RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-208ENST00000470089 KCNQ2O43526 872 aa40■■■■□ 3.99
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FBXO18-208ENST00000470089 NUP188Q5SRE5 1749 aa39.97■■■■□ 3.99
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FBXO18-208ENST00000470089 EYA1Q99502 592 aa39.96■■■■□ 3.99
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FBXO18-208ENST00000470089 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa39.95■■■■□ 3.99
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FBXO18-208ENST00000470089 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
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FBXO18-208ENST00000470089 BTAF1O14981 1849 aa39.89■■■■□ 3.98
FBXO18-208ENST00000470089 DOT1LQ8TEK3 1739 aa39.89■■■■□ 3.98
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FBXO18-208ENST00000470089 PKD1L3Q7Z443 1732 aa39.85■■■■□ 3.97
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FBXO18-208ENST00000470089 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa39.82■■■■□ 3.96
FBXO18-208ENST00000470089 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa39.82■■■■□ 3.96
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FBXO18-208ENST00000470089 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa39.81■■■■□ 3.96
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FBXO18-208ENST00000470089 TXNRD1Q16881 649 aa39.78■■■■□ 3.96
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FBXO18-208ENST00000470089 CYP27B1O15528 508 aa39.77■■■■□ 3.96
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FBXO18-208ENST00000470089 IL13P35225 146 aa39.71■■■■□ 3.95
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FBXO18-208ENST00000470089 PHKG2P15735 406 aa39.61■■■■□ 3.93
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FBXO18-208ENST00000470089 LRRC4BQ9NT99 713 aa39.59■■■■□ 3.93
FBXO18-208ENST00000470089 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa39.59■■■■□ 3.93
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FBXO18-208ENST00000470089 TAF1LQ8IZX4 1826 aa39.35■■■■□ 3.89
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FBXO18-208ENST00000470089 ZBTB7AO95365 584 aa39.35■■■■□ 3.89
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FBXO18-208ENST00000470089 ATG3Q9NT62 314 aa39.31■■■■□ 3.88
FBXO18-208ENST00000470089 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa39.31■■■■□ 3.88
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FBXO18-208ENST00000470089 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP39.29■■■■□ 3.88
FBXO18-208ENST00000470089 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa39.26■■■■□ 3.88
FBXO18-208ENST00000470089 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa39.26■■■■□ 3.88
FBXO18-208ENST00000470089 SIK1P57059 783 aa39.26■■■■□ 3.88
FBXO18-208ENST00000470089 LGR6Q9HBX8 967 aa39.24■■■■□ 3.87
FBXO18-208ENST00000470089 C4BP0C0L5 1744 aa39.23■■■■□ 3.87
FBXO18-208ENST00000470089 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
FBXO18-208ENST00000470089 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP39.23■■■■□ 3.87
FBXO18-208ENST00000470089 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa39.23■■■■□ 3.87
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