RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 MTMR7Q9Y216 660 aa13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 SPC24Q8NBT2 197 aa13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 POGZQ7Z3K3 1410 aa13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 NLRP6P59044 892 aa13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC112Q8NEF3 446 aa13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP10AO60312 1499 aa13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM10P98175 930 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 CD109Q6YHK3 1445 aa13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 SCAPERQ9BY12 1400 aa13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINC1P01008 464 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT85P78386 507 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 IKQ13123 557 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 GAS2L2Q8NHY3 880 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 HECW2Q9P2P5 1572 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 WASHC2AQ641Q2 1341 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 KDM4AO75164 1064 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 PRKAR2BP31323 418 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 BACH2Q9BYV9 841 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 GNAI2P04899 355 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 SKIDA1Q1XH10 827 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 ERC1Q8IUD2 1116 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 IL27Q8NEV9 243 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 CABP2Q9NPB3 220 aa13.04□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa13.04□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 MLH3Q9UHC1 1453 aa13.04□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 ME1P48163 572 aa13.04□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 TNMDQ9H2S6 317 aa13.04□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 TET3O43151 1660 aa13.04□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa13.04□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 NEFHP12036 1026 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 AEBP1Q8IUX7 1158 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 PPFIBP1Q86W92 1011 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 MPNDQ8N594 471 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 GRPEL1Q9HAV7 217 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP152O94986 1710 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP2R1AP30153 589 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD1Q15327 319 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 NBPF8Q3BBV2 869 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 NEO1Q92859 1461 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 ESPNB1AK53 854 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 ERLIN2O94905 339 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 SYCP1Q15431 976 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM132EQ6IEE7 984 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 C1orf115Q9H7X2 142 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 ERLIN1O75477 346 aa13.02□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM22Q8IYM9 498 aa13.02□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA6L10A6NI86 522 aa13.02□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT18P05783 430 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 NUTM2GQ5VZR2 741 aa13.01□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA0754O94854 1291 aa13.01□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 STIM1Q13586 685 aa13.01□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa13.01□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 DACH1Q9UI36 760 aa13.01□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 CLTCL1P53675 1640 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 MCM4P33991 863 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 CYB5RLQ6IPT4 315 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 BCAR3O75815 825 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 DEF6Q9H4E7 631 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPOAP1O95153 1857 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC4A2P04920 1241 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC181Q5TID7 509 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 PAF1Q8N7H5 531 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 IFT172Q9UG01 1749 aa12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRCC1Q9C099 1032 aa12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 LMTK2Q8IWU2 1503 aa12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC158Q5M9N0 1113 aa12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 CFAP70Q5T0N1 1121 aa12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP57L1Q8IYX8 460 aa12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 PDCL3Q9H2J4 239 aa12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms