RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381222.8

ZBED1-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 4,507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-202ENST00000381222 AACSQ86V21 672 aa18.05■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 KDM5CP41229 1560 aa18.05■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 IL13P35225 146 aa18.04■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 BRPF3Q9ULD4 1205 aa18.04■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 PREX2Q70Z35 1606 aa18.04■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 TSPOAP1O95153 1857 aa18.04■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 CHPF2Q9P2E5 772 aa18.04■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 DRC7Q8IY82 874 aa18.03■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 RUFY2Q8WXA3 655 aa18.03■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 MYD88Q99836 296 aa18.03■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 ERC2O15083 957 aa18.02■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 C8orf34Q49A92 452 aa18.02■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 ERVK-7P63135 1459 aa18.02■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 NINLQ9Y2I6 1382 aa18.02■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 ZBTB3Q9H5J0 574 aa18.02■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa18.02■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 TBC1D2Q9BYX2 928 aa18.02■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 GCP02774 474 aa18.01■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 DDX11L8A8MPP1 907 aa18.01■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 STK3Q13188 491 aa18.01■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 CNTROBQ8N137 903 aa18.01■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 BCORL1Q5H9F3 1711 aa18■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 RNF214Q8ND24 703 aa18■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 FBXW7Q969H0 707 aa18■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 BOLA2Q9H3K6 86 aa18■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 H3BQV1 296 aa18■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 IFFO2Q5TF58 517 aa18■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 FAM184AQ8NB25 1140 aa18■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 DNAAF4Q8WXU2 420 aa18■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa18■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 CHMP4CQ96CF2 233 aa17.99■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 LGR6Q9HBX8 967 aa17.99■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa17.99■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 TRAK2O60296 914 aa17.99■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 MPNDQ8N594 471 aa17.99■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa17.98■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 TBX22Q9Y458 520 aa17.98■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 MSNP26038 577 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 HOXC9P31274 260 aa17.98■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 BICDL1Q6ZP65 573 aa17.98■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 IL27Q8NEV9 243 aa17.98■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 MX1P20591 662 aa17.98■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 SMC3Q9UQE7 1217 aa17.98■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 DTNBO60941 627 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 GPTP24298 496 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 KDM5DQ9BY66 1539 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 PPFIA3O75145 1194 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 IL16Q14005 1332 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 MTMR7Q9Y216 660 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1-202ENST00000381222 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 VPS37DQ86XT2 251 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 TMEM2Q9UHN6 1383 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 RNF123Q5XPI4 1314 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 PRR36Q9H6K5 1346 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 NEO1Q92859 1461 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 NBPF6Q5VWK0 638 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 NBPF4Q96M43 638 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 CNNM1Q9NRU3 951 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 A0A087WZG4 1122 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 AMOTQ4VCS5 1084 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 TTC21AQ8NDW8 1320 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 NUCB1Q02818 461 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 RABEP1Q15276 862 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 FLT4P35916 1363 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 FIBPO43427 364 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 KIF6Q6ZMV9 814 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 COPS6Q7L5N1 327 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 KCNQ3O43525 872 aa17.91■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 SDSP20132 328 aa17.91■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 RNF20Q5VTR2 975 aa17.91■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 CREBRFQ8IUR6 639 aa17.91■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 ROBO2Q9HCK4 1378 aa17.91■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 CADPS2Q86UW7 1296 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 TRPM2O94759 1503 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
ZBED1-202ENST00000381222 XAGE3Q8WTP9 111 aa17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 172.1 ms