RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 FAM182BQ5T319 152 aa23.01■■□□□ 1.27
SRSF1-201ENST00000258962 CDCA7LQ96GN5 454 aa23■■□□□ 1.27
SRSF1-201ENST00000258962 EXOC5O00471 708 aa22.99■■□□□ 1.27
SRSF1-201ENST00000258962 IL2RBP14784 551 aa22.99■■□□□ 1.27
SRSF1-201ENST00000258962 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.99■■□□□ 1.27
SRSF1-201ENST00000258962 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SRSF1-201ENST00000258962 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SRSF1-201ENST00000258962 IL13P35225 146 aa22.98■■□□□ 1.27
SRSF1-201ENST00000258962 NGEFQ8N5V2 710 aa22.97■■□□□ 1.27
SRSF1-201ENST00000258962 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.97■■□□□ 1.27
SRSF1-201ENST00000258962 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.96■■□□□ 1.27
SRSF1-201ENST00000258962 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.95■■□□□ 1.26
SRSF1-201ENST00000258962 NBPF4Q96M43 638 aa22.95■■□□□ 1.26
SRSF1-201ENST00000258962 DISP2A7MBM2 1401 aa22.94■■□□□ 1.26
SRSF1-201ENST00000258962 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SRSF1-201ENST00000258962 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SRSF1-201ENST00000258962 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.92■■□□□ 1.26
SRSF1-201ENST00000258962 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.92■■□□□ 1.26
SRSF1-201ENST00000258962 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SRSF1-201ENST00000258962 GOLGA2Q08379 1002 aa22.91■■□□□ 1.26
SRSF1-201ENST00000258962 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.91■■□□□ 1.26
SRSF1-201ENST00000258962 FCHSD2O94868 740 aa22.9■■□□□ 1.26
SRSF1-201ENST00000258962 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SRSF1-201ENST00000258962 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SRSF1-201ENST00000258962 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SRSF1-201ENST00000258962 TRIM37O94972 964 aa22.89■■□□□ 1.26
SRSF1-201ENST00000258962 FKBP8Q14318 412 aa22.89■■□□□ 1.26
SRSF1-201ENST00000258962 WWC1Q8IX03 1113 aa22.89■■□□□ 1.26
SRSF1-201ENST00000258962 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.89■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.88■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 NEFLP07196 543 aa22.88■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 LRRC37A3O60309 1634 aa22.88■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 SLFN5Q08AF3 891 aa22.87■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 CCDC27Q2M243 656 aa22.87■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.87■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 EP400Q96L91 3159 aa22.87■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 TNS2Q63HR2 1409 aa22.87■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 NEUROD2Q15784 382 aa22.87■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 EYA1Q99502 592 aa22.87■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.86■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.86■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.86■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 HMOX1P09601 288 aa22.86■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 PRKAR2BP31323 418 aa22.86■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 BAG6P46379 1132 aa22.86■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.84■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.83■■□□□ 1.25
SRSF1-201ENST00000258962 APBA3O96018 575 aa22.82■■□□□ 1.24
SRSF1-201ENST00000258962 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.82■■□□□ 1.24
SRSF1-201ENST00000258962 MEGF6O75095 1541 aa22.81■■□□□ 1.24
SRSF1-201ENST00000258962 E9PSI1 815 aa22.81■■□□□ 1.24
SRSF1-201ENST00000258962 WDR63Q8IWG1 891 aa22.81■■□□□ 1.24
SRSF1-201ENST00000258962 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SRSF1-201ENST00000258962 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.8■■□□□ 1.24
SRSF1-201ENST00000258962 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.8■■□□□ 1.24
SRSF1-201ENST00000258962 BCL9O00512 1426 aa22.79■■□□□ 1.24
SRSF1-201ENST00000258962 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.79■■□□□ 1.24
SRSF1-201ENST00000258962 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.78■■□□□ 1.24
SRSF1-201ENST00000258962 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SRSF1-201ENST00000258962 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SRSF1-201ENST00000258962 SPG7Q9UQ90 795 aa22.77■■□□□ 1.24
SRSF1-201ENST00000258962 RIPK4P57078 832 aa22.77■■□□□ 1.24
SRSF1-201ENST00000258962 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.77■■□□□ 1.24
SRSF1-201ENST00000258962 NCAPD2Q15021 1401 aa22.76■■□□□ 1.23
SRSF1-201ENST00000258962 NFE2L2Q16236 605 aa22.76■■□□□ 1.23
SRSF1-201ENST00000258962 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.76■■□□□ 1.23
SRSF1-201ENST00000258962 KDRP35968 1356 aa22.75■■□□□ 1.23
SRSF1-201ENST00000258962 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.75■■□□□ 1.23
SRSF1-201ENST00000258962 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.75■■□□□ 1.23
SRSF1-201ENST00000258962 NEFMP07197 916 aa22.75■■□□□ 1.23
SRSF1-201ENST00000258962 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.75■■□□□ 1.23
SRSF1-201ENST00000258962 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.233e-19■■■□□ 14.9
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SRSF1-201ENST00000258962 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SRSF1-201ENST00000258962 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SRSF1-201ENST00000258962 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.72■■□□□ 1.23
SRSF1-201ENST00000258962 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.72■■□□□ 1.23
SRSF1-201ENST00000258962 SBF2Q86WG5 1849 aa22.7■■□□□ 1.23
SRSF1-201ENST00000258962 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
SRSF1-201ENST00000258962 CYP27B1O15528 508 aa22.7■■□□□ 1.22
SRSF1-201ENST00000258962 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SRSF1-201ENST00000258962 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SRSF1-201ENST00000258962 IL16Q14005 1332 aa22.7■■□□□ 1.22
SRSF1-201ENST00000258962 PLSCR1O15162 318 aa22.69■■□□□ 1.22
SRSF1-201ENST00000258962 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.68■■□□□ 1.22
SRSF1-201ENST00000258962 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SRSF1-201ENST00000258962 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.68■■□□□ 1.22
SRSF1-201ENST00000258962 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.67■■□□□ 1.22
SRSF1-201ENST00000258962 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.67■■□□□ 1.22
SRSF1-201ENST00000258962 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.66■■□□□ 1.22
SRSF1-201ENST00000258962 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.65■■□□□ 1.22
SRSF1-201ENST00000258962 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.64■■□□□ 1.22
SRSF1-201ENST00000258962 PHKG2P15735 406 aa22.63■■□□□ 1.21
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