RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299563.4

RNF169-201, Transcript of ring finger protein 169, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF169, Length 7,823 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169-201ENST00000299563 SPATA32Q96LK8 384 aa20.38■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 UBXN4Q92575 508 aa20.38■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 STRN4Q9NRL3 753 aa20.38■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 MICALCLQ6ZW33 695 aa20.38■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 FERMT1Q9BQL6 677 aa20.37■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.37■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 CFAP100Q494V2 611 aa20.37■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.37■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 SIL1Q9H173 461 aa20.36■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.36■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 TSNARE1Q96NA8 513 aa20.36■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 CABP4P57796 275 aa20.36■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.36■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 NLRP6P59044 892 aa20.35■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 KIF5CO60282 957 aa20.35■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.35■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.35■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 WDR70Q9NW82 654 aa20.35■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 CCDC175P0C221 793 aa20.35■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 LRP2BPQ9P2M1 347 aa20.35■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.34■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 SPECC1Q5M775 1068 aa20.33■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.33■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 GCC1Q96CN9 775 aa20.33■□□□□ 0.85
RNF169-201ENST00000299563 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.33■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 ABCC8Q09428 1581 aa20.32■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 C6orf163Q5TEZ5 329 aa20.32■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.32■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 FSD2A1L4K1 749 aa20.32■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 FAM107BQ9H098 131 aa20.32■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.32■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.32■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 MYL6BP14649 208 aa20.31■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 RAI14Q9P0K7 980 aa20.31■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.3■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.3■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 ZSCAN12O43309 604 aa20.3■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 PAFAH1B1P43034 410 aa20.3■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 KRT32Q14532 448 aa20.3■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 RAB34Q9BZG1 259 aa20.3■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa20.3■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 LMAN1P49257 510 aa20.29■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.29■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 MPNDQ8N594 471 aa20.29■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 TIGD1Q96MW7 591 aa20.29■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 DAAM2Q86T65 1068 aa20.29■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 CETN1Q12798 172 aa20.29■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 LRRC45Q96CN5 670 aa20.28■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.27■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa20.27■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 IKBKGQ9Y6K9 419 aa20.27■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.27■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.27■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 PTPN14Q15678 1187 aa20.27■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 CUL5Q93034 780 aa20.27■□□□□ 0.84
RNF169-201ENST00000299563 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.27■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.27■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.26■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.26■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 MAP3K11Q16584 847 aa20.26■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 KIF18AQ8NI77 898 aa20.26■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.26■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.26■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.25■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 WDR78Q5VTH9 848 aa20.25■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 AACSQ86V21 672 aa20.25■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.25■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.25■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.25■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 TNNT1P13805 278 aa20.24■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.24■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
RNF169-201ENST00000299563 MTHFSP49914 203 aa20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.8 ms