■■■□□ 2.39
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