RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 IL13P35225 146 aa23.8■■□□□ 1.4
SYNE4-201ENST00000324444 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SYNE4-201ENST00000324444 TRIM37O94972 964 aa23.78■■□□□ 1.4
SYNE4-201ENST00000324444 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.78■■□□□ 1.4
SYNE4-201ENST00000324444 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.77■■□□□ 1.4
SYNE4-201ENST00000324444 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SYNE4-201ENST00000324444 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
SYNE4-201ENST00000324444 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.76■■□□□ 1.39
SYNE4-201ENST00000324444 NCAPD2Q15021 1401 aa23.75■■□□□ 1.39
SYNE4-201ENST00000324444 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SYNE4-201ENST00000324444 ERBB3P21860 1342 aa23.74■■□□□ 1.39
SYNE4-201ENST00000324444 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.73■■□□□ 1.39
SYNE4-201ENST00000324444 DISP2A7MBM2 1401 aa23.73■■□□□ 1.39
SYNE4-201ENST00000324444 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.73■■□□□ 1.39
SYNE4-201ENST00000324444 DDB1Q16531 1140 aa23.72■■□□□ 1.39
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.72■■□□□ 1.39
SYNE4-201ENST00000324444 LRRC37A3O60309 1634 aa23.71■■□□□ 1.39
SYNE4-201ENST00000324444 APAF1O14727 1248 aa23.71■■□□□ 1.39
SYNE4-201ENST00000324444 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.71■■□□□ 1.39
SYNE4-201ENST00000324444 KDRP35968 1356 aa23.71■■□□□ 1.39
SYNE4-201ENST00000324444 APBA3O96018 575 aa23.7■■□□□ 1.38
SYNE4-201ENST00000324444 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
SYNE4-201ENST00000324444 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.69■■□□□ 1.38
SYNE4-201ENST00000324444 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.69■■□□□ 1.38
SYNE4-201ENST00000324444 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC27Q2M243 656 aa23.68■■□□□ 1.38
SYNE4-201ENST00000324444 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.68■■□□□ 1.38
SYNE4-201ENST00000324444 EYA1Q99502 592 aa23.68■■□□□ 1.38
SYNE4-201ENST00000324444 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.68■■□□□ 1.38
SYNE4-201ENST00000324444 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SYNE4-201ENST00000324444 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.66■■□□□ 1.38
SYNE4-201ENST00000324444 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.66■■□□□ 1.38
SYNE4-201ENST00000324444 PRKAR2BP31323 418 aa23.65■■□□□ 1.38
SYNE4-201ENST00000324444 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SYNE4-201ENST00000324444 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.65■■□□□ 1.38
SYNE4-201ENST00000324444 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.65■■□□□ 1.38
SYNE4-201ENST00000324444 NBPF4Q96M43 638 aa23.65■■□□□ 1.38
SYNE4-201ENST00000324444 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
SYNE4-201ENST00000324444 HMOX1P09601 288 aa23.63■■□□□ 1.37
SYNE4-201ENST00000324444 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.63■■□□□ 1.37
SYNE4-201ENST00000324444 EXOC5O00471 708 aa23.62■■□□□ 1.37
SYNE4-201ENST00000324444 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.62■■□□□ 1.37
SYNE4-201ENST00000324444 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SYNE4-201ENST00000324444 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SYNE4-201ENST00000324444 GOLGA2Q08379 1002 aa23.61■■□□□ 1.37
SYNE4-201ENST00000324444 WDR63Q8IWG1 891 aa23.61■■□□□ 1.37
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF521Q96K83 1311 aa23.59■■□□□ 1.37
SYNE4-201ENST00000324444 NFE2L2Q16236 605 aa23.59■■□□□ 1.37
SYNE4-201ENST00000324444 TNS2Q63HR2 1409 aa23.59■■□□□ 1.37
SYNE4-201ENST00000324444 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SYNE4-201ENST00000324444 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SYNE4-201ENST00000324444 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.58■■□□□ 1.37
SYNE4-201ENST00000324444 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.58■■□□□ 1.36
SYNE4-201ENST00000324444 SBF2Q86WG5 1849 aa23.57■■□□□ 1.36
SYNE4-201ENST00000324444 IL2RBP14784 551 aa23.57■■□□□ 1.36
SYNE4-201ENST00000324444 WWC1Q8IX03 1113 aa23.57■■□□□ 1.36
SYNE4-201ENST00000324444 RIPK4P57078 832 aa23.56■■□□□ 1.36
SYNE4-201ENST00000324444 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SYNE4-201ENST00000324444 BCL9O00512 1426 aa23.55■■□□□ 1.36
SYNE4-201ENST00000324444 RREB1Q92766 1687 aa23.55■■□□□ 1.36
SYNE4-201ENST00000324444 E9PSI1 815 aa23.55■■□□□ 1.36
SYNE4-201ENST00000324444 NEUROD2Q15784 382 aa23.55■■□□□ 1.36
SYNE4-201ENST00000324444 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.55■■□□□ 1.36
SYNE4-201ENST00000324444 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.55■■□□□ 1.36
SYNE4-201ENST00000324444 MEGF6O75095 1541 aa23.54■■□□□ 1.36
SYNE4-201ENST00000324444 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.54■■□□□ 1.36
SYNE4-201ENST00000324444 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.53■■□□□ 1.36
SYNE4-201ENST00000324444 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SYNE4-201ENST00000324444 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.52■■□□□ 1.36
SYNE4-201ENST00000324444 IL16Q14005 1332 aa23.52■■□□□ 1.36
SYNE4-201ENST00000324444 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.52■■□□□ 1.36
SYNE4-201ENST00000324444 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.5■■□□□ 1.35
SYNE4-201ENST00000324444 PLSCR1O15162 318 aa23.5■■□□□ 1.35
SYNE4-201ENST00000324444 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SYNE4-201ENST00000324444 SLFN5Q08AF3 891 aa23.5■■□□□ 1.35
SYNE4-201ENST00000324444 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.5■■□□□ 1.35
SYNE4-201ENST00000324444 NBPF14Q5TI25 921 aa23.5■■□□□ 1.35
SYNE4-201ENST00000324444 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.5■■□□□ 1.35
SYNE4-201ENST00000324444 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.49■■□□□ 1.35
SYNE4-201ENST00000324444 LRP5O75197 1615 aa23.48■■□□□ 1.35
SYNE4-201ENST00000324444 KCNQ2O43526 872 aa23.47■■□□□ 1.35
SYNE4-201ENST00000324444 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SYNE4-201ENST00000324444 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.47■■□□□ 1.35
SYNE4-201ENST00000324444 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.47■■□□□ 1.35
SYNE4-201ENST00000324444 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SYNE4-201ENST00000324444 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.47■■□□□ 1.35
SYNE4-201ENST00000324444 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SYNE4-201ENST00000324444 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.46■■□□□ 1.35
SYNE4-201ENST00000324444 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SYNE4-201ENST00000324444 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SYNE4-201ENST00000324444 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.44■■□□□ 1.34
SYNE4-201ENST00000324444 NHSQ6T4R5 1651 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNE4-201ENST00000324444 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SYNE4-201ENST00000324444 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SYNE4-201ENST00000324444 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
SYNE4-201ENST00000324444 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNE4-201ENST00000324444 PROM2Q8N271 834 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNE4-201ENST00000324444 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNE4-201ENST00000324444 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SYNE4-201ENST00000324444 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.41■■□□□ 1.34
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