RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 MLECQ14165 292 aa21.39■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 MCTP1Q6DN14 999 aa21.38■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.38■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.37■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 CLEC17AQ6ZS10 378 aa21.37■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 RTL1A6NKG5 1358 aa21.37■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.37■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 PTMSP20962 102 aa21.37■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 KLHL40Q2TBA0 621 aa21.37■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.37■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.36■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.36■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.36■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 NASPP49321 788 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.35■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 CHL1O00533 1208 aa21.34■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.34■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 SOX12O15370 315 aa21.34■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 NUTM2FA1L443 756 aa21.33■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
PDE4A-201ENST00000293683 C3P01024 1663 aa21.32■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 F6X3S4 739 aa21.32■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.32■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 LMBRD1Q9NUN5 540 aa21.32■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 SLC4A2P04920 1241 aa21.31■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.31■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 G2E3Q7L622 706 aa21.31■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.3■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 FOXO3O43524 673 aa21.3■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 NUCB2P80303 420 aa21.3■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.29■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.29■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.28■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC173Q0VFZ6 552 aa21.28■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.28■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 CASC1Q6TDU7 716 aa21.28■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 PPP1R9BQ96SB3 815 aa21.28■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 ST18O60284 1047 aa21.27■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 PTPRCP08575 1304 aa21.27■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 AKAP12Q02952 1782 aa21.27■■□□□ 1
PDE4A-201ENST00000293683 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 ITSN1Q15811 1721 aa21.26■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 KIAA0232Q92628 1395 aa21.26■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 GPT2Q8TD30 523 aa21.26■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.26■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.25■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF445P59923 1031 aa21.25■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 TSPOAP1O95153 1857 aa21.25■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 CRB1P82279 1406 aa21.25■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 ERC2O15083 957 aa21.24■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 REC8O95072 547 aa21.24■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 PDE1AP54750 535 aa21.24■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.24■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 RBSNQ9H1K0 784 aa21.24■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 PEAK1Q9H792 1746 aa21.24■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 ACEP12821 1306 aa21.23■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.23■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.22■□□□□ 0.99
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PDE4A-201ENST00000293683 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.21■□□□□ 0.99
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PDE4A-201ENST00000293683 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.21■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 NEK4P51957 841 aa21.21■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
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PDE4A-201ENST00000293683 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.21■□□□□ 0.99
PDE4A-201ENST00000293683 HMMRO75330 724 aa21.2■□□□□ 0.98
PDE4A-201ENST00000293683 PALD1Q9ULE6 856 aa21.2■□□□□ 0.98
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PDE4A-201ENST00000293683 NECTIN2Q92692 538 aa21.19■□□□□ 0.98
PDE4A-201ENST00000293683 TMX3Q96JJ7 454 aa21.19■□□□□ 0.98
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM63CQ9P1W3 806 aa21.19■□□□□ 0.98
PDE4A-201ENST00000293683 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.18■□□□□ 0.98
PDE4A-201ENST00000293683 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
PDE4A-201ENST00000293683 AGLP35573 1532 aa21.17■□□□□ 0.98
PDE4A-201ENST00000293683 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa21.17■□□□□ 0.98
PDE4A-201ENST00000293683 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.17■□□□□ 0.98
PDE4A-201ENST00000293683 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.17■□□□□ 0.98
PDE4A-201ENST00000293683 SYCE3A1L190 88 aa21.16■□□□□ 0.98
PDE4A-201ENST00000293683 DIP2BQ9P265 1576 aa21.16■□□□□ 0.98
PDE4A-201ENST00000293683 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.16■□□□□ 0.98
PDE4A-201ENST00000293683 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.16■□□□□ 0.98
PDE4A-201ENST00000293683 GNAI2P04899 355 aa21.15■□□□□ 0.98
PDE4A-201ENST00000293683 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PDE4A-201ENST00000293683 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
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