RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000152170.7

Pdss1-207, Transcript of Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdss1, Length 1,538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1-207ENSMUST00000152170 HypkQ9CR41 129 aa28.79■■■□□ 2.2
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa28.78■■■□□ 2.2
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gm7361D3Z6R1 267 aa28.78■■■□□ 2.2
Pdss1-207ENSMUST00000152170 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa28.78■■■□□ 2.2
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gm1979E9QAN3 267 aa28.78■■■□□ 2.2
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gm5862K7N5V5 267 aa28.78■■■□□ 2.2
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gm10220K7N660 267 aa28.78■■■□□ 2.2
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
Pdss1-207ENSMUST00000152170 PalmQ9Z0P4 383 aa28.78■■■□□ 2.2
Pdss1-207ENSMUST00000152170 PappaQ8R4K8 1624 aa28.77■■■□□ 2.2
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Nlrp6Q91WS2 869 aa28.76■■■□□ 2.19
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Phkg2Q9DB30 406 aa28.76■■■□□ 2.19
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Shank3Q4ACU6 1730 aa28.75■■■□□ 2.19
Pdss1-207ENSMUST00000152170 TnikP83510 1323 aa28.75■■■□□ 2.19
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Mcm10Q0VBD2 885 aa28.75■■■□□ 2.19
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Slc5a1Q8C3K6 665 aa28.75■■■□□ 2.19
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Klc3Q91W40 508 aa28.75■■■□□ 2.19
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa28.74■■■□□ 2.19
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Amotl1Q9D4H4 968 aa28.74■■■□□ 2.19
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Asic4Q7TNS7 539 aa28.74■■■□□ 2.19
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Pdzd9Q9D9M4 266 aa28.73■■■□□ 2.19
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ssfa2Q922B9 1252 aa28.72■■■□□ 2.19
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Tsen2Q6P7W5 460 aa28.71■■■□□ 2.19
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Kif23E9Q5G3 953 aa28.69■■■□□ 2.18
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Crb1Q8VHS2 1405 aa28.69■■■□□ 2.18
Pdss1-207ENSMUST00000152170 PsdQ5DTT2 1024 aa28.68■■■□□ 2.18
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Aox2Q5SGK3 1345 aa28.67■■■□□ 2.18
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Fam198bQ3UPI1 517 aa28.67■■■□□ 2.18
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa28.67■■■□□ 2.18
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Chmp7Q8R1T1 451 aa28.67■■■□□ 2.18
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ints5Q8CHT3 1018 aa28.66■■■□□ 2.18
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Akt1s1Q9D1F4 257 aa28.66■■■□□ 2.18
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa28.66■■■□□ 2.18
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Spef2Q8C9J3 1734 aa28.65■■■□□ 2.18
Pdss1-207ENSMUST00000152170 GsdmaQ9EST1 446 aa28.65■■■□□ 2.18
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gpr150Q8BL07 427 aa28.64■■■□□ 2.18
Pdss1-207ENSMUST00000152170 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Stk31Q99MW1 1018 aa28.63■■■□□ 2.17
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
Pdss1-207ENSMUST00000152170 En2P09066 324 aa28.59■■■□□ 2.17
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Igsf1Q7TQA1 1317 aa28.58■■■□□ 2.17
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Bicdl1A0JNT9 577 aa28.58■■■□□ 2.17
Pdss1-207ENSMUST00000152170 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Atg3Q9CPX6 314 aa28.57■■■□□ 2.16
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa28.55■■■□□ 2.16
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Nkx2-3P97334 362 aa28.54■■■□□ 2.16
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Q7TT23 1179 aa28.54■■■□□ 2.16
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Pcgf6Q99NA9 353 aa28.54■■■□□ 2.16
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Magea1O89006 320 aa28.53■■■□□ 2.16
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Magea5O89009 320 aa28.53■■■□□ 2.16
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Trpc5Q9QX29 975 aa28.53■■■□□ 2.16
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Magea2Q9R2A2 320 aa28.53■■■□□ 2.16
Pdss1-207ENSMUST00000152170 AtrnQ9WU60 1428 aa28.53■■■□□ 2.16
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Jmjd4Q8BFT6 427 aa28.53■■■□□ 2.16
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
Pdss1-207ENSMUST00000152170 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Fchsd2Q3USJ8 740 aa28.52■■■□□ 2.16
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cabp2Q9JLK4 216 aa28.52■■■□□ 2.16
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Iqcf3Q9D498 203 aa28.51■■■□□ 2.15
Pdss1-207ENSMUST00000152170 MeiocA2AG06 965 aa28.5■■■□□ 2.15
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Snap23O09044 210 aa28.5■■■□□ 2.15
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ccdc155Q80VJ8 648 aa28.49■■■□□ 2.15
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa28.49■■■□□ 2.15
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Trpm3Q5F4S9 1721 aa28.49■■■□□ 2.15
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Dcaf5Q80T85 946 aa28.48■■■□□ 2.15
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cap2Q9CYT6 476 aa28.48■■■□□ 2.15
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Q4VA45 678 aa28.46■■■□□ 2.15
Pdss1-207ENSMUST00000152170 IncenpQ9WU62 880 aa28.46■■■□□ 2.15
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa28.45■■■□□ 2.15
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Jdp2P97875 163 aa28.44■■■□□ 2.14
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gm13023A2A8N2 498 aa28.43■■■□□ 2.14
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Kcnq2Q9Z351 759 aa28.43■■■□□ 2.14
Pdss1-207ENSMUST00000152170 NppbP40753 121 aa28.43■■■□□ 2.14
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa28.43■■■□□ 2.14
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Exoc6Q8R313 802 aa28.43■■■□□ 2.14
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Emilin1Q99K41 1017 aa28.43■■■□□ 2.14
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Smarcc1P97496 1104 aa28.42■■■□□ 2.14
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
Pdss1-207ENSMUST00000152170 ErfeQ6PGN1 340 aa28.42■■■□□ 2.14
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Abcc12Q80WJ6 1366 aa28.41■■■□□ 2.14
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Miga2Q8BK03 593 aa28.39■■■□□ 2.14
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Sos1Q62245 1319 aa28.39■■■□□ 2.14
Pdss1-207ENSMUST00000152170 AceP09470 1312 aa28.38■■■□□ 2.13
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Apaf1O88879 1249 aa28.37■■■□□ 2.13
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ubxn2bQ0KL01 331 aa28.37■■■□□ 2.13
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Atf7ipQ7TT18 1306 aa28.37■■■□□ 2.13
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Efcab2Q9CQ46 164 aa28.36■■■□□ 2.13
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ric1Q69ZJ7 1422 aa28.36■■■□□ 2.13
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa28.35■■■□□ 2.13
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Msl1Q6PDM1 616 aa28.35■■■□□ 2.13
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Chrna2Q91X60 512 aa28.35■■■□□ 2.13
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Sumf1Q8R0F3 372 aa28.33■■■□□ 2.13
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Spata31d1bE9QA57 1361 aa28.32■■■□□ 2.12
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Col23a1Q8K4G2 532 aa28.32■■■□□ 2.12
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Mrs2Q5NCE8 434 aa28.31■■■□□ 2.12
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 77.7 ms