RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027592.5

Ubxn4-201, Transcript of UBX domain-containing protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubxn4, Length 4,113 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Evc2Q8K1G2 1220 aa16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Eif4a2P10630 407 aa16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Fmn2Q9JL04 1578 aa16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ubap1lG3UW59 384 aa16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 EvcP57680 1005 aa16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tmem132eQ6IEE6 982 aa16.52■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 LifrP42703 1092 aa16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ubxn4Q8VCH8 506 aa16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 IbspQ61711 324 aa16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rasa1E9PYG6 1038 aa16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Wdr78E9PYY5 807 aa16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Hoxb7P09024 217 aa16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Prim1P20664 417 aa16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Samm50Q8BGH2 469 aa16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Hoxa7P02830 229 aa16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cct4P80315 539 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nphp4P59240 1425 aa16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Fam135bQ9DAI6 1403 aa16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Fbxo2Q80UW2 297 aa16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 KdrP35918 1367 aa16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm10093D3YYI8 482 aa16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccdc155Q80VJ8 648 aa16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ttc19Q8CC21 365 aa16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Kcnh5Q920E3 988 aa16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rhot2Q8JZN7 620 aa16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Krt82Q99M74 516 aa16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gabpb2P81069 414 aa16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 GnpatP98192 678 aa16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Znf692Q3U381 531 aa16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mast1Q9R1L5 1570 aa16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pik3r4Q8VD65 1358 aa16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Irgm2A0A140LIF8 407 aa16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Naip7Q9JIB3 1402 aa16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Lrrc7Q80TE7 1490 aa16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Map3k4O08648 1597 aa16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pprc1Q6NZN1 1644 aa16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Zap70P43404 618 aa16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 TnmdQ9EP64 317 aa16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cep57l1Q8VDS7 400 aa16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gtf2a1Q99PM3 378 aa16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pnmal2G3X9N3 661 aa16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Krt85Q9Z2T6 507 aa16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Kif3aP28741 701 aa16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Fsd1Q7TPM6 496 aa16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mctp1E9PV86 951 aa16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Abl1P00520 1123 aa16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pdia3P27773 505 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Agtpbp1Q641K1 1218 aa16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 CalcaP70160 136 aa16.46■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Fkbp5Q64378 456 aa16.46■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccp110Q7TSH4 1004 aa16.46■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Stk38Q91VJ4 465 aa16.46■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 SphkapQ6NSW3 1687 aa16.46■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 ImpactO55091 318 aa16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 GpkowQ56A08 488 aa16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Drc7Q6V3W6 876 aa16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Amotl2Q8K371 772 aa16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tpm2P58774 284 aa16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Odf2lQ9D478 642 aa16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Il1rapl2Q9ERS6 686 aa16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gli2Q0VGT2 1544 aa16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Kif20aP97329 887 aa16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 OptnQ8K3K8 584 aa16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Skint5A7XUY5 1461 aa16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Taf3Q5HZG4 932 aa16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tubb6Q922F4 447 aa16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tmem94Q7TSH8 1360 aa16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 CenppQ9CZ92 286 aa16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Map3k19E9Q3S4 1311 aa16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rusc2Q80U22 1514 aa16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mcm3P25206 812 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Aifm3Q3TY86 605 aa16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Sytl4Q9R0Q1 673 aa16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Flad1Q8R123 492 aa16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nsd3Q6P2L6 1439 aa16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Med4Q9CQA5 270 aa16.43■□□□□ 0.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9.5 ms