RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 RALBP1Q15311 655 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRC-206ENST00000413409 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRC-206ENST00000413409 ABCC6O95255 1503 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRC-206ENST00000413409 KCNQ4P56696 695 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRC-206ENST00000413409 CCDC184Q52MB2 194 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRC-206ENST00000413409 ADCY9O60503 1353 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRC-206ENST00000413409 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRC-206ENST00000413409 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRC-206ENST00000413409 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRC-206ENST00000413409 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRC-206ENST00000413409 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
PTPRC-206ENST00000413409 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.08■■□□□ 1.28
PTPRC-206ENST00000413409 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
PTPRC-206ENST00000413409 NFAT5O94916 1531 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRC-206ENST00000413409 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRC-206ENST00000413409 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
PTPRC-206ENST00000413409 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRC-206ENST00000413409 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PTPRC-206ENST00000413409 IL2RBP14784 551 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRC-206ENST00000413409 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRC-206ENST00000413409 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRC-206ENST00000413409 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRC-206ENST00000413409 KIF3CO14782 793 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRC-206ENST00000413409 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PTPRC-206ENST00000413409 ERBB3P21860 1342 aa23■■□□□ 1.27
PTPRC-206ENST00000413409 MSL1Q68DK7 614 aa23■■□□□ 1.27
PTPRC-206ENST00000413409 PANK3Q9H999 370 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRC-206ENST00000413409 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRC-206ENST00000413409 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRC-206ENST00000413409 MSH5O43196 834 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRC-206ENST00000413409 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRC-206ENST00000413409 INSRP06213 1382 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRC-206ENST00000413409 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRC-206ENST00000413409 APLP1P51693 650 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRC-206ENST00000413409 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRC-206ENST00000413409 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRC-206ENST00000413409 TMC1Q8TDI8 760 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRC-206ENST00000413409 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRC-206ENST00000413409 NSD2O96028 1365 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRC-206ENST00000413409 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRC-206ENST00000413409 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRC-206ENST00000413409 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRC-206ENST00000413409 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRC-206ENST00000413409 LY75O60449 1722 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRC-206ENST00000413409 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRC-206ENST00000413409 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPRC-206ENST00000413409 CAPN15O75808 1086 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRC-206ENST00000413409 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRC-206ENST00000413409 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPRC-206ENST00000413409 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRC-206ENST00000413409 EVC2Q86UK5 1308 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRC-206ENST00000413409 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRC-206ENST00000413409 USP31Q70CQ4 1352 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRC-206ENST00000413409 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRC-206ENST00000413409 NEFLP07196 543 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRC-206ENST00000413409 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
PTPRC-206ENST00000413409 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRC-206ENST00000413409 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRC-206ENST00000413409 NME9Q86XW9 330 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRC-206ENST00000413409 LTN1O94822 1766 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRC-206ENST00000413409 TOMM70O94826 608 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRC-206ENST00000413409 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRC-206ENST00000413409 PCNTO95613 3336 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRC-206ENST00000413409 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRC-206ENST00000413409 HTRA3P83110 453 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRC-206ENST00000413409 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRC-206ENST00000413409 USP54Q70EL1 1684 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRC-206ENST00000413409 PRELPP51888 382 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRC-206ENST00000413409 JMYQ8N9B5 988 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRC-206ENST00000413409 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRC-206ENST00000413409 SMIM5Q71RC9 77 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRC-206ENST00000413409 KLRG1Q96E93 195 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRC-206ENST00000413409 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRC-206ENST00000413409 TNS4Q8IZW8 715 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRC-206ENST00000413409 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRC-206ENST00000413409 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRC-206ENST00000413409 IP6K1Q92551 441 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRC-206ENST00000413409 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRC-206ENST00000413409 WDR90Q96KV7 1748 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRC-206ENST00000413409 C5P01031 1676 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRC-206ENST00000413409 PPP2R1AP30153 589 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRC-206ENST00000413409 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRC-206ENST00000413409 FKBP8Q14318 412 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRC-206ENST00000413409 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRC-206ENST00000413409 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRC-206ENST00000413409 MEGF6O75095 1541 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRC-206ENST00000413409 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRC-206ENST00000413409 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRC-206ENST00000413409 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRC-206ENST00000413409 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRC-206ENST00000413409 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRC-206ENST00000413409 NUDCQ9Y266 331 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRC-206ENST00000413409 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRC-206ENST00000413409 PHF14O94880 888 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRC-206ENST00000413409 PALLDQ8WX93 1383 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRC-206ENST00000413409 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRC-206ENST00000413409 C4BP0C0L5 1744 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRC-206ENST00000413409 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms