RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM182BQ5T319 152 aa34.47■■■■□ 3.11
CAPNS1-201ENST00000246533 PDE3BQ13370 1112 aa34.47■■■■□ 3.11
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
CAPNS1-201ENST00000246533 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP2R1AP30153 589 aa34.42■■■■□ 3.1
CAPNS1-201ENST00000246533 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
CAPNS1-201ENST00000246533 EYA1Q99502 592 aa34.42■■■■□ 3.1
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
CAPNS1-201ENST00000246533 DISP2A7MBM2 1401 aa34.41■■■■□ 3.1
CAPNS1-201ENST00000246533 PARD3Q8TEW0 1356 aa34.4■■■■□ 3.1
CAPNS1-201ENST00000246533 WNK3Q9BYP7 1800 aa34.39■■■■□ 3.1
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT27Q7Z3Y8 459 aa34.38■■■■□ 3.09
CAPNS1-201ENST00000246533 IL2RBP14784 551 aa34.35■■■■□ 3.09
CAPNS1-201ENST00000246533 IL13P35225 146 aa34.35■■■■□ 3.09
CAPNS1-201ENST00000246533 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
CAPNS1-201ENST00000246533 RRP1P56182 461 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC37A3O60309 1634 aa34.34■■■■□ 3.09
CAPNS1-201ENST00000246533 DDB1Q16531 1140 aa34.33■■■■□ 3.09
CAPNS1-201ENST00000246533 MEGF6O75095 1541 aa34.33■■■■□ 3.09
CAPNS1-201ENST00000246533 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
CAPNS1-201ENST00000246533 AEBP1Q8IUX7 1158 aa34.3■■■■□ 3.08
CAPNS1-201ENST00000246533 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
CAPNS1-201ENST00000246533 DEKP35659 375 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
CAPNS1-201ENST00000246533 IGSF1Q8N6C5 1336 aa34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-201ENST00000246533 EXOC5O00471 708 aa34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-201ENST00000246533 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-201ENST00000246533 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-201ENST00000246533 RCAN3Q9UKA8 241 aa34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-201ENST00000246533 NCAPD2Q15021 1401 aa34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-201ENST00000246533 SOCS7O14512 581 aa34.26■■■■□ 3.08
CAPNS1-201ENST00000246533 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.07
CAPNS1-201ENST00000246533 MS4A1P11836 297 aa34.24■■■■□ 3.07
CAPNS1-201ENST00000246533 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa34.24■■■■□ 3.07
CAPNS1-201ENST00000246533 RGPD1P0DJD0 1748 aa34.23■■■■□ 3.07
CAPNS1-201ENST00000246533 SULT6B1Q6IMI4 303 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-201ENST00000246533 TNS2Q63HR2 1409 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-201ENST00000246533 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP34.22■■■■□ 3.074e-10■■■■□ 22.9
CAPNS1-201ENST00000246533 HMOX1P09601 288 aa34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-201ENST00000246533 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
CAPNS1-201ENST00000246533 TATP17735 454 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.06
CAPNS1-201ENST00000246533 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-201ENST00000246533 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-201ENST00000246533 SHANK3Q9BYB0 1731 aa34.17■■■■□ 3.06
CAPNS1-201ENST00000246533 CFAP53Q96M91 514 aa34.16■■■■□ 3.06
CAPNS1-201ENST00000246533 PTF1AQ7RTS3 328 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-201ENST00000246533 KAT6BQ8WYB5 2073 aa34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-201ENST00000246533 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM196AQ6ZSG2 479 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-201ENST00000246533 KDRP35968 1356 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM37O94972 964 aa34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP27B1O15528 508 aa34.1■■■■□ 3.05
CAPNS1-201ENST00000246533 EXOC6Q8TAG9 804 aa34.1■■■■□ 3.05
CAPNS1-201ENST00000246533 ACSBG1Q96GR2 724 aa34.08■■■■□ 3.05
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNQ2O43526 872 aa34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-201ENST00000246533 PKD1L3Q7Z443 1732 aa34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-201ENST00000246533 SBF2Q86WG5 1849 aa34.05■■■■□ 3.04
CAPNS1-201ENST00000246533 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
CAPNS1-201ENST00000246533 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP34.05■■■■□ 3.04
CAPNS1-201ENST00000246533 NBR1Q14596 966 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-201ENST00000246533 SPG7Q9UQ90 795 aa34.02■■■■□ 3.04
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa34.02■■■■□ 3.04
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa34.02■■■■□ 3.04
CAPNS1-201ENST00000246533 PDE4AP27815 886 aa34.01■■■■□ 3.04
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB132Q7Z7B7 95 aa34.01■■■■□ 3.04
CAPNS1-201ENST00000246533 BACH2Q9BYV9 841 aa34.01■■■■□ 3.04
CAPNS1-201ENST00000246533 RSPH6AQ9H0K4 717 aa34■■■■□ 3.03
CAPNS1-201ENST00000246533 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP34■■■■□ 3.03
CAPNS1-201ENST00000246533 PHACTR3Q96KR7 559 aa33.98■■■■□ 3.03
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKAR2BP31323 418 aa33.98■■■■□ 3.03
CAPNS1-201ENST00000246533 BCL9O00512 1426 aa33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-201ENST00000246533 PHKG2P15735 406 aa33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-201ENST00000246533 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
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CAPNS1-201ENST00000246533 IFNL2Q8IZJ0 200 aa33.93■■■■□ 3.02
CAPNS1-201ENST00000246533 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
CAPNS1-201ENST00000246533 DOT1LQ8TEK3 1739 aa33.93■■■■□ 3.02
CAPNS1-201ENST00000246533 APBA3O96018 575 aa33.92■■■■□ 3.02
CAPNS1-201ENST00000246533 AMOTQ4VCS5 1084 aa33.92■■■■□ 3.02
CAPNS1-201ENST00000246533 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
CAPNS1-201ENST00000246533 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC125Q86Z20 511 aa33.91■■■■□ 3.02
CAPNS1-201ENST00000246533 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa33.9■■■■□ 3.02
CAPNS1-201ENST00000246533 FCHSD2O94868 740 aa33.9■■■■□ 3.02
CAPNS1-201ENST00000246533 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
CAPNS1-201ENST00000246533 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
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CAPNS1-201ENST00000246533 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa33.88■■■■□ 3.01
CAPNS1-201ENST00000246533 NHSQ6T4R5 1651 aa33.88■■■■□ 3.01
CAPNS1-201ENST00000246533 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa33.87■■■■□ 3.01
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa33.86■■■■□ 3.01
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHF1Q96S99 279 aa33.85■■■■□ 3.01
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMTS8Q9UP79 889 aa33.85■■■■□ 3.01
CAPNS1-201ENST00000246533 CDCA7LQ96GN5 454 aa33.85■■■■□ 3.01
CAPNS1-201ENST00000246533 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
CAPNS1-201ENST00000246533 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
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