RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403904.5

CSNK1E-204, Transcript of casein kinase 1 epsilon, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1E-204ENST00000403904 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
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CSNK1E-204ENST00000403904 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP44.18■■■■■ 4.66
CSNK1E-204ENST00000403904 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa44.17■■■■■ 4.66
CSNK1E-204ENST00000403904 RXRBP28702 533 aa44.16■■■■■ 4.66
CSNK1E-204ENST00000403904 A0A0G2JS52 829 aa44.14■■■■■ 4.66
CSNK1E-204ENST00000403904 MYT1Q01538 1121 aa44.14■■■■■ 4.66
CSNK1E-204ENST00000403904 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP44.14■■■■■ 4.66
CSNK1E-204ENST00000403904 RUNDC1Q96C34 613 aa44.13■■■■■ 4.65
CSNK1E-204ENST00000403904 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa44.12■■■■■ 4.65
CSNK1E-204ENST00000403904 NEFMP07197 916 aa44.11■■■■■ 4.65
CSNK1E-204ENST00000403904 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa44.11■■■■■ 4.65
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CSNK1E-204ENST00000403904 PKD1L3Q7Z443 1732 aa44.09■■■■■ 4.65
CSNK1E-204ENST00000403904 LRRC37A3O60309 1634 aa44.08■■■■■ 4.65
CSNK1E-204ENST00000403904 EXOC5O00471 708 aa44.07■■■■■ 4.65
CSNK1E-204ENST00000403904 DDB1Q16531 1140 aa44.07■■■■■ 4.65
CSNK1E-204ENST00000403904 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP44.07■■■■■ 4.65
CSNK1E-204ENST00000403904 AMOTQ4VCS5 1084 aa44.07■■■■■ 4.65
CSNK1E-204ENST00000403904 SEPT12Q8IYM1 358 aa44.07■■■■■ 4.65
CSNK1E-204ENST00000403904 SPG7Q9UQ90 795 aa44.07■■■■■ 4.65
CSNK1E-204ENST00000403904 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa44.06■■■■■ 4.64
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CSNK1E-204ENST00000403904 SHANK3Q9BYB0 1731 aa44.04■■■■■ 4.64
CSNK1E-204ENST00000403904 TNS2Q63HR2 1409 aa44.03■■■■■ 4.64
CSNK1E-204ENST00000403904 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa44.01■■■■■ 4.64
CSNK1E-204ENST00000403904 APAF1O14727 1248 aa44.01■■■■■ 4.64
CSNK1E-204ENST00000403904 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP44.01■■■■■ 4.64
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CSNK1E-204ENST00000403904 GAS2L2Q8NHY3 880 aa43.99■■■■■ 4.63
CSNK1E-204ENST00000403904 CYP27B1O15528 508 aa43.97■■■■■ 4.63
CSNK1E-204ENST00000403904 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa43.97■■■■■ 4.63
CSNK1E-204ENST00000403904 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa43.97■■■■■ 4.63
CSNK1E-204ENST00000403904 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP43.97■■■■■ 4.63
CSNK1E-204ENST00000403904 NFE2L2Q16236 605 aa43.96■■■■■ 4.63
CSNK1E-204ENST00000403904 BRWD3Q6RI45 1802 aa43.96■■■■■ 4.63
CSNK1E-204ENST00000403904 RGS12O14924 1447 aa43.95■■■■■ 4.63
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CSNK1E-204ENST00000403904 PDE3BQ13370 1112 aa43.94■■■■■ 4.62
CSNK1E-204ENST00000403904 NEUROD2Q15784 382 aa43.94■■■■■ 4.62
CSNK1E-204ENST00000403904 DLG5Q8TDM6 1919 aa43.93■■■■■ 4.62
CSNK1E-204ENST00000403904 PHKG2P15735 406 aa43.92■■■■■ 4.62
CSNK1E-204ENST00000403904 C1orf141Q5JVX7 400 aa43.92■■■■■ 4.62
CSNK1E-204ENST00000403904 IFNL2Q8IZJ0 200 aa43.92■■■■■ 4.62
CSNK1E-204ENST00000403904 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP43.91■■■■■ 4.62
CSNK1E-204ENST00000403904 AKAP4Q5JQC9 854 aa43.9■■■■■ 4.62
CSNK1E-204ENST00000403904 RIPK4P57078 832 aa43.89■■■■■ 4.62
CSNK1E-204ENST00000403904 GNAT3A8MTJ3 354 aa43.86■■■■■ 4.61
CSNK1E-204ENST00000403904 MAP3K5Q99683 1374 aa43.85■■■■■ 4.61
CSNK1E-204ENST00000403904 KRT27Q7Z3Y8 459 aa43.84■■■■■ 4.61
CSNK1E-204ENST00000403904 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP43.84■■■■■ 4.61
CSNK1E-204ENST00000403904 FAM182BQ5T319 152 aa43.84■■■■■ 4.61
CSNK1E-204ENST00000403904 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa43.82■■■■■ 4.61
CSNK1E-204ENST00000403904 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP43.8■■■■■ 4.6
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CSNK1E-204ENST00000403904 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP43.78■■■■■ 4.6
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CSNK1E-204ENST00000403904 EP400Q96L91 3159 aa43.77■■■■■ 4.6
CSNK1E-204ENST00000403904 LGR6Q9HBX8 967 aa43.77■■■■■ 4.6
CSNK1E-204ENST00000403904 MCM10Q7L590 875 aa43.76■■■■■ 4.6
CSNK1E-204ENST00000403904 DCAF5Q96JK2 942 aa43.76■■■■■ 4.6
CSNK1E-204ENST00000403904 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP43.76■■■■■ 4.6
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CSNK1E-204ENST00000403904 KAT6BQ8WYB5 2073 aa43.74■■■■■ 4.59
CSNK1E-204ENST00000403904 SCN11AQ9UI33 1791 aa43.73■■■■■ 4.59
CSNK1E-204ENST00000403904 LMOD3Q0VAK6 560 aa43.73■■■■■ 4.59
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CSNK1E-204ENST00000403904 NGEFQ8N5V2 710 aa43.67■■■■■ 4.58
CSNK1E-204ENST00000403904 DOT1LQ8TEK3 1739 aa43.67■■■■■ 4.58
CSNK1E-204ENST00000403904 WWC1Q8IX03 1113 aa43.67■■■■■ 4.58
CSNK1E-204ENST00000403904 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa43.66■■■■■ 4.58
CSNK1E-204ENST00000403904 ACSBG1Q96GR2 724 aa43.66■■■■■ 4.58
CSNK1E-204ENST00000403904 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP43.65■■■■■ 4.58
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CSNK1E-204ENST00000403904 ERVV-2B6SEH9 535 aa43.61■■■■■ 4.57
CSNK1E-204ENST00000403904 SBF2Q86WG5 1849 aa43.6■■■■■ 4.57
CSNK1E-204ENST00000403904 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP43.6■■■■■ 4.57
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CSNK1E-204ENST00000403904 TEFQ10587 303 aa43.59■■■■■ 4.57
CSNK1E-204ENST00000403904 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa43.58■■■■■ 4.57
CSNK1E-204ENST00000403904 SLC52A2Q9HAB3 445 aa43.58■■■■■ 4.57
CSNK1E-204ENST00000403904 KCNQ2O43526 872 aa43.57■■■■■ 4.57
CSNK1E-204ENST00000403904 MRC1P22897 1456 aa43.55■■■■■ 4.56
CSNK1E-204ENST00000403904 ZNF521Q96K83 1311 aa43.55■■■■■ 4.56
CSNK1E-204ENST00000403904 TMOD3Q9NYL9 352 aa43.54■■■■■ 4.56
CSNK1E-204ENST00000403904 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP43.54■■■■■ 4.56
CSNK1E-204ENST00000403904 NHSQ6T4R5 1651 aa43.52■■■■■ 4.56
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