RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523985.5

CCNC-217, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCNC, Length 958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-217ENST00000523985 ARMC12Q5T9G4 340 aa14.57□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.57□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.57□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 PGBD5Q8N414 524 aa14.57□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 SCRN2Q96FV2 425 aa14.57□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 LGMNQ99538 433 aa14.57□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 DESI2Q9BSY9 194 aa14.57□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 NOD2Q9HC29 1040 aa14.57□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 PCDH12Q9NPG4 1184 aa14.57□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 CEP250Q9BV73 2442 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 A6NNZ2 444 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 PGLSO95336 258 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 RABIFP47224 123 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 NXPH1P58417 271 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 BNC1Q01954 994 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 AP1B1Q10567 949 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 SEL1L3Q68CR1 1132 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 TTC13Q8NBP0 860 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 KRT35Q92764 455 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 CENPTQ96BT3 561 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 HAUS1Q96CS2 278 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 SEMA3CQ99985 751 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 OSBPL8Q9BZF1 889 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 TM7SF3Q9NS93 570 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 SNX11Q9Y5W9 270 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 CFAP54Q96N23 3096 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 NUP205Q92621 2012 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 PSMD11O00231 422 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 FLRT2O43155 660 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 FZD6O60353 706 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 MMP20O60882 483 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 WNT1P04628 370 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 THEGLP0DJG4 465 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 MMP12P39900 470 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 CCT8P50990 548 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 DYNLT1P63172 113 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 FAM193AP78312 1265 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 PTK2BQ14289 1009 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 INAVAQ3KP66 663 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 CCDC181Q5TID7 509 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 KAZNQ674X7 775 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 DPPA4Q7L190 304 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 PIP4P1Q86T03 277 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 HES6Q96HZ4 224 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 ADGRE3Q9BY15 652 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 TRHDEQ9UKU6 1024 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 RAI2Q9Y5P3 530 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 A0A1B0GTQ1 180 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 KCNK1O00180 336 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 SPINT1O43278 529 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 CPP00450 1065 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 PYGMP11217 842 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 CD59P13987 128 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 ZNF30P17039 623 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 LIG3P49916 1009 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 MAXP61244 160 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 LRRC14Q15048 493 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 USP45Q70EL2 814 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 NLRP8Q86W28 1048 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 TRIM58Q8NG06 486 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 BMFQ96LC9 184 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 TEKT5Q96M29 485 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 SLC25A51Q9H1U9 297 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 CACNA1EQ15878 2313 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 WNT9AO14904 365 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 KCNK5O95279 499 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 MAP3K6O95382 1288 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 HLA-DQB2P05538 268 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 ELFN1P0C7U0 828 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 PRLRP16471 622 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 MARCKSL1P49006 195 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 CCZ1BP86790 482 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 FGL2Q14314 439 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 NOMO1Q15155 1222 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 CCDC70Q6NSX1 233 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-217ENST00000523985 NPNTQ6UXI9 565 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms