RNA–Protein interactions for RNA: YLR347W-A

YLR347W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR347W-A, Length 141 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR347W-AYLR347W-A PAM1P37304 830 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
YLR347W-AYLR347W-A DSE4P53753 1117 aa5.66□□□□□ -1.5
YLR347W-AYLR347W-A SVF1Q05515 481 aa5.66□□□□□ -1.5
YLR347W-AYLR347W-A TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
YLR347W-AYLR347W-A TY1A-DR6P0CX70 440 aa5.65□□□□□ -1.5
YLR347W-AYLR347W-A TY1A-ER1P0CX71 440 aa5.65□□□□□ -1.5
YLR347W-AYLR347W-A TY1A-LR2P0CX72 440 aa5.65□□□□□ -1.5
YLR347W-AYLR347W-A TY1A-PLP0CX73 440 aa5.65□□□□□ -1.5
YLR347W-AYLR347W-A TY1A-JR1P0CX74 440 aa5.65□□□□□ -1.5
YLR347W-AYLR347W-A TY1A-LR3P0CX75 440 aa5.65□□□□□ -1.5
YLR347W-AYLR347W-A TY1A-ML2P0CX76 440 aa5.65□□□□□ -1.5
YLR347W-AYLR347W-A PEP7P32609 515 aa5.65□□□□□ -1.5
YLR347W-AYLR347W-A EXO5P38289 585 aa5.65□□□□□ -1.5
YLR347W-AYLR347W-A PIC2P40035 300 aa5.65□□□□□ -1.5
YLR347W-AYLR347W-A GCV1P48015 400 aa5.65□□□□□ -1.5
YLR347W-AYLR347W-A UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
YLR347W-AYLR347W-A ELG1Q12050 791 aa5.65□□□□□ -1.5
YLR347W-AYLR347W-A TY1A-GR1Q12085 440 aa5.65□□□□□ -1.5
YLR347W-AYLR347W-A PHM7Q12252 991 aa5.65□□□□□ -1.5
YLR347W-AYLR347W-A TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
YLR347W-AYLR347W-A TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
YLR347W-AYLR347W-A MSH3P25336 1018 aa5.64□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A MAE1P36013 669 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A YKL077WP36081 392 aa5.64□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A PEX28P38848 579 aa5.64□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A BUD9P53226 547 aa5.64□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A PEX13P80667 386 aa5.64□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A ERS1P17261 260 aa5.63□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A FAR11P53917 953 aa5.63□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A MEC3Q02574 474 aa5.63□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A GAS5Q08193 484 aa5.63□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A SEC23P15303 768 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A SFA1P32771 386 aa5.62□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A ARL1P38116 183 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A ICP55P40051 511 aa5.62□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A YGL140CP53120 1219 aa5.62□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A NOP7P53261 605 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A YMR187CQ03236 431 aa5.62□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A YDR215CQ12240 137 aa5.62□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A YLL054CQ12244 843 aa5.62□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A YPR053CQ6Q5F3 151 aa5.62□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A AI3P03877 415 aa5.61□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A NAP1P25293 417 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A NEM1P38757 446 aa5.61□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A YMR074CQ04773 145 aa5.61□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A HEM13P11353 328 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A VMA4P22203 233 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A YCK2P23292 546 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A PET112P33893 541 aa5.6□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A RDH54P38086 958 aa5.6□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A XKS1P42826 600 aa5.6□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A PRY1P47032 299 aa5.6□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A TAF13P11747 167 aa5.59□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A MNR2P35724 969 aa5.59□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A REI1P38344 393 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A SLS1P42900 643 aa5.59□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A MTR4P47047 1073 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A KIP3P53086 805 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
YLR347W-AYLR347W-A SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data5.58□□□□□ -1.52not detected
YLR347W-AYLR347W-A RSC6P25632 483 aa5.58□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A SKN7P38889 622 aa5.58□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A NCE103P53615 221 aa5.58□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A UTP5Q04177 643 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A YOR223WQ12015 292 aa5.58□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A PUS1Q12211 544 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A GCR1P07261 785 aa5.57□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A MET10P39692 1035 aa5.57□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A GNP1P48813 663 aa5.57□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A ARI1P53111 347 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A HDA2Q06629 674 aa5.57□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A MRL1Q06815 381 aa5.57□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A TAT1P38085 619 aa5.56□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A ALG6Q12001 544 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A REC8Q12188 680 aa5.56□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A CDC34P14682 295 aa5.55□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A CLN2P20438 545 aa5.55□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A MAD1P40957 749 aa5.55□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A SPO74P45819 413 aa5.55□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A ENT3P47160 408 aa5.55□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A SIW14P53965 281 aa5.55□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A VPS16Q03308 798 aa5.55□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A DOT1Q04089 582 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A AVO1Q08236 1176 aa5.55□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A RTT10Q08924 1013 aa5.55□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A PIN2Q12057 282 aa5.55□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A DUT1P33317 147 aa5.54□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A ADD66P36040 267 aa5.54□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A ATG14P38270 344 aa5.54□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A YGR045CP53229 120 aa5.54□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A RKM2Q03942 479 aa5.54□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A EST2Q06163 884 aa5.54□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A GPT2P36148 743 aa5.53□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A YAR028WP39548 234 aa5.53□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A HXT13P39924 564 aa5.53□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A HXT17P53631 564 aa5.53□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A HXT15P54854 567 aa5.53□□□□□ -1.52
YLR347W-AYLR347W-A ELA1P53861 379 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.6 ms