RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361219.10

SERBP1-201, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SERBP1, Length 2,103 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1-201ENST00000361219 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
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SERBP1-201ENST00000361219 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SERBP1-201ENST00000361219 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
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SERBP1-201ENST00000361219 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.43■■□□□ 1.66
SERBP1-201ENST00000361219 MYT1Q01538 1121 aa25.43■■□□□ 1.66
SERBP1-201ENST00000361219 IP6K1Q92551 441 aa25.43■■□□□ 1.66
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SERBP1-201ENST00000361219 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SERBP1-201ENST00000361219 ORAI2Q96SN7 254 aa25.42■■□□□ 1.66
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SERBP1-201ENST00000361219 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.38■■□□□ 1.65
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SERBP1-201ENST00000361219 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.37■■□□□ 1.65
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SERBP1-201ENST00000361219 RGS12O14924 1447 aa25.36■■□□□ 1.65
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SERBP1-201ENST00000361219 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.34■■□□□ 1.65
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SERBP1-201ENST00000361219 MST1RQ04912 1400 aa25.33■■□□□ 1.65
SERBP1-201ENST00000361219 USP19O94966 1318 aa25.32■■□□□ 1.64
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SERBP1-201ENST00000361219 DCCP43146 1447 aa25.31■■□□□ 1.64
SERBP1-201ENST00000361219 ALS2Q96Q42 1657 aa25.3■■□□□ 1.64
SERBP1-201ENST00000361219 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.3■■□□□ 1.64
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SERBP1-201ENST00000361219 NBPF4Q96M43 638 aa25.3■■□□□ 1.64
SERBP1-201ENST00000361219 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.3■■□□□ 1.64
SERBP1-201ENST00000361219 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.3■■□□□ 1.64
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SERBP1-201ENST00000361219 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.29■■□□□ 1.64
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SERBP1-201ENST00000361219 NCAPD2Q15021 1401 aa25.28■■□□□ 1.64
SERBP1-201ENST00000361219 GCC1Q96CN9 775 aa25.28■■□□□ 1.64
SERBP1-201ENST00000361219 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.28■■□□□ 1.64
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SERBP1-201ENST00000361219 TMEM94Q12767 1356 aa25.28■■□□□ 1.64
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SERBP1-201ENST00000361219 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.23■■□□□ 1.63
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SERBP1-201ENST00000361219 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.2■■□□□ 1.62
SERBP1-201ENST00000361219 ATP10DQ9P241 1426 aa25.2■■□□□ 1.62
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SERBP1-201ENST00000361219 G2E3Q7L622 706 aa25.18■■□□□ 1.62
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SERBP1-201ENST00000361219 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.16■■□□□ 1.62
SERBP1-201ENST00000361219 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.16■■□□□ 1.62
SERBP1-201ENST00000361219 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.16■■□□□ 1.62
SERBP1-201ENST00000361219 STRCQ7RTU9 1775 aa25.16■■□□□ 1.62
SERBP1-201ENST00000361219 HSPA2P54652 639 aa25.15■■□□□ 1.62
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SERBP1-201ENST00000361219 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.13■■□□□ 1.61
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SERBP1-201ENST00000361219 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SERBP1-201ENST00000361219 PXDNQ92626 1479 aa25.13■■□□□ 1.61
SERBP1-201ENST00000361219 MEIS3Q99687 375 aa25.13■■□□□ 1.61
SERBP1-201ENST00000361219 LGR6Q9HBX8 967 aa25.13■■□□□ 1.61
SERBP1-201ENST00000361219 FLIIQ13045 1269 aa25.12■■□□□ 1.61
SERBP1-201ENST00000361219 CEP85Q6P2H3 762 aa25.12■■□□□ 1.61
SERBP1-201ENST00000361219 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.12■■□□□ 1.61
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