RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
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SHQ1-201ENST00000325599 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
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SHQ1-201ENST00000325599 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.22■□□□□ 0.83
SHQ1-201ENST00000325599 ANKARQ7Z5J8 1434 aa20.2■□□□□ 0.82
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SHQ1-201ENST00000325599 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.2■□□□□ 0.82
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