RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.65■■□□□ 1.54
UPP1-201ENST00000331803 TSPYL6Q8N831 410 aa24.65■■□□□ 1.54
UPP1-201ENST00000331803 ERBB3P21860 1342 aa24.63■■□□□ 1.53
UPP1-201ENST00000331803 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
UPP1-201ENST00000331803 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.63■■□□□ 1.53
UPP1-201ENST00000331803 COG6Q9Y2V7 657 aa24.63■■□□□ 1.53
UPP1-201ENST00000331803 NCAPD2Q15021 1401 aa24.62■■□□□ 1.53
UPP1-201ENST00000331803 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
UPP1-201ENST00000331803 MAP3K5Q99683 1374 aa24.62■■□□□ 1.53
UPP1-201ENST00000331803 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.61■■□□□ 1.53
UPP1-201ENST00000331803 TNNQ9UQP3 1299 aa24.61■■□□□ 1.53
UPP1-201ENST00000331803 RGPD5Q99666 1765 aa24.61■■□□□ 1.53
UPP1-201ENST00000331803 RLBP1P12271 317 aa24.61■■□□□ 1.53
UPP1-201ENST00000331803 MS4A1P11836 297 aa24.6■■□□□ 1.53
UPP1-201ENST00000331803 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.6■■□□□ 1.53
UPP1-201ENST00000331803 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
UPP1-201ENST00000331803 KIF16BQ96L93 1317 aa24.6■■□□□ 1.53
UPP1-201ENST00000331803 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
UPP1-201ENST00000331803 CPDO75976 1380 aa24.59■■□□□ 1.53
UPP1-201ENST00000331803 IL17REQ8NFR9 667 aa24.58■■□□□ 1.53
UPP1-201ENST00000331803 KIAA0232Q92628 1395 aa24.58■■□□□ 1.53
UPP1-201ENST00000331803 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.58■■□□□ 1.53
UPP1-201ENST00000331803 COL18A1P39060 1754 aa24.58■■□□□ 1.53
UPP1-201ENST00000331803 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 TRIM27P14373 513 aa24.57■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 CHRNA2Q15822 529 aa24.57■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.57■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.57■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.57■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.57■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.56■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 ABCC6O95255 1503 aa24.56■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.55■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.54■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 LRRC37A3O60309 1634 aa24.54■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 AAMPQ13685 434 aa24.53■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 KRT24Q2M2I5 525 aa24.53■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.53■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.52■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.52■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.52■■□□□ 1.52
UPP1-201ENST00000331803 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
UPP1-201ENST00000331803 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.51■■□□□ 1.51
UPP1-201ENST00000331803 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.51■■□□□ 1.51
UPP1-201ENST00000331803 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.51■■□□□ 1.51
UPP1-201ENST00000331803 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
UPP1-201ENST00000331803 ARHGAP45Q92619 1136 aa24.5■■□□□ 1.51
UPP1-201ENST00000331803 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.5■■□□□ 1.51
UPP1-201ENST00000331803 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
UPP1-201ENST00000331803 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.49■■□□□ 1.51
UPP1-201ENST00000331803 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.48■■□□□ 1.51
UPP1-201ENST00000331803 LGR6Q9HBX8 967 aa24.48■■□□□ 1.51
UPP1-201ENST00000331803 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
UPP1-201ENST00000331803 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.45■■□□□ 1.51
UPP1-201ENST00000331803 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.45■■□□□ 1.51
UPP1-201ENST00000331803 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.45■■□□□ 1.51
UPP1-201ENST00000331803 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
UPP1-201ENST00000331803 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.45■■□□□ 1.5
UPP1-201ENST00000331803 ABCA3Q99758 1704 aa24.44■■□□□ 1.5
UPP1-201ENST00000331803 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.44■■□□□ 1.5
UPP1-201ENST00000331803 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
UPP1-201ENST00000331803 TEFQ10587 303 aa24.42■■□□□ 1.5
UPP1-201ENST00000331803 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.5
UPP1-201ENST00000331803 IGHDP01880 384 aa24.41■■□□□ 1.5
UPP1-201ENST00000331803 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
UPP1-201ENST00000331803 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.41■■□□□ 1.5
UPP1-201ENST00000331803 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.4■■□□□ 1.5
UPP1-201ENST00000331803 SPG7Q9UQ90 795 aa24.4■■□□□ 1.5
UPP1-201ENST00000331803 MEGF6O75095 1541 aa24.4■■□□□ 1.5
UPP1-201ENST00000331803 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.39■■□□□ 1.5
UPP1-201ENST00000331803 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.39■■□□□ 1.5
UPP1-201ENST00000331803 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
UPP1-201ENST00000331803 ABCC4O15439 1325 aa24.38■■□□□ 1.49
UPP1-201ENST00000331803 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
UPP1-201ENST00000331803 SLC4A2P04920 1241 aa24.38■■□□□ 1.49
UPP1-201ENST00000331803 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
UPP1-201ENST00000331803 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.37■■□□□ 1.49
UPP1-201ENST00000331803 BTBD11A6QL63 1104 aa24.37■■□□□ 1.49
UPP1-201ENST00000331803 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.35■■□□□ 1.49
UPP1-201ENST00000331803 PTPRCP08575 1304 aa24.35■■□□□ 1.49
UPP1-201ENST00000331803 PHKG2P15735 406 aa24.35■■□□□ 1.49
UPP1-201ENST00000331803 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.35■■□□□ 1.49
UPP1-201ENST00000331803 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
UPP1-201ENST00000331803 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.34■■□□□ 1.49
UPP1-201ENST00000331803 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
UPP1-201ENST00000331803 EVA1CP58658 441 aa24.33■■□□□ 1.49
UPP1-201ENST00000331803 STK31Q9BXU1 1019 aa24.33■■□□□ 1.49
UPP1-201ENST00000331803 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
UPP1-201ENST00000331803 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
UPP1-201ENST00000331803 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.33■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.32■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 SKAP1Q86WV1 359 aa24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms