RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGAP5Q13017 1502 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARAP3Q8WWN8 1544 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 SOX11P35716 441 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTK2Q05397 1052 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC01559Q495D7 138 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEO1Q92859 1461 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 FYCO1Q9BQS8 1478 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 HECW2Q9P2P5 1572 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 GGCXP38435 758 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEMA3FQ13275 785 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARXQ96QS3 562 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAMTSL3P82987 1691 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLIP1P30622 1438 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC18Q5T9S5 1454 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABCA6Q8N139 1617 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A0G2JS52 829 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF511Q8NB15 262 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAM32Q8TC27 787 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 UCN2Q96RP3 112 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH3BP2P78314 561 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXJ1Q92949 421 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABCC1P33527 1531 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM32Q13049 653 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFFO2Q5TF58 517 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 CARD14Q9BXL6 1004 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3AP54-201ENST00000435535 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa7.15□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 TIAM1Q13009 1591 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 AGERQ15109 404 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEP162Q5TB80 1403 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 POGZQ7Z3K3 1410 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 AKNAQ7Z591 1439 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBTB33Q86T24 672 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 KDM5CP41229 1560 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYCP2Q9BX26 1530 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 YEATS2Q9ULM3 1422 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAPGEF3O95398 923 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 SKOR1P84550 965 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERFEQ4G0M1 354 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 HOMEZQ8IX15 550 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADGBQ8N7X0 1667 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLEKHD1A6NEE1 506 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIK3CDO00329 1044 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 RFX1P22670 979 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPIAP49247 311 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 C3P01024 1663 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 PREX1Q8TCU6 1659 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM174AQ8TBP5 190 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLCH2O75038 1416 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCAPERQ9BY12 1400 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP9BO43861 1147 aa7.09□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 WNT7BP56706 349 aa7.09□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RPS3AP54-201ENST00000435535 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RPS3AP54-201ENST00000435535 SKIP12755 728 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF592Q92610 1267 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTPRMP28827 1452 aa7.08□□□□□ -1.28
RPS3AP54-201ENST00000435535 CROCC2H7BZ55 1655 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms