RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453122.1

HJURP-208, Transcript of Holliday junction recognition protein, humanhuman

TSL 4

Gene HJURP, Length 634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURP-208ENST00000453122 PANK3Q9H999 370 aa23.08■■□□□ 1.29
HJURP-208ENST00000453122 NSD2O96028 1365 aa23.08■■□□□ 1.29
HJURP-208ENST00000453122 BTAF1O14981 1849 aa23.08■■□□□ 1.28
HJURP-208ENST00000453122 PROM2Q8N271 834 aa23.07■■□□□ 1.28
HJURP-208ENST00000453122 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
HJURP-208ENST00000453122 STK32BQ9NY57 414 aa23.06■■□□□ 1.28
HJURP-208ENST00000453122 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.05■■□□□ 1.28
HJURP-208ENST00000453122 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HJURP-208ENST00000453122 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.05■■□□□ 1.28
HJURP-208ENST00000453122 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.05■■□□□ 1.28
HJURP-208ENST00000453122 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.03■■□□□ 1.28
HJURP-208ENST00000453122 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
HJURP-208ENST00000453122 SPON1Q9HCB6 807 aa23.03■■□□□ 1.28
HJURP-208ENST00000453122 POLKQ9UBT6 870 aa23.03■■□□□ 1.28
HJURP-208ENST00000453122 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.03■■□□□ 1.28
HJURP-208ENST00000453122 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.03■■□□□ 1.28
HJURP-208ENST00000453122 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HJURP-208ENST00000453122 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.01■■□□□ 1.27
HJURP-208ENST00000453122 NCAPD2Q15021 1401 aa23■■□□□ 1.27
HJURP-208ENST00000453122 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
HJURP-208ENST00000453122 SLC15A2Q16348 729 aa23■■□□□ 1.27
HJURP-208ENST00000453122 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.99■■□□□ 1.27
HJURP-208ENST00000453122 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HJURP-208ENST00000453122 CASZ1Q86V15 1759 aa22.98■■□□□ 1.27
HJURP-208ENST00000453122 MORC1Q86VD1 984 aa22.97■■□□□ 1.27
HJURP-208ENST00000453122 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.97■■□□□ 1.27
HJURP-208ENST00000453122 PAPPAQ13219 1627 aa22.97■■□□□ 1.27
HJURP-208ENST00000453122 EYA1Q99502 592 aa22.96■■□□□ 1.27
HJURP-208ENST00000453122 SPG7Q9UQ90 795 aa22.96■■□□□ 1.27
HJURP-208ENST00000453122 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.96■■□□□ 1.27
HJURP-208ENST00000453122 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
HJURP-208ENST00000453122 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.92■■□□□ 1.26
HJURP-208ENST00000453122 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.92■■□□□ 1.26
HJURP-208ENST00000453122 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
HJURP-208ENST00000453122 CYP27B1O15528 508 aa22.91■■□□□ 1.26
HJURP-208ENST00000453122 LY75O60449 1722 aa22.91■■□□□ 1.26
HJURP-208ENST00000453122 ZBTB7AO95365 584 aa22.9■■□□□ 1.26
HJURP-208ENST00000453122 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HJURP-208ENST00000453122 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.88■■□□□ 1.25
HJURP-208ENST00000453122 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
HJURP-208ENST00000453122 MTFR1LQ9H019 292 aa22.88■■□□□ 1.25
HJURP-208ENST00000453122 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
HJURP-208ENST00000453122 ZNF827Q17R98 1081 aa22.87■■□□□ 1.25
HJURP-208ENST00000453122 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HJURP-208ENST00000453122 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HJURP-208ENST00000453122 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.86■■□□□ 1.25
HJURP-208ENST00000453122 AKT1S1Q96B36 256 aa22.86■■□□□ 1.25
HJURP-208ENST00000453122 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.85■■□□□ 1.25
HJURP-208ENST00000453122 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.85■■□□□ 1.25
HJURP-208ENST00000453122 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HJURP-208ENST00000453122 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HJURP-208ENST00000453122 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.84■■□□□ 1.25
HJURP-208ENST00000453122 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.84■■□□□ 1.25
HJURP-208ENST00000453122 PALLDQ8WX93 1383 aa22.83■■□□□ 1.25
HJURP-208ENST00000453122 ITGB4P16144 1822 aa22.82■■□□□ 1.24
HJURP-208ENST00000453122 PHKG2P15735 406 aa22.82■■□□□ 1.24
HJURP-208ENST00000453122 KCNQ4P56696 695 aa22.82■■□□□ 1.24
HJURP-208ENST00000453122 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.82■■□□□ 1.24
HJURP-208ENST00000453122 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.81■■□□□ 1.24
HJURP-208ENST00000453122 PTGER2P43116 358 aa22.81■■□□□ 1.24
HJURP-208ENST00000453122 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
HJURP-208ENST00000453122 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
HJURP-208ENST00000453122 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.8■■□□□ 1.24
HJURP-208ENST00000453122 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.8■■□□□ 1.24
HJURP-208ENST00000453122 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
HJURP-208ENST00000453122 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.79■■□□□ 1.24
HJURP-208ENST00000453122 C5P01031 1676 aa22.78■■□□□ 1.24
HJURP-208ENST00000453122 PIGBQ92521 554 aa22.78■■□□□ 1.24
HJURP-208ENST00000453122 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.77■■□□□ 1.24
HJURP-208ENST00000453122 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HJURP-208ENST00000453122 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.77■■□□□ 1.24
HJURP-208ENST00000453122 MTHFSP49914 203 aa22.76■■□□□ 1.23
HJURP-208ENST00000453122 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.76■■□□□ 1.23
HJURP-208ENST00000453122 POLD1P28340 1107 aa22.75■■□□□ 1.23
HJURP-208ENST00000453122 IL13P35225 146 aa22.75■■□□□ 1.23
HJURP-208ENST00000453122 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.75■■□□□ 1.23
HJURP-208ENST00000453122 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
HJURP-208ENST00000453122 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.74■■□□□ 1.23
HJURP-208ENST00000453122 DCAF5Q96JK2 942 aa22.74■■□□□ 1.23
HJURP-208ENST00000453122 ARXQ96QS3 562 aa22.74■■□□□ 1.23
HJURP-208ENST00000453122 KDRP35968 1356 aa22.74■■□□□ 1.23
HJURP-208ENST00000453122 MSH5O43196 834 aa22.73■■□□□ 1.23
HJURP-208ENST00000453122 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.73■■□□□ 1.23
HJURP-208ENST00000453122 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.73■■□□□ 1.23
HJURP-208ENST00000453122 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.73■■□□□ 1.23
HJURP-208ENST00000453122 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.72■■□□□ 1.23
HJURP-208ENST00000453122 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.71■■□□□ 1.23
HJURP-208ENST00000453122 SIK1P57059 783 aa22.71■■□□□ 1.23
HJURP-208ENST00000453122 AK7Q96M32 723 aa22.71■■□□□ 1.23
HJURP-208ENST00000453122 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
HJURP-208ENST00000453122 C4BP0C0L5 1744 aa22.7■■□□□ 1.22
HJURP-208ENST00000453122 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
HJURP-208ENST00000453122 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.69■■□□□ 1.22
HJURP-208ENST00000453122 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.68■■□□□ 1.22
HJURP-208ENST00000453122 MAP3K5Q99683 1374 aa22.68■■□□□ 1.22
HJURP-208ENST00000453122 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
HJURP-208ENST00000453122 SYT17Q9BSW7 474 aa22.68■■□□□ 1.22
HJURP-208ENST00000453122 CABP4P57796 275 aa22.67■■□□□ 1.22
HJURP-208ENST00000453122 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
HJURP-208ENST00000453122 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms