RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC35F3Q8IY50 421 aa26.39■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF653Q96CK0 615 aa26.39■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLPBQ9H078 707 aa26.39■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCINQ9Y6U3 715 aa26.39■■□□□ 1.82
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.81
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ISXQ2M1V0 245 aa26.38■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSWIM9Q86XI8 627 aa26.38■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HID1Q8IV36 788 aa26.38■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAT6Q93015 286 aa26.38■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM11Q96F44 468 aa26.38■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRORYQ9H606 182 aa26.38■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa26.38■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DOLKQ9UPQ8 538 aa26.38■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAI2Q9Y5P3 530 aa26.38■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASXL3Q9C0F0 2248 aa26.38■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1B0GTH6 734 aa26.37■■□□□ 1.81
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRKCGP05129 697 aa26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HCAR3P49019 387 aa26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF165P49910 485 aa26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HK3P52790 923 aa26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCL2L1Q07817 233 aa26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL10RBQ08334 325 aa26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INPP5AQ14642 412 aa26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NFATC4Q14934 902 aa26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AGERQ15109 404 aa26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELOCQ15369 112 aa26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PERM1Q5SV97 790 aa26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRTC1Q6UUV9 634 aa26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPWQ8N729 165 aa26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAF1Q8N7H5 531 aa26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APOOQ9BUR5 198 aa26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EDEM3Q9BZQ6 932 aa26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYO1AQ9UBC5 1043 aa26.37■■□□□ 1.81
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RASGRP1O95267 797 aa26.36■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYBL1P10243 752 aa26.36■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTSEP14091 401 aa26.36■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALG11Q2TAA5 492 aa26.36■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ENPP7Q6UWV6 458 aa26.36■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa26.36■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF248Q8NDW4 579 aa26.36■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRAMD1AQ96CP6 724 aa26.36■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LGMNQ99538 433 aa26.36■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR1A2Q9Y585 309 aa26.36■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CFAP69A5D8W1 941 aa26.35■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCCBP05166 539 aa26.35■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALPIP09923 528 aa26.35■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SKILP12757 684 aa26.35■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTM1Q13496 603 aa26.35■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPYSQ14117 519 aa26.35■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RD3Q7Z3Z2 195 aa26.35■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPACA3Q8IXA5 215 aa26.35■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LZTR1Q8N653 840 aa26.35■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATL2Q8NHH9 583 aa26.35■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ECHDC3Q96DC8 303 aa26.35■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZWILCHQ9H900 591 aa26.35■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PADI4Q9UM07 663 aa26.35■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa26.35■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCEA3O75764 348 aa26.34■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERPINC1P01008 464 aa26.34■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCK1P35558 622 aa26.34■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCNN1BP51168 640 aa26.34■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERVPABLB-1P60509 514 aa26.34■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRP54P61011 504 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TLE3Q04726 772 aa26.34■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LVRNQ6Q4G3 990 aa26.34■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR48Q8TAF3 677 aa26.34■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIC2Q96JB3 615 aa26.34■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR92Q96MX6 357 aa26.34■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GULP1Q9UBP9 304 aa26.34■■□□□ 1.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLQ9UEF7 1012 aa26.34■■□□□ 1.81
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