RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289382.7

CNOT11-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT11, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11-201ENST00000289382 MBIPQ9NS73 344 aa23.09■■□□□ 1.29
CNOT11-201ENST00000289382 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CNOT11-201ENST00000289382 NUTM2FA1L443 756 aa23.08■■□□□ 1.29
CNOT11-201ENST00000289382 MCM5P33992 734 aa23.08■■□□□ 1.29
CNOT11-201ENST00000289382 RABEP1Q15276 862 aa23.08■■□□□ 1.29
CNOT11-201ENST00000289382 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CNOT11-201ENST00000289382 SASS6Q6UVJ0 657 aa23.07■■□□□ 1.28
CNOT11-201ENST00000289382 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CNOT11-201ENST00000289382 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.07■■□□□ 1.28
CNOT11-201ENST00000289382 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CNOT11-201ENST00000289382 GPT2Q8TD30 523 aa23.06■■□□□ 1.28
CNOT11-201ENST00000289382 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CNOT11-201ENST00000289382 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CNOT11-201ENST00000289382 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CNOT11-201ENST00000289382 CCDC39Q9UFE4 941 aa23.04■■□□□ 1.28
CNOT11-201ENST00000289382 KRT24Q2M2I5 525 aa23.04■■□□□ 1.28
CNOT11-201ENST00000289382 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.03■■□□□ 1.28
CNOT11-201ENST00000289382 CPS1P31327 1500 aa23.03■■□□□ 1.28
CNOT11-201ENST00000289382 LRSAM1Q6UWE0 723 aa23.02■■□□□ 1.28
CNOT11-201ENST00000289382 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.02■■□□□ 1.28
CNOT11-201ENST00000289382 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.01■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.01■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.01■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 SYCE3A1L190 88 aa23.01■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.01■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 PIK3R4Q99570 1358 aa23.01■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 REREQ9P2R6 1566 aa23.01■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 PTCH1Q13635 1447 aa23.01■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 ARHGAP45Q92619 1136 aa23■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF428Q96B54 188 aa23■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 ATP7BP35670 1465 aa23■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 SOX12O15370 315 aa22.99■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF853P0CG23 659 aa22.99■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.99■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 ABCC4O15439 1325 aa22.99■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 COG3Q96JB2 828 aa22.98■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.97■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.97■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 GNAI1P63096 354 aa22.97■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 USP26Q9BXU7 913 aa22.97■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 IFT57Q9NWB7 429 aa22.97■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 RNF214Q8ND24 703 aa22.96■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.96■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.96■■□□□ 1.27
CNOT11-201ENST00000289382 TTC22Q5TAA0 569 aa22.95■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 DLC1Q96QB1 1528 aa22.95■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.94■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.94■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 CFAP44Q96MT7 982 aa22.94■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 MCM10Q7L590 875 aa22.94■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 ST18O60284 1047 aa22.93■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.93■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.93■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 DIP2BQ9P265 1576 aa22.92■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 DMTNQ08495 405 aa22.92■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.92■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.91■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 DCTPP1Q9H773 170 aa22.91■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.91■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 PLEKHG5O94827 1062 aa22.91■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.9■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 MBD3O95983 291 aa22.9■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.9■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.89■■□□□ 1.26
CNOT11-201ENST00000289382 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CNOT11-201ENST00000289382 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CNOT11-201ENST00000289382 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CNOT11-201ENST00000289382 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CNOT11-201ENST00000289382 APBB1O00213 710 aa22.89■■□□□ 1.25
CNOT11-201ENST00000289382 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CNOT11-201ENST00000289382 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CNOT11-201ENST00000289382 SDSP20132 328 aa22.88■■□□□ 1.25
CNOT11-201ENST00000289382 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CNOT11-201ENST00000289382 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CNOT11-201ENST00000289382 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.87■■□□□ 1.25
CNOT11-201ENST00000289382 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.87■■□□□ 1.25
CNOT11-201ENST00000289382 TSPY26PQ9H489 355 aa22.87■■□□□ 1.25
CNOT11-201ENST00000289382 TSC1Q92574 1164 aa22.86■■□□□ 1.25
CNOT11-201ENST00000289382 FOXO3O43524 673 aa22.86■■□□□ 1.25
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.7 ms