RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 VPS35Q96QK1 796 aa26.38■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 OR2AG1Q9H205 316 aa26.38■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 UBP1Q9NZI7 540 aa26.38■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.814e-7■■■□□ 16.4
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ODC1-204ENST00000446285 A6NCN8 305 aa26.37■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 CHUKO15111 745 aa26.37■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 VEGFDO43915 354 aa26.37■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 THRAP10827 490 aa26.37■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 HLA-DPA1P20036 260 aa26.37■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 MAPK10P53779 464 aa26.37■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 FAM182AQ5T1J6 154 aa26.37■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 TMEM71Q6P5X7 295 aa26.37■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 PID1Q7Z2X4 250 aa26.37■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 ZNF567Q8N184 647 aa26.37■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 KRT35Q92764 455 aa26.37■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 USP7Q93009 1102 aa26.37■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 EPB41L1Q9H4G0 881 aa26.37■■□□□ 1.81
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ODC1-204ENST00000446285 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa26.37■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 SPO11Q9Y5K1 396 aa26.37■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa26.36■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 SOWAHDA6NJG2 315 aa26.36■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 PRAMEF10O60809 474 aa26.36■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 EML2O95834 649 aa26.36■■□□□ 1.81
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ODC1-204ENST00000446285 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa26.36■■□□□ 1.81
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ODC1-204ENST00000446285 HAUS1Q96CS2 278 aa26.36■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 ZMYND15Q9H091 742 aa26.36■■□□□ 1.81
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ODC1-204ENST00000446285 CCDC66A2RUB6 948 aa26.35■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 KMOO15229 486 aa26.35■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 CSF2RBP32927 897 aa26.35■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP26.35■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 PTPN7P35236 360 aa26.35■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 NOMO1Q15155 1222 aa26.35■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 SIRPB2Q5JXA9 342 aa26.35■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
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ODC1-204ENST00000446285 MRGPRX2Q96LB1 330 aa26.35■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 TIMM29Q9BSF4 260 aa26.35■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 PDP2Q9P2J9 529 aa26.35■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 RSPH14Q9UHP6 348 aa26.35■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa26.35■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa26.35■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa26.34■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 C9orf172C9J069 976 aa26.34■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
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ODC1-204ENST00000446285 PPFIA2O75334 1257 aa26.34■■□□□ 1.81
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ODC1-204ENST00000446285 BRSK1Q8TDC3 778 aa26.34■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 TAAR9Q96RI9 348 aa26.34■■□□□ 1.81
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ODC1-204ENST00000446285 FSD1LQ9BXM9 530 aa26.34■■□□□ 1.81
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ODC1-204ENST00000446285 KLC4Q9NSK0 619 aa26.34■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 H7C0C1 242 aa26.33■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 CTNNA2P26232 953 aa26.33■■□□□ 1.81
ODC1-204ENST00000446285 ATP5OP48047 213 aa26.33■■□□□ 1.81
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ODC1-204ENST00000446285 C19orf57Q0VDD7 668 aa26.33■■□□□ 1.81
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ODC1-204ENST00000446285 CDK14O94921 469 aa26.32■■□□□ 1.8
ODC1-204ENST00000446285 SPAM1P38567 509 aa26.32■■□□□ 1.8
ODC1-204ENST00000446285 GEMP55040 296 aa26.32■■□□□ 1.8
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ODC1-204ENST00000446285 NFATC2Q13469 925 aa26.32■■□□□ 1.8
ODC1-204ENST00000446285 GTF2H3Q13889 308 aa26.32■■□□□ 1.8
ODC1-204ENST00000446285 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
ODC1-204ENST00000446285 CRTC3Q6UUV7 619 aa26.32■■□□□ 1.8
ODC1-204ENST00000446285 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa26.32■■□□□ 1.8
ODC1-204ENST00000446285 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
ODC1-204ENST00000446285 TXLNBQ8N3L3 684 aa26.32■■□□□ 1.8
ODC1-204ENST00000446285 DDA1Q9BW61 102 aa26.32■■□□□ 1.8
ODC1-204ENST00000446285 OSBPL8Q9BZF1 889 aa26.32■■□□□ 1.8
ODC1-204ENST00000446285 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
ODC1-204ENST00000446285 GBA3Q9H227 469 aa26.32■■□□□ 1.8
ODC1-204ENST00000446285 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa26.32■■□□□ 1.8
ODC1-204ENST00000446285 BPIFA1Q9NP55 256 aa26.32■■□□□ 1.8
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