RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462626.1

EML3-208, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 3, human

TSL 2

Gene EML3, Length 463 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EML3-208	ENST00000462626	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		29.26	■■■□□ 2.27
EML3-208	ENST00000462626	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		29.26	■■■□□ 2.27
EML3-208	ENST00000462626	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		29.25	■■■□□ 2.27
EML3-208	ENST00000462626	PTGER2	P43116	358 aa		29.25	■■■□□ 2.27
EML3-208	ENST00000462626	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		29.25	■■■□□ 2.27
EML3-208	ENST00000462626	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
EML3-208	ENST00000462626	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		29.23	■■■□□ 2.27
EML3-208	ENST00000462626	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		29.21	■■■□□ 2.27
EML3-208	ENST00000462626	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		29.21	■■■□□ 2.27
EML3-208	ENST00000462626	NSD2	O96028	1365 aa		29.21	■■■□□ 2.27
EML3-208	ENST00000462626	MTFR1L	Q9H019	292 aa		29.2	■■■□□ 2.26
EML3-208	ENST00000462626	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.26
EML3-208	ENST00000462626	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		29.2	■■■□□ 2.26
EML3-208	ENST00000462626	ZNF827	Q17R98	1081 aa		29.19	■■■□□ 2.26
EML3-208	ENST00000462626	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
EML3-208	ENST00000462626	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		29.19	■■■□□ 2.26
EML3-208	ENST00000462626	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
EML3-208	ENST00000462626	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		29.17	■■■□□ 2.26
EML3-208	ENST00000462626	AKT1S1	Q96B36	256 aa		29.16	■■■□□ 2.26
EML3-208	ENST00000462626	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	29.14	■■■□□ 2.26
EML3-208	ENST00000462626	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		29.14	■■■□□ 2.25
EML3-208	ENST00000462626	NCAPD2	Q15021	1401 aa		29.13	■■■□□ 2.25
EML3-208	ENST00000462626	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		29.13	■■■□□ 2.25
EML3-208	ENST00000462626	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		29.13	■■■□□ 2.25
EML3-208	ENST00000462626	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		29.12	■■■□□ 2.25
EML3-208	ENST00000462626	LY75	O60449	1722 aa		29.11	■■■□□ 2.25
EML3-208	ENST00000462626	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
EML3-208	ENST00000462626	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
EML3-208	ENST00000462626	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		29.1	■■■□□ 2.25
EML3-208	ENST00000462626	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
EML3-208	ENST00000462626	KCNQ4	P56696	695 aa		29.09	■■■□□ 2.25
EML3-208	ENST00000462626	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		29.08	■■■□□ 2.25
EML3-208	ENST00000462626	POLK	Q9UBT6	870 aa		29.08	■■■□□ 2.25
EML3-208	ENST00000462626	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		29.08	■■■□□ 2.25
EML3-208	ENST00000462626	CYP27B1	O15528	508 aa		29.07	■■■□□ 2.24
EML3-208	ENST00000462626	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
EML3-208	ENST00000462626	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		29.06	■■■□□ 2.24
EML3-208	ENST00000462626	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		29.06	■■■□□ 2.24
EML3-208	ENST00000462626	SYT17	Q9BSW7	474 aa		29.06	■■■□□ 2.24
EML3-208	ENST00000462626	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
EML3-208	ENST00000462626	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
EML3-208	ENST00000462626	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		29.04	■■■□□ 2.24
EML3-208	ENST00000462626	ARX	Q96QS3	562 aa		29.04	■■■□□ 2.24
EML3-208	ENST00000462626	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		29.04	■■■□□ 2.24
EML3-208	ENST00000462626	EYA1	Q99502	592 aa		29.03	■■■□□ 2.24
EML3-208	ENST00000462626	YY1	P25490	414 aa		29.02	■■■□□ 2.24
EML3-208	ENST00000462626	PANK3	Q9H999	370 aa		29.02	■■■□□ 2.24
EML3-208	ENST00000462626	MAP3K5	Q99683	1374 aa		29.01	■■■□□ 2.23
EML3-208	ENST00000462626	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		29	■■■□□ 2.23
EML3-208	ENST00000462626	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
EML3-208	ENST00000462626	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	28.99	■■■□□ 2.23	1e-8	■■■□□ 15.4
EML3-208	ENST00000462626	SPG7	Q9UQ90	795 aa		28.99	■■■□□ 2.23
EML3-208	ENST00000462626	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		28.98	■■■□□ 2.23
EML3-208	ENST00000462626	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		28.98	■■■□□ 2.23
EML3-208	ENST00000462626	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
EML3-208	ENST00000462626	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		28.98	■■■□□ 2.23
EML3-208	ENST00000462626	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
EML3-208	ENST00000462626	PALLD	Q8WX93	1383 aa		28.97	■■■□□ 2.23
EML3-208	ENST00000462626	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
EML3-208	ENST00000462626	POLD1	P28340	1107 aa		28.94	■■■□□ 2.22
EML3-208	ENST00000462626	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		28.93	■■■□□ 2.22
EML3-208	ENST00000462626	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
EML3-208	ENST00000462626	ITGB4	P16144	1822 aa		28.92	■■■□□ 2.22
EML3-208	ENST00000462626	PIGB	Q92521	554 aa		28.92	■■■□□ 2.22
EML3-208	ENST00000462626	C5	P01031	1676 aa		28.92	■■■□□ 2.22
EML3-208	ENST00000462626	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
EML3-208	ENST00000462626	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		28.9	■■■□□ 2.22
EML3-208	ENST00000462626	PHKG2	P15735	406 aa		28.89	■■■□□ 2.22
EML3-208	ENST00000462626	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		28.89	■■■□□ 2.22
EML3-208	ENST00000462626	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		28.87	■■■□□ 2.21
EML3-208	ENST00000462626	MORC1	Q86VD1	984 aa		28.86	■■■□□ 2.21
EML3-208	ENST00000462626	MSH5	O43196	834 aa		28.85	■■■□□ 2.21
EML3-208	ENST00000462626	UTRN	P46939	3433 aa		28.85	■■■□□ 2.21
EML3-208	ENST00000462626	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		28.84	■■■□□ 2.21
EML3-208	ENST00000462626	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		28.84	■■■□□ 2.21
EML3-208	ENST00000462626	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		28.84	■■■□□ 2.21
EML3-208	ENST00000462626	C4B	P0C0L5	1744 aa		28.83	■■■□□ 2.21
EML3-208	ENST00000462626	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		28.81	■■■□□ 2.2
EML3-208	ENST00000462626	SIK1	P57059	783 aa		28.81	■■■□□ 2.2
EML3-208	ENST00000462626	KLHL34	Q8N239	644 aa		28.81	■■■□□ 2.2
EML3-208	ENST00000462626	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		28.8	■■■□□ 2.2
EML3-208	ENST00000462626	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		28.8	■■■□□ 2.2
EML3-208	ENST00000462626	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
EML3-208	ENST00000462626	AK7	Q96M32	723 aa		28.79	■■■□□ 2.2
EML3-208	ENST00000462626	MSL1	Q68DK7	614 aa		28.78	■■■□□ 2.2
EML3-208	ENST00000462626	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		28.78	■■■□□ 2.2
EML3-208	ENST00000462626	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
EML3-208	ENST00000462626	ATG3	Q9NT62	314 aa		28.77	■■■□□ 2.2
EML3-208	ENST00000462626	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		28.76	■■■□□ 2.19
EML3-208	ENST00000462626	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		28.76	■■■□□ 2.19
EML3-208	ENST00000462626	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		28.75	■■■□□ 2.19
EML3-208	ENST00000462626	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
EML3-208	ENST00000462626	GPR162	Q16538	588 aa		28.75	■■■□□ 2.19
EML3-208	ENST00000462626	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		28.75	■■■□□ 2.19
EML3-208	ENST00000462626	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		28.75	■■■□□ 2.19
EML3-208	ENST00000462626	DCAF5	Q96JK2	942 aa		28.75	■■■□□ 2.19
EML3-208	ENST00000462626	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		28.74	■■■□□ 2.19
EML3-208	ENST00000462626	ITPK1	Q13572	414 aa		28.74	■■■□□ 2.19
EML3-208	ENST00000462626	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
EML3-208	ENST00000462626	SSFA2	P28290	1259 aa		28.72	■■■□□ 2.19

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