RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-223	ENST00000466245		A0A1W2PP64	1363 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-223	ENST00000466245	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-223	ENST00000466245	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-223	ENST00000466245	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-223	ENST00000466245	AKT1S1	Q96B36	256 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-223	ENST00000466245	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-223	ENST00000466245	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-223	ENST00000466245	MSH5	O43196	834 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-223	ENST00000466245	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-223	ENST00000466245	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-223	ENST00000466245	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-223	ENST00000466245	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-223	ENST00000466245	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-223	ENST00000466245	TMC1	Q8TDI8	760 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-223	ENST00000466245	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-223	ENST00000466245	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-223	ENST00000466245	LY75	O60449	1722 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-223	ENST00000466245	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-223	ENST00000466245	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-223	ENST00000466245	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-223	ENST00000466245	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-223	ENST00000466245	ATP10D	Q9P241	1426 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-223	ENST00000466245	NME9	Q86XW9	330 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-223	ENST00000466245	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-223	ENST00000466245	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-223	ENST00000466245	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-223	ENST00000466245	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-223	ENST00000466245	FYB1	O15117	783 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-223	ENST00000466245	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-223	ENST00000466245	HSPA6	P17066	643 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-223	ENST00000466245	IP6K1	Q92551	441 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-223	ENST00000466245	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-223	ENST00000466245	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-223	ENST00000466245	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-223	ENST00000466245	C5	P01031	1676 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-223	ENST00000466245	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-223	ENST00000466245	AMPH	P49418	695 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-223	ENST00000466245	KCNQ4	P56696	695 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-223	ENST00000466245	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-223	ENST00000466245	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-223	ENST00000466245	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-223	ENST00000466245	MSL1	Q68DK7	614 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-223	ENST00000466245	COG3	Q96JB2	828 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-223	ENST00000466245	RTL1	A6NKG5	1358 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-223	ENST00000466245	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-223	ENST00000466245	NSD2	O96028	1365 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-223	ENST00000466245	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-223	ENST00000466245	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-223	ENST00000466245	AK7	Q96M32	723 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-223	ENST00000466245	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-223	ENST00000466245	ADCY9	O60503	1353 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-223	ENST00000466245	HOXC9	P31274	260 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-223	ENST00000466245	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	MEGF6	O75095	1541 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	PALLD	Q8WX93	1383 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	APLP1	P51693	650 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	C4B	P0C0L5	1744 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	FBLN1	P23142	703 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	PANK3	Q9H999	370 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	INSR	P06213	1382 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	FLT4	P35916	1363 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	PHF14	O94880	888 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	ITGB4	P16144	1822 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-223	ENST00000466245	SSFA2	P28290	1259 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	NBPF4	Q96M43	638 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	NCAPD2	Q15021	1401 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	KIF3C	O14782	793 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	TOMM70	O94826	608 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	POLK	Q9UBT6	870 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-223	ENST00000466245	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21

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