RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.41□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa6.41□□□□□ -1.38
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ECHDC1-211ENST00000460558 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
ECHDC1-211ENST00000460558 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa6.4□□□□□ -1.38
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ECHDC1-211ENST00000460558 TRIM37O94972 964 aa6.4□□□□□ -1.38
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ECHDC1-211ENST00000460558 ROBO2Q9HCK4 1378 aa6.31□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 FMN2Q9NZ56 1722 aa6.31□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 OATP04181 439 aa6.31□□□□□ -1.4
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ECHDC1-211ENST00000460558 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.3□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 MTFR1LQ9H019 292 aa6.3□□□□□ -1.4
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ECHDC1-211ENST00000460558 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 POTEJP0CG39 1038 aa6.29□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 PSME1Q06323 249 aa6.29□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 GPR153Q6NV75 609 aa6.29□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 IFT172Q9UG01 1749 aa6.29□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa6.28□□□□□ -1.4
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